| 研究実績の概要 |
マイマイカブリのゲノム塩基配列を決定するために，粟島産亜種アオマイマイカブリ１雄から抽出したゲノムDNAを用い，イルミナHiSeq2000を180 bpと500 bpのペアエンドライブラリーのシーケンスデータ（ゲノムサイズの188×），PacBio RSを用いたシーケンスデータ（ゲノムサイズの34×）を得た．HiSeq2000のデータについてはSOAPdenovo, SGA, ALLPATHS-LGを用いてアセンブリを試みた．得られたゲノム配列について予備的に既知の昆虫の遺伝子データベースおよびAUGUSTUSを用いたgene predictionを行った．HiSeq2000データ単独でのアセンブリには限界があるため，HiSeq2000データを参照してLSC，PacBioToCAでエラー補正したPacBioのシーケンスデータをHiSeq2000データと合わせてアセンブリすることを試みた．
本研究に関連して，今年度は，佐渡島亜種と粟島亜種の戻し交雑に基づく，亜種間形態変異に関する量的遺伝解析の結果を論文として発表し，またマイマイカブリのゲノムサイズを論文として報告した．また，形態分化の適応基盤に関して，２つの採餌形態間のトレードオフに関する解析を行い，論文を投稿した．さらに，日本列島におけるマイマイカブリの形態の地理的分化について，Ornstein-Uhlenbeck modelを用いた系統比較法解析を行い，論文を投稿した．この研究では，隔離された島だけでなく，本州内の地域間でも，体形に適応的分化が起こっていることが示唆された．
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