アロ認証関連遺伝子の進化遺伝学的解析

2013 年度 実績報告書

• 研究領域: 動植物に共通するアロ認証機構の解明
• 研究課題/領域番号: 24112702
• 研究機関: 東北大学
• 研究代表者: 田宮 元 東北大学, 東北メディカル・メガバンク機構, 教授 (10317745)
• 研究期間 (年度): 2012-04-01 – 2014-03-31
• キーワード: 細胞・組織 / CD9 / Izumo / 配偶子認識 / 生殖 / 進化遺伝学

研究概要

本研究の研究目標は、CD9 のように当該特別推進研究領域で取得されているアロ認証に関連する遺伝子の塩基配列をTajima のD や非同義置換率と同義置換率の比ω、Fay とWu のH のような進化遺伝学的統計量を用いて評価して、その特有の進化的パターンを探り、それらの知見から、アロ認証にどのような中核原理が可能であるのか予言するというものである。平成25年度中には、CD9とIZUMO1を代表例として、1000人ゲノムプロジェクトからDNAバリエーションデータを取得し、TajimaのDとω（dN/dS）を計測したところ、CD9はD<<0かつω<1と強い純化淘汰の対象にあるが、IZUMO1はむしろω>1と迅速進化の対象となっていることが示された。興味深いことに、更なる調査で、IZUMO1がヒト集団中で高度のCNV多型領域のひとつであることが判明し、その他にもかなりの数の生殖関連遺伝子がCNV領域中にあって、実際のヒト集団でコピー数多型を示すことが分かった。このようなゲノム浮動が、今後、アロ認証関連遺伝子の進化メカニズムに興味深い示唆を与えるものであると期待される。

現在までの達成度 (区分)

理由

25年度が最終年度であるため、記入しない。

今後の研究の推進方策

25年度が最終年度であるため、記入しない。

研究成果

• [雑誌論文] Divergence of East Asians and Europeans Estimated Using Male- and Female-Specific Genetic Markers. (2014)
  • 著者名/発表者名: Tateno Y, Komiyama T, Katoh T, Munkhbat B, Haida Y,Kobayashi H, Tamiya G, Inoko H.
  • 雑誌名: Genome Biol Evol 巻: 6 ページ: 466-473
  • DOI: 10.1093/gbe/evu027
  • 査読あり
• [雑誌論文] A pollen coat-inducible autoinhibited Ca2+-ATPase expressed in stigmatic papilla cell is required for compatible pollination in the Brassicaceae. (2014)
  • 著者名/発表者名: Iwano M, Igarashi M, Tarutani Y, Kaothien-Nakayama P, Nakayama H, Moriyama H, Yakabe R, Entani T, Shimosato-Asano H, Ueki M, Tamiya G, Takayama S
  • 雑誌名: Plant Cell 巻: 26 ページ: 636-649
  • DOI: 10.1105/tpc.113.121350
  • 査読あり
• [雑誌論文] Pleiotropic Effect of Common Variants at ABO Glycosyltranferase Locus in 9q32 on Plasma Levels of Pancreatic Lipase and Angiotensin Converting Enzyme. (2014)
  • 著者名/発表者名: Yamagata University Genomic Cohort Consortium
  • 雑誌名: PLoS ONE 巻: 9 ページ: e55903
  • DOI: 10.1371/journal.pone.0055903
  • 査読あり
• [雑誌論文] Variants in melanogenesis-related genes associate with skin cancer risk among Japanese populations. (2014)
  • 著者名/発表者名: Yoshizawa J, Abe Y, Oiso N, Fukai K, Hozumi Y, Nakamura T, Narita T, Motokawa T, Wakamatsu K, Ito S, Kawada A, Tamiya G, Suzuki T
  • 雑誌名: J Dermatol 巻: 41 ページ: 296-302
  • DOI: 10.1111/1346-8138.12432
  • 査読あり
• [雑誌論文] Gamete Attachment Requires GEX2 for Successful Fertilization in Arabidopsis. (2014)
  • 著者名/発表者名: Mori T, Igawa T, Tamiya G, Miyagishima SY, Berger F.
  • 雑誌名: Curr Biol 巻: 24 ページ: 170-175
  • DOI: 10.1016/j.cub.2013.11.030
  • 査読あり
• [雑誌論文] Case of a Mongolian child with extensive Mongolian spots in Mucopolysaccharidosis type VI: Identification of a novel mutation in the arylsulfatase B gene. (2013)
  • 著者名/発表者名: Okamura K, Munkhbat B, Bachimeg B, Tamiya G, Hozumi Y, Suzuki T.
  • 雑誌名: J Dermatol 巻: 40 ページ: 758-759
  • DOI: 10.1111/1346-8138.12237
  • 査読あり
• [雑誌論文] Comparison of caregiver strain in Parkinson's disease between Yamagata, Japan, and Maryland, The United States. (2013)
  • 著者名/発表者名: Tanji H, Koyama S, Wada M, Kawanami T, Kurita K, Tamiya G, Saito N, Suzuki K, Kato T, Anderson KE, Gruber-Baldini AL, Fishman PS, Reich SG, Weiner WJ, Shulman LM.
  • 雑誌名: Parkinsonism Relat Disord 巻: 19 ページ: 628-633
  • DOI: 10.1016/j.parkreldis.2013.02.014
  • 査読あり
• [雑誌論文] The confounding effect of cryptic relatedness for environmental risks of systolic blood pressure on cohort studies. (2013)
  • 著者名/発表者名: Shibata K, Hozawa A, Tamiya G, Ueki M, Nakamura T, et al.
  • 雑誌名: Mol Genet Genomic Med 巻: 1 ページ: 45-53
  • DOI: 10.1002/mgg3.4
  • 査読あり
• [雑誌論文] A founder haplotype of APOE-Sendai mutation associated with lipoprotein glomerulopathy. (2013)
  • 著者名/発表者名: Toyota K, Hashimoto T, Ogino D, Matsunaga A, Ito M, Masakane I, Degawa N, Sato H, Shirai S, Umetsu K, Tamiya G, Saito T, Hayasaka K.
  • 雑誌名: J Hum Genet 巻: 58 ページ: 254-258
  • DOI: 10.1038/jhg
  • 査読あり
• [学会発表] アロ認証関連遺伝子の進化遺伝学的解析 (2014)
  • 著者名/発表者名: 田宮 元
  • 学会等名: 第8回領域会議
  • 発表場所: 名古屋市
  • 年月日: 20140108-20140108
• [学会発表] アロ認証関連遺伝子の進化遺伝学的解析 (2013)
  • 著者名/発表者名: 田宮 元
  • 学会等名: 第7回領域会議
  • 発表場所: 松江市
  • 年月日: 20130601-20130603