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2012 年度 実績報告書

形態形成ダイナミクスのマルチスケールメカノバイオロジー解析手法の構築

公募研究

研究領域ミクロからマクロへ階層を超える秩序形成のロジック
研究課題/領域番号 23127506
研究機関京都大学

研究代表者

井上 康博  京都大学, 再生医科学研究所, 准教授 (80442929)

研究期間 (年度) 2011-04-01 – 2013-03-31
キーワードメカノバイオロジー / 形態形成 / シミュレーション / マルチスケール / 発生・分化
研究実績の概要

本研究課題では、形態形成過程に見られる組織階層における多細胞間の協調によるダイナミクスと細胞階層の力場・細胞変形との関連、さらに細胞変形によって生じる分子階層の力学-生化学変換について、アクチン細胞骨格系の力学-生化学連成を中心に、階層間接続するマルチスケールメカノバイオロジーの解析手法の構築を目指している。本年度は、以下の成果を得た。
(1)分子スケール:アクチンフィラメントに対する張力負荷は、フィラメント内のアミノ酸残基の位置を一様に変化させるのではなく、特定のアミノ酸残基群からなる立体構造を変化させることがわかった。そのようなアミノ酸残基群には、張力感受的な相互作用変調が実験的に示唆されているタンパク質との結合ドメインが含まれていたことから、張力感受の分子実体に迫る重要な知見が得られたと考えられる。(2)分子集団・細胞スケール:アクチン-ミオシン間相互作用の張力感受性を数理モデル化し、1分子レベルの張力感受性から分子集団・細胞レベルの張力感受的な構造適応が生じる仕組をシミュレーションにより示した。分子から細胞に至る階層を超えた力感受のロジックに繋がる重要な成果である。(3)組織スケール:形態形成の多細胞動態を表すために前年度に構築した数理モデル(RNRモデル)を用いて、形態形成に必須の細胞活動である細胞増殖の数理モデルを構築した。構築したモデルによるシミュレーションから、細胞レベルの特性量である細胞分裂軸の変調が組織レベルの成長過程における形状変化に与える影響を解析することができるようになり、細胞から組織に至る組織形状構築に関するロジック抽出に必要不可欠のメカノバイオロジー手法を構築することに成功した。以上の成果を査読英文誌(4報)において発表した。

現在までの達成度 (段落)

24年度が最終年度であるため、記入しない。

今後の研究の推進方策

24年度が最終年度であるため、記入しない。

  • 研究成果

    (21件)

すべて 2013 2012 その他

すべて 雑誌論文 (4件) (うち査読あり 4件) 学会発表 (16件) (うち招待講演 4件) 備考 (1件)

  • [雑誌論文] Apical contractility in growing epithelium supports robust maintenance of smooth curvatures against cell-division-induced mechanical disturbance2013

    • 著者名/発表者名
      Satoru Okuda, Yasuhiro Inoue, Mototsugu Eiraku, Yoshiki Sasai, Taiji Adachi
    • 雑誌名

      Journal of Biomechanics

      巻: 未定 ページ: 未定

    • DOI

      in press

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Modeling cell proliferation for simulating three-dimensional tissue morphogenesis based on a reversible network reconnection framework2013

    • 著者名/発表者名
      Satoru Okuda, Yasuhiro Inoue, Mototsugu Eiraku, Yoshiki Sasai, Taiji Adachi
    • 雑誌名

      Biomechanics and Modeling in Mechanobiology

      巻: 未定 ページ: 未定

    • DOI

      10.1007/s10237-012-0458-8

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Role of the actin-myosin catch bond on actomyosin aggregate formation2013

    • 著者名/発表者名
      Yasuhiro Inoue, Taiji Adachi
    • 雑誌名

      Cellular and Molecular Bioengineering

      巻: 6 ページ: 3-12

    • DOI

      10.1007/s12195-012-0265-4

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Reversible network reconnection model for simulating large deformation in dynamic tissue morphogenesis2012

    • 著者名/発表者名
      Satoru Okuda, Yasuhiro Inoue, Mototsugu Eiraku, Yoshiki Sasai, Taiji Adachi
    • 雑誌名

      Biomechanics and Modeling in Mechanobiology

      巻: 未定 ページ: 未定

    • DOI

      10.1007/s10237-012-0430-7

    • 査読あり
  • [学会発表] Biomechanical Simulation of Tissue Morphogenesis Based on Multicellular Interactions2013

    • 著者名/発表者名
      Taiji Adachi, Satoru Okuda, Yasuhiro Inoue
    • 学会等名
      International Symposium on Bio Medical Engineering Interface
    • 発表場所
      東北大学
    • 年月日
      2013-03-14 – 2013-03-15
    • 招待講演
  • [学会発表] リバーシブル・ネットワーク・リコネクションモデルに基づく組織形態形成シミュレーションのための細胞増殖の数理モデル化2013

    • 著者名/発表者名
      奥田 覚,井上 康博,永樂 元次,笹井 芳樹,安達 泰治
    • 学会等名
      日本機械学会第25回バイオエンジニアリング講演会
    • 発表場所
      産業技術総合研究所(つくば)
    • 年月日
      2013-01-09 – 2013-01-11
  • [学会発表] 分子動力学法を用いたアクチンフィラメントの張力感受に関わるアミノ酸残基群の力学的挙動の検討2013

    • 著者名/発表者名
      近藤 由章, 井上 康博, 安達 泰治
    • 学会等名
      日本機械学会第25回バイオエンジニアリング講演会
    • 発表場所
      産業技術総合研究所(つくば)
    • 年月日
      2013-01-09 – 2013-01-11
  • [学会発表] マルチースケール多細胞力学系シミュレーション2012

    • 著者名/発表者名
      井上 康博
    • 学会等名
      日本応用数理学会数理医学研究部会第30回数理医学セミナー
    • 発表場所
      大阪大学
    • 年月日
      2012-12-25 – 2012-12-25
    • 招待講演
  • [学会発表] 形態形成ダイナミクスのマルチスケール計算メカノバイオロジー2012

    • 著者名/発表者名
      井上康博,安達泰治
    • 学会等名
      第4回マイクロ・ナノ工学シンポジウム
    • 発表場所
      北九州市
    • 年月日
      2012-10-22 – 2012-10-24
  • [学会発表] 分子動力学法を用いたアクチンフィラメントの張力感受に関わるアミノ酸残基群の力学的挙動の検討2012

    • 著者名/発表者名
      近藤 由章, 井上 康博, 安達 泰治
    • 学会等名
      第4回マイクロ・ナノ工学シンポジウム
    • 発表場所
      北九州市
    • 年月日
      2012-10-22 – 2012-10-24
  • [学会発表] 分子動力学法によるコフィリン修飾アクチンフィラメントの平衡化シミュレーション2012

    • 著者名/発表者名
      藤井 徹矢, 井上 康博, 安達 泰治
    • 学会等名
      日本機械学会第23回バイオフロンティア講演会
    • 発表場所
      弘前市
    • 年月日
      2012-10-05 – 2012-10-06
  • [学会発表] 骨梁リモデリングにおけるシグナル伝達機構の数理モデル化2012

    • 著者名/発表者名
      竹中 健太郎, 井上 康博, 安達 泰治
    • 学会等名
      日本機械学会第23回バイオフロンティア講演会
    • 発表場所
      弘前市
    • 年月日
      2012-10-05 – 2012-10-06
  • [学会発表] Large Deformation of Multicellular Tissues during Morphogenesis Using Reversible Network Reconnection Model2012

    • 著者名/発表者名
      Satoru Okuda, Yasuhiro Inoue, Mototsugu Eiraku, Yoshiki Sasai, and Taiji Adachi
    • 学会等名
      Exciting Biologies: Forces in Biology
    • 発表場所
      アイルランド
    • 年月日
      2012-10-04 – 2012-10-06
  • [学会発表] Molecular dynamics model of cofilactin filament2012

    • 著者名/発表者名
      Tetsuya Fujii, Yasuhiro Inoue, Taiji Adachi
    • 学会等名
      第50回日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      名古屋大学
    • 年月日
      2012-09-22 – 2012-09-24
  • [学会発表] Simulations of large deformation during tissue morphogenesis using reversible network reconnection model2012

    • 著者名/発表者名
      Satoru Okuda, Yasuhiro Inoue, Mototsugu Eiraku, Yoshiki Sasai, Taiji Adachi
    • 学会等名
      第50回日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      名古屋大学
    • 年月日
      2012-09-22 – 2012-09-24
  • [学会発表] Molecular Dynamics Simulation of Actin Filament2012

    • 著者名/発表者名
      Yasuhiro Inoue, Shinji Matsushita, Taiji Adachi
    • 学会等名
      KSME-JSME Joint Symposium on CM CAE 2012
    • 発表場所
      金沢大学
    • 年月日
      2012-09-12 – 2012-09-12
    • 招待講演
  • [学会発表] 分子動力学法を用いたアクチンフィラメント内サブユニットの力学的挙動の検討2012

    • 著者名/発表者名
      近藤 由章, 松下 慎二, 井上 康博, 安達 泰治
    • 学会等名
      日本機械学会2012年度年次大会
    • 発表場所
      金沢大学
    • 年月日
      2012-09-10 – 2012-09-12
  • [学会発表] Rearrangement dynamics of contractile actomyosin networks2012

    • 著者名/発表者名
      Yasuhiro Inoue, Shunsuke Tsuda, Koji Nakagawa, Masaki Hojo, Taiji Adachi
    • 学会等名
      10th World Congress on Computational Mechanics
    • 発表場所
      ブラジル
    • 年月日
      2012-07-08 – 2012-07-13
  • [学会発表] Mathematical model for large deformations of multiple-cell aggregate during tissue morphogenesis2012

    • 著者名/発表者名
      Satoru Okuda, Yasuhiro Inoue, Mototsugu Eiraku, Yoshiki Sasai, Taiji Adachi
    • 学会等名
      10th World Congress on Computational Mechanics
    • 発表場所
      ブラジル
    • 年月日
      2012-07-08 – 2012-07-13
  • [学会発表] Mechanical Behavior of Actin Filaments under Tension: A Molecular Dynamics Simulation Study2012

    • 著者名/発表者名
      Taiji Adachi, Shinji Matsushita, Yashihiro Inoue
    • 学会等名
      10th International Symposium on Biomechanics and Biomedical Engineering
    • 発表場所
      ドイツ
    • 年月日
      2012-04-11 – 2012-04-14
    • 招待講演
  • [備考] 京都大学教育活動データベース

    • URL

      http://kyouindb.iimc.kyoto-u.ac.jp/j/lS2qY

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公開日: 2018-02-02  

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