• 研究課題をさがす
  • 研究者をさがす
  • KAKENの使い方
  1. 課題ページに戻る

2012 年度 実績報告書

アメーバに共生する難培養性細菌のゲノム解析から紐解くマトリョーシカ進化原理

公募研究

研究領域マトリョーシカ型進化原理
研究課題/領域番号 24117501
研究機関北海道大学

研究代表者

山口 博之  北海道大学, 大学院保健科学研究院, 教授 (40221650)

研究期間 (年度) 2012-04-01 – 2014-03-31
キーワードアメーバ共生細菌 / クラミジア / 難培養性細菌 / エフェクター / 原始細菌 / ゲノム解読
研究実績の概要

微生物間の共生機構の解明研究は、個々の微生物の進化や生態さらに病原体と私達の体を構成する細胞とのせめぎ合いを通して起こる病態形成機構を知る上で極めて重要である。そこで私達は土壌や水系環境に普遍的に生息するアカント・アメーバ(アメーバ)に共生する難培養性細菌に着目し、自然環境から難培養性細菌が持続的に感染するアメーバ株の樹立し共生細菌の特徴について検討してきた。特に興味深い難培養性細菌は原始的な姿を留めたクラミジアであり、それらに焦点を絞り研究を進めている。平成24年度は株化したアメーバに共生する原始クラミジア(Neochlamydia S13)のゲノム解読を次世代シークエンサーにより行い、そのドラフトゲノムより共生や宿主細胞の修飾に関わる遺伝子やそのユニークな構造を探索し詳細に解析した。その結果、ゲノム構造は既に知られている原始クラミジアProtochlamydia UWE25(Science, 2004)と大きく異なり、Neochlamydia S13のゲノム構造は極めてユニークであり、TCAサイクルが欠落しそれに伴い呼吸鎖の多くの遺伝子が脱落してることを見つけた。興味深いことに原始クラミジアは通常IV型分泌装置をコードする遺伝子クラスターを保持しているが、Neochlamydia S13にはその構造が認められなかった。また私達はこのNeochlamydia S13ゲノム上に多数の蛋白蛋白相互作用に関わると予想されるロイシンrichリピートやアンキリンドメインを持つ新規機能候補分子や膜貫通領域を複数持つエフェクター分子候補を見つけた。さらに通常クラミジアには認められない多数のトランスポゾンをコードする遺伝子を発見した。現在DNAマイクロアレイ解析により発現遺伝子のプロファイリングを行っている。これらの研究成果は現在論文化するとともに投稿準備を進めている。

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

2: おおむね順調に進展している

理由

次世代シークエンサーよる解読で原始クラミジア(Neochlamydia S13)のドラフトゲノムを得た。そのゲノムの解析から概要で述べたように以下の点が明らかになった。1. Neochlamydia S13のゲノム構造は極めてユニークであり、TCAサイクルが欠落しそれに伴い呼吸鎖の多くの遺伝子が脱落してることを見つけたこと。2. Neochlamydia S13ゲノム上に多数の蛋白蛋白相互作用に関わると予想されるロイシンrichリピートやアンキリンドメインを持つ機能候補分子や膜貫通領域を複数持つエフェクター分子候補を見つけたこと。3. IV型分泌装置が欠落していること。4. Neochlamydia S13ゲノム上に通常クラミジアには認められない多数のトランスポゾンをコードする遺伝子を発見したこと。これらの研究成果が得られたことより本申請研究が"おおむね順調に伸展している"と判断した。

今後の研究の推進方策

平成25年度交付申請を辞退するため、記入しない。

  • 研究成果

    (17件)

すべて 2013 2012

すべて 雑誌論文 (6件) (うち査読あり 6件) 学会発表 (11件) (うち招待講演 2件)

  • [雑誌論文] Protochlamydia induces apoptosis of human HEp-2 cells through mitochondrial dysfunction mediated by chlamydial protease-like activity factor2013

    • 著者名/発表者名
      Matsuo J, Nakamura S, Ito A, Yamazaki T, Ishida K, Hayashi Y, Yoshida M, Takahashi K, Sekizuka T, Takeuchi F, Kuroda M, Nagai H, Hayashida K, Sugimoto C, Yamaguchi H
    • 雑誌名

      PLoS ONE

      巻: 8 ページ: e56005

    • DOI

      10.1371/journal.pone.0056005

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Chlamydophila pneumoniae in human immortal Jurkat cells and primary lymphocytes uncontrolled by interferon-γ2013

    • 著者名/発表者名
      Ishida K, Kubo T, Saeki A, Yamane C, Matsuo J, Yimin, Nakamura S, Hayashi Y, Kunichika M, Yoshida M, Takahashi K, Hirai I, Yamamoto Y, Shibata K, Yamaguchi H
    • 雑誌名

      Microbes Infect

      巻: 15 ページ: 192-200

    • DOI

      10.1016/j.micinf.2012.11.006

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Effect of the steroid receptor antagonist RU486 (mifepristone) on an IFNγ-induced persistent Chlamydophila pneumoniae infection model in epithelial HEp-2 cells2013

    • 著者名/発表者名
      Ishida K, Yamazaki T, Motohashi K, Kobayashi M, Matsuo J, Osaki T, Hanawa T, Kamiya S, Yamamoto Y, Yamaguchi H
    • 雑誌名

      J Infect Chemother

      巻: 18 ページ: 22-29

    • DOI

      10.1007/s10156-011-0274-6

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Ciliates expel environmental Legionella-laden pellets to stockpile food2012

    • 著者名/発表者名
      Hojo F, Sato D, Matsuo J, Miyake M, Nakamura S, Kunichika M, Hayashi Y, Yoshida M, Takahashi K, Takemura H, Kamiya S, Yamaguchi H
    • 雑誌名

      Appl Environ Microbiol

      巻: 78 ページ: 5247-5257

    • DOI

      10.1128/AEM.00421-12

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Chlamydia trachomatis serovar L2 infection model using human lymphoid Jurkat cells2012

    • 著者名/発表者名
      Kubo T, Ishida K, Matsuo J, Nakamura S, Hayashi Y, Sakai H, Yoshida M, Takahashi K, Hirai I, Yamamoto Y, Yamaguchi H
    • 雑誌名

      Microb Pathog

      巻: 53 ページ: 1-11

    • DOI

      10.1016/j.micpath.2012.02

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Frequency of Chlamydia trachomatis in Ureaplasma-positive healthy women attending their first prenatal visit in a community hospital in Sapporo, Japan2012

    • 著者名/発表者名
      Yamazaki T, Matsumoto M, Matsuo J, Abe K, Minami K, Yamaguchi H
    • 雑誌名

      BMC Infect Dis

      巻: 12 ページ: 1-8

    • DOI

      10.1186/1471-2334-12-82

    • 査読あり
  • [学会発表] Ureaplasma parvumの存在はIFN-γ によるChlamydia trachomatis発育抑制効果を減弱させる2013

    • 著者名/発表者名
      山崎智拡 (山口博之)
    • 学会等名
      第86回日本細菌学会総会
    • 発表場所
      幕張メッセ (千葉市)
    • 年月日
      2013-03-18 – 2013-03-20
  • [学会発表] アメーバ共生細菌原始クラミジアは低温下にてヒト上皮細胞株HEp-2細胞内で増殖する2013

    • 著者名/発表者名
      山根千夏世 (山口博之)
    • 学会等名
      第86回日本細菌学会総会
    • 発表場所
      幕張メッセ (千葉市)
    • 年月日
      2013-03-18 – 2013-03-20
  • [学会発表] アメーバ共生難培養性細菌原始クラミジアの比較ゲノム解析2013

    • 著者名/発表者名
      山口博之 (山口博之)
    • 学会等名
      第86回日本細菌学会総会
    • 発表場所
      幕張メッセ (千葉市)
    • 年月日
      2013-03-18 – 2013-03-20
  • [学会発表] 原始クラミジアProtochlamydiaはchlamydial protease-like activity factor (CPAF) を介してヒト上皮系細胞株HEp-2 にアポトーシスを誘導する2013

    • 著者名/発表者名
      松尾淳司 (山口博之)
    • 学会等名
      第86回日本細菌学会総会
    • 発表場所
      幕張メッセ (千葉市)
    • 年月日
      2013-03-18 – 2013-03-20
  • [学会発表] クラミジア感染ヒトリンパ球細胞株Jurkat細胞内における遺伝子変化2013

    • 著者名/発表者名
      石田香澄 (山口博之)
    • 学会等名
      第86回日本細菌学会総会
    • 発表場所
      幕張メッセ (千葉市)
    • 年月日
      2013-03-18 – 2013-03-20
  • [学会発表] Amoebal endosymbiont primitive chlamydiae: a hint to uncover the intracellular survival strategy of human pathogenic chlamydiae2012

    • 著者名/発表者名
      Hiroyuki Yamaguchi
    • 学会等名
      The 11th Korea-Japan International Symposium on Microbiology
    • 発表場所
      ロッテリゾートホテル (Korea)
    • 年月日
      2012-09-13 – 2012-09-14
    • 招待講演
  • [学会発表] 原始クラミジア, それは病原性クラミジアの細胞内生存戦略を紐解くヒントである2012

    • 著者名/発表者名
      山口博之
    • 学会等名
      第30回日本クラミジア研究会
    • 発表場所
      国立感染症研究所 (東京都)
    • 年月日
      2012-09-08 – 2012-09-08
    • 招待講演
  • [学会発表] Parachlamydia acanthamoebae attachment to amoebae is required for several amoebal secreted molecules and serine-protease activity2012

    • 著者名/発表者名
      Hayashi Yasuhiro (Yamaguchi Hiroyuki)
    • 学会等名
      ASM 112th General Metting
    • 発表場所
      Moscone Center (USA)
    • 年月日
      2012-06-16 – 2012-06-19
  • [学会発表] Pathogenic Chlamydial Growth in Human Immortal Jurkat Lymphoid Cells Uncontrolled by Interferon-γ2012

    • 著者名/発表者名
      Kasumi Ishida (Hiroyuki Yamaguchi)
    • 学会等名
      ASM 112th General Metting
    • 発表場所
      Moscone Center (USA)
    • 年月日
      2012-06-16 – 2012-06-19
  • [学会発表] Prevalence of Chlamydia trachomatis and Ureaplasma species in healthy women2012

    • 著者名/発表者名
      Tomohiro Yamazaki (Hiroyuki Yamaguchi)
    • 学会等名
      ASM 112th General Metting
    • 発表場所
      Moscone Center (USA)
    • 年月日
      2012-06-16 – 2012-06-19
  • [学会発表] Environmental chlamydia, Protochlamydia induces caspase-dependent apoptosis to human immortal HEp-2 cells by triggering a mitochondrial pathway2012

    • 著者名/発表者名
      Junji Matsuo (Hiroyuki Yamaguchi)
    • 学会等名
      ASM 112th General Metting
    • 発表場所
      Moscone Center (USA)
    • 年月日
      2012-06-16 – 2012-06-19

URL: 

公開日: 2018-02-02  

サービス概要 検索マニュアル よくある質問 お知らせ 利用規程 科研費による研究の帰属

Powered by NII kakenhi