ゲノム解読によるパーキンソン病の選択的神経変性の解明

2013 年度 実績報告書

• 研究領域: シナプス・ニューロサーキットパソロジーの創成
• 研究課題/領域番号: 25110720
• 研究種目: 新学術領域研究(研究領域提案型)
• 研究機関: 神戸大学
• 研究代表者: 佐竹 渉 神戸大学, 医学(系)研究科(研究院), 助教 (50467594)
• 研究期間 (年度): 2013-04-01 – 2015-03-31
• キーワード: パーキンソン病 / エクソーム / 神経遺伝 / 神経内科学 / 人類遺伝学 / ゲノム医科学 / 孤発性神経疾患

研究概要

パーキンソン病は、シナプス病態と神経変性が発症・進展のキーとなる疾患である。本研究では、エクソーム解読などの先端ゲノムにより、患者ゲノムの全エクソン塩基配列を読みとき、孤発性パーキンソン病の強い発症リスクとなるrare variantの発見をめざす。シナプス関連遺伝子に着目して解析することにより、本症のシナプス病態をゲノムの視点から解明する。また、以前に報告したSNPによるゲノムワイド関連解析(Satake et al, Nature Genet 2009)を拡大した第2期ゲノムワイド関連解析で同定のパーキンソン病遺伝子もふくめ、モデル動物を作出。ゲノム的なアプローチで、孤発性パーキンソン病のシナプス・ニューロサーキットパソロジーの一端をあきらかにしたい。
本年度は、パーキンソン病患者ゲノムから、全エクソン配列を抽出し、エクソームライブラリを作成。これを次世代シークエンサーで解読する、エクソーム解読をおこなった。また、第2期ゲノムワイド関連解析で同定のパーキンソン病遺伝子について、ショウジョウバエモデルを作出し神経変性を再現した。

現在までの達成度 (区分)

2: おおむね順調に進展している

理由

ほぼ予定どおりに進んでいるため。

今後の研究の推進方策

今後は、パーキンソン病群と非患者群のエクソーム解読データを、シナプス関連遺伝子について着目して関連検定することにより、シナプス関連遺伝子の本症の病態への関与を明らかにする。

研究成果

• [雑誌論文] A case of Bardet-Biedl syndrome complicated with intracranial hypertension in a Japanese child (2014)
  • 著者名/発表者名: Saida K, Inaba Y, Hirano M, Satake W, Toda T, Suzuki Y, Sudo A, Noda S, Hidaka Y, Hirabayashi K, Imai H, Kurokawa T, Koike K.
  • 雑誌名: Brain Dev 巻: 36 ページ: 721-724
  • DOI: 10.1016/j.braindev.2013.10.013
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] YY1 binds to α-synuclein 3'-flanking region SNP and stimulates antisense noncoding RNA expression (2013)
  • 著者名/発表者名: Mizuta I et al
  • 雑誌名: J Hum Genet 巻: 58 ページ: 711-719
  • DOI: 10.1038/jhg.2013.90
  • 査読あり
• [雑誌論文] Mutations in COQ2 in familial and sporadic multiple-system atrophy (2013)
  • 著者名/発表者名: Mitsui J et al
  • 雑誌名: N Engl J Med 巻: 369 ページ: 233-244
  • DOI: 10.1056/NEJMoa1212115
  • 査読あり
• [雑誌論文] 神経・精神疾患の動向 神経疾患と遺伝子 (2013)
  • 著者名/発表者名: 佐竹 渉ら
  • 雑誌名: 日本医師会雑誌神経・精神疾患診療マニュアル 巻: 142 ページ: S38-39
• [雑誌論文] 遺伝性疾患の遺伝子検査 (2013)
  • 著者名/発表者名: 佐竹 渉
  • 雑誌名: Modern Physician 巻: 33 ページ: 625-628
• [雑誌論文] ゲノム多様性と神経変性疾患 (2013)
  • 著者名/発表者名: 佐竹 渉ら
  • 雑誌名: 細胞 巻: 45 ページ: 120-123
• [雑誌論文] ゲノムワイド関連解析からの知見とさらなる孤発性パーキンソン病遺伝子の発見へ向けて PARK16、BST1、α-synuclein、LRRK2、Tau (2013)
  • 著者名/発表者名: 佐竹 渉ら
  • 雑誌名: 医学のあゆみ 巻: 247 ページ: 1075-1078
• [学会発表] Exome sequencing of Parkinson's disease in order to identify genetic variants with high disease-risk (2014)
  • 著者名/発表者名: Satake W et al
  • 学会等名: New Frontier of Molecular Neuropathology
  • 発表場所: Tokyo, Japan
  • 年月日: 20140316-20140317
• [学会発表] Exome sequencing of Parkinson's disease in order to identify genetic variants with high disease-risk (2013)
  • 著者名/発表者名: Satake W et al
  • 学会等名: American Society of Human Genetics Annual meeting
  • 発表場所: Boston, USA
  • 年月日: 20131022-20131026
• [学会発表] エクソーム解読・一塩基多型解析によるパーキンソン病の遺伝背景の解明 (2013)
  • 著者名/発表者名: 佐竹渉ら
  • 学会等名: 2013年度包括脳ネットワーク夏のワークショップ
  • 発表場所: 名古屋
  • 年月日: 20130829-20130901
• [学会発表] Search for rare-variant risks of Parkinson’s disease by sequencing of candidate genes and exome sequencing (2013)
  • 著者名/発表者名: Satake W et al
  • 学会等名: The MDS 17th International Congress of Parkinson's Disease and Movement Disorders
  • 発表場所: Sydney, Australia
  • 年月日: 20130616-20130620
• [学会発表] 剖検脳を用いた孤発性パーキンソン病感受性遺伝子の解析 (2013)
  • 著者名/発表者名: 上田健博ら
  • 学会等名: 第54回日本神経学会学術大会
  • 発表場所: 東京
  • 年月日: 20130529-20130601
• [備考] 神戸大学神経内科
  • URL: http://www.med.kobe-u.ac.jp/im3/rinsyo/shinkei/index.html
• [備考] 神戸大学分子脳科学
  • URL: http://www.med.kobe-u.ac.jp/clgene/
• [備考] 神戸大学遺伝子診療部
  • URL: http://www.hosp.kobe-u.ac.jp/consultation/guide/department/idenshi.html