ＲＮＡ分解を介した核局在型高分子非コードＲＮＡ作用マシナリーの制御機構の解明

2012 年度 実績報告書

• 研究領域: 非コードＲＮＡ作用マシナリー
• 研究課題/領域番号: 24115706
• 研究機関: 東京大学
• 研究代表者: 秋光 信佳 東京大学, アイソトープ総合センター, 准教授 (40294962)
• 研究期間 (年度): 2012-04-01 – 2014-03-31
• キーワード: RNA分解

研究実績の概要

本研究の目的は、哺乳動物細胞における核内高分子非コードRNAの分解経路を明らかにすると共に、高分子非コードRNAの機能制御におけるRNA分解の生理的意義を明らかにすることである。この目的を達成するため、(1)各種の核局在型高分子非コードRNA（HOTAIR, ANRIL, MALAT1, NEAT1など）の分解制御にかかわる新規タンパク質の系統的ノックダウンスクリーニングを実施する。ノックダウンスクリーニングでは、small hairpin RNA (shRNA) 発現ライブラリーを使用する。さらに、(2)核内RNA分解経路が高分子非コードRNAの機能調節に重要な役割を担っているかについて多角的に検討する。既に、パラスペックルタンパク質PSFが核局在型高分子非コードRNAであるNEAT1の分解制御機構にかかわることを示唆する知見を得ている。また、 NEAT1の安定化がパラスペックルの構造と機能に影響することも見出している。これらの知見は、核内高分子非コードRNAには固有の特異的RNA分解経路が存在し、さらに、RNA分解は核内高分子非コードRNAの機能制御を担うとする考えを支持する結果である。本年度は、スクリーニングを900遺伝子以上について実施し、スプライシング因子がNEAT１の安定性制御に関与していることを発見した。

現在までの達成度 (区分)

2: おおむね順調に進展している

理由

当初予定とほぼ同程度の研究進展があるため。

今後の研究の推進方策

平成25年度では、平成24年度に同定した新規の核内RNA分解因子の機能解析を中心に研究を展開する。具体的には、核内RNA分解因子の細胞内局在解析、分子間相互作用解析（標的RNA、及びnuclease等との相互作用）、変異体を用いた構造活性相関解析（機能ドメインの同定）、刺激依存的な局在変化や翻訳後修飾変化の有無の解析、などを実施する。また、分解標的となる核内高分子非コードRNAの機能（エピジェネティック制御など）がRNA分解によって制御されるかを調べる。以上の解析から、核内高分子非コードRNAの分解機構の分子基盤を明らかにするとともに、その核内RNA分解の生理的意義についても明らかにすることを目指す。