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2013 年度 実績報告書

システイン残基ユビキチン化修飾の分子基盤とペルオキシソームタンパク質輸送制御

公募研究

研究領域ユビキチンネオバイオロジー:拡大するタンパク質制御システム
研究課題/領域番号 25112518
研究種目

新学術領域研究(研究領域提案型)

研究機関九州大学

研究代表者

藤木 幸夫  九州大学, その他部局等, 特任教授 (70261237)

研究期間 (年度) 2013-04-01 – 2015-03-31
キーワードペルオキシソーム / ユビキチン化 / タンパク質輸送 / ペルオキシン
研究概要

本研究の目的は、新たな「ユビキチンコード」の一つといえる、Pex5pのN末領域に保存されたシステイン残基に対するチオエステル結合を介したモノユビキチン化修飾(Cys-Ub化と略)によるペルオキシソームマトリクスタンパク質輸送の制御機構を解明することである。本年度は、以下のA) およびB) の項目に関する研究成果の概略を記す。
A)Pex5pのCys-Ub化修飾の分子基盤:ペルオキシソーム欠損性CHO変異細胞のペルオキシソーム画分の解析から、3種RINGペルオキシンのうち、Pex10p (Miyataら, Traffic 2012)に加え、 Pex2pとPex12pもPex5pのCys-Ub化に必要であることを見出した。一方、リコンビナントRINGペルオキシンを用いたin vitroユビキチン化アッセイ系においては、Pex10p/Pex12p複合体がPex5pのLys残基をモノUb化する活性を検出したが、Pex5pのCys-Ub化はまだ再構成できていない。
B)Cys-Ub化修飾によるペルオキシソームマトリクスタンパク質輸送の制御機構:In vivoにおけるPex5pのユビキチン化修飾を解析する過程で、1) マトリクスタンパク質輸送に必須なペルオキシソーム膜上におけるPex5pのCys11のモノUb化に加え、2) 内在性Pex5pのLys残基のモノUb化、および3) 一過性に発現させたPex5pがペルオキシソーム非依存的に細胞質においてLys520のモノUb化修飾を受けることを見出した。さらに、Pex5pに対する異なる3種の様式のUb化修飾が、ペルオキシソームマトリクスタンパク質輸送を制御することを明らかにした。これらの成果を国際誌 Jounal of Biological Chemistryに公表した(Okumoto K., Noda H.,and Fujiki Y. J. Biol.Chem.in press, 2014 doi: 10.1074/jbc.M113.527937)。

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

2: おおむね順調に進展している

理由

Pex5pのCys-Ub化の分子機盤の解明のうち、E3についてはRINGペルオキシン3種である確証を得た。E3の使い分けやE2については、引き続きin vitroユビキチン化アッセイ系の確立を目指しつつ解析を行う。一方で、in vivoにおけるPex5pのユビキチン化修飾の解析の過程で、Cys-Ub化以外の2種のLys残基モノUb化を見出し、それぞれのペルオキシソームマトリクスタンパク質輸送における機能を明らかにすることができ、大きな進展が得られた。また、Pex5pのCys-Ub化に影響を及ぼす要因として、いくつかの細胞内環境変化を見出しつつあり、新たな展開が期待できる。

今後の研究の推進方策

リコンビナントタンパク質を用いたPex5p Cys-Ub化のin vitro再構成系の確立を引き続き目指しつつ、Pex5pのCys-Ub化に必要なE2の同定を進める。平成26年度研究計画に基づいて、Cys-Ub化Pex5pに結合する因子の検索などを行う。また、RNAi法によるノックダウンやIn vitro Pex5p輸送実験系、In vitro Ub化反応系、およびペルオキシソーム欠損性CHO細胞を用いたin vivoの実験を駆使して、Pex5pのCys-Ub化修飾によるPex5pのシャトリングおよびマトリクスタンパク質輸送の制御機構を解析する。

  • 研究成果

    (24件)

すべて 2014 2013 その他

すべて 雑誌論文 (7件) (うち査読あり 7件) 学会発表 (14件) (うち招待講演 3件) 図書 (3件)

  • [雑誌論文] Molecular basis for peroxisome biogenesis disorders2014

    • 著者名/発表者名
      *Fujiki, Y., Okumoto, K., Mukai, S., and Tamura, S.
    • 雑誌名

      In: Brocard, C. and Hartig, A. (eds) Molecular machines involved in peroxisome biogenesis and maintenance, Berlin, Springer-Verlag

      巻: N/A ページ: in press

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Molecular complex coordinating peroxisome morphogenesis in mammalian cells2014

    • 著者名/発表者名
      *Fujiki, Y., Itoyama, A., Abe, Y., and Honsho, M.
    • 雑誌名

      In: Brocard, C. and Hartig, A. (eds) Molecular machines involved in peroxisome biogenesis and maintenance, Berlin, Springer-Verlag

      巻: N/A ページ: in press

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Very-long-chain polyunsaturated fatty acids accumulate in phosphatidylcholine of fibroblasts from patients with Zellweger syndrome and acyl-CoA oxidase1 deficiency2014

    • 著者名/発表者名
      Abe, Y., Honsho, M., Nakanishi, H., Taguchi, R., and *Fujiki, Y.
    • 雑誌名

      Biochimica Biophysica Acta- Molecular and Cell Biollogy of Lipids

      巻: 1841 ページ: 610-619

    • DOI

      10.1016/j.bbalip.2014.01.001.

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Distinct modes of ubiquitination of peroxisome-targeting signal type 1 (PTS1)-receptor Pex5p regulate PTS1 protein import2014

    • 著者名/発表者名
      Okumoto, K., Noda, H., and *Fujiki, Y.
    • 雑誌名

      The Journal of Biological Chemistry

      巻: 289 ページ: in press

    • DOI

      10.1074/jbc.M113.527937.

    • 査読あり
  • [雑誌論文] System to quantify the import of peroxisomal matrix proteins by fluorescence intensity2013

    • 著者名/発表者名
      Noguchi, M., Okumoto, K., and *Fujiki, Y.
    • 雑誌名

      Genes to Cells

      巻: 18 ページ: 476-492

    • DOI

      10.1111/gtc.12051.

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Mff functions with Pex11pbeta and DLP1 in peroxisomal fission2013

    • 著者名/発表者名
      Itoyama, A., Michiyuki, S., Honsho, M., Yamamoto, T., Moser, A., Yoshida, Y., and *Fujiki, Y.
    • 雑誌名

      Biology Open

      巻: 2 ページ: 998-1006

    • DOI

      10.1242/bio.20135298.

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Topogenesis and homeostasis of fatty acyl-CoA reductase 12013

    • 著者名/発表者名
      Honsho, M., Asaoku, S., Fukumoto, K., and *Fujiki, Y.
    • 雑誌名

      The Journal of Biological Chemistry

      巻: 288 ページ: 34588-34598

    • DOI

      10.1074/jbc.M113.498345.

    • 査読あり
  • [学会発表] Biogenesis and assembly of peroxisomal proteins

    • 著者名/発表者名
      Yukio Fujiki
    • 学会等名
      EMBO conference: Protein transport systems:From Structure to Function (開催期間: April 13-17, 2013)
    • 発表場所
      Dubrovnik, Croatia
    • 招待講演
  • [学会発表] Peroxisome Membrane Biogenesis in Mammals

    • 著者名/発表者名
      Yukio Fujiki
    • 学会等名
      ASBMB Special Symposia: The Multitasking Endoplasmic Reticulum in Health and Disease (開催期間: May 1-3, 2013)
    • 発表場所
      Airlie Center, Warrenton, Va, USA
    • 招待講演
  • [学会発表] ペルオキシソームタンパク質膜透過装置複合体の同定と膜透過メカニズム

    • 著者名/発表者名
      田村 茂彦、矢田裕人、藤木幸夫
    • 学会等名
      第86回日本生化学会大会 (開催期間: 2013年9月11-13日)
    • 発表場所
      パシフィコ横浜(横浜市)
  • [学会発表] ペルオキシソーム移行シグナル1型(PTS1)レセプターPex5pの新規結合因子、P5BP1の同定

    • 著者名/発表者名
      奥本 寛治、白濱友里、藤木幸夫
    • 学会等名
      第86回日本生化学会大会
    • 発表場所
      パシフィコ横浜(横浜市)
  • [学会発表] エーテルリン脂質プラスマローゲンによるコレステロール生合成の制御

    • 著者名/発表者名
      本庄 雅則、藤木幸夫
    • 学会等名
      第86回日本生化学会大会
    • 発表場所
      パシフィコ横浜(横浜市)
  • [学会発表] ペルオキシソーム形態異常による細胞内リン脂質代謝への影響解析

    • 著者名/発表者名
      阿部 雄一、本庄 雅則、石原 直忠、三原 勝芳、Ronald J.A. Wanders、藤木 幸夫
    • 学会等名
      第86回日本生化学会大会
    • 発表場所
      パシフィコ横浜(横浜市)
  • [学会発表] ヒト乳癌由来MCF-7細胞はプラスマローゲン合成不全細胞である

    • 著者名/発表者名
      高橋 公紀、本庄雅則、藤木幸夫
    • 学会等名
      第86回日本生化学会大会
    • 発表場所
      パシフィコ横浜(横浜市)
  • [学会発表] Direct targeting of membrane proteins to mammalian peroxisomes

    • 著者名/発表者名
      Yuqiong Liu, Yuichi Yagita, and Yukio Fujiki
    • 学会等名
      第86回日本生化学会大会
    • 発表場所
      パシフィコ横浜(横浜市)
  • [学会発表] 哺乳類ペキソファジーにおけるアダプタータンパク質の役割

    • 著者名/発表者名
      山下 俊一、藤木幸夫
    • 学会等名
      第86回日本生化学会大会
    • 発表場所
      パシフィコ横浜(横浜市)
  • [学会発表] Dynamic and functional assembly of the AAA peroxins, Pex1p and Pex6p, and their membrane receptor Pex26p in shuttling of PTS1-receptor Pex5p during peroxisome biogenesis

    • 著者名/発表者名
      Yukio Fujiki
    • 学会等名
      10th International Conference on AAA+ Proteins From Mechanisms and Disease to Targets (開催期間: September 15-19, 2013)
    • 発表場所
      Comundo Conference Center, Neuss, Germany
    • 招待講演
  • [学会発表] A novel AAA ATPase interacting with Pex7 modulates plasmalogen synthesis

    • 著者名/発表者名
      Hajime Niwa, Yasuhiro Miyauchi-Nanri, Masanori Honsho, and Yukio Fujiki
    • 学会等名
      10th International Conference on AAA+ Proteins From Mechanisms and Disease to Targets
    • 発表場所
      Comundo Conference Center, Neuss, Germany
  • [学会発表] RING peroxin complexes comprising Pex10p and Pex12p ubiquitinate the PTS1 receptor Pex5p and regulate its shuttling between peroxisomes and the cytosol

    • 著者名/発表者名
      Kanji Okumoto, Hiromi Noda, and Yukio Fujiki
    • 学会等名
      PerFuMe Kick-Off Conference on peroxisome biology (開催期間: December 1-4, 2013)
    • 発表場所
      Hampshire Plaza, Groningen, The Netherlands
  • [学会発表] Targeting pathway and signal of a novel peroxisomal tail-anchored proteins PMP55

    • 著者名/発表者名
      Yuichi Yagita, Yukio Fujiki
    • 学会等名
      第36回日本分子生物学会年会 (開催期間:2013年12月3-6日)
    • 発表場所
      神戸ポートアイランド(神戸市)
  • [学会発表] Identification of a novel protein interacting with peroxisome targeting signal type 1 (PTS1) receptor, Pex5p

    • 著者名/発表者名
      Yuri Shirahama, Kanji Okumoto, and Yukio Fujiki
    • 学会等名
      第36回日本分子生物学会年会
    • 発表場所
      神戸ポートアイランド(神戸市)
  • [図書] 医学のあゆみ 特集 「生命と脂質: 最新の研究と臨床」 Vol.248, No.13, ペルオキシソームの脂質代謝2014

    • 著者名/発表者名
      藤木 幸夫、 本庄 雅則
    • 総ページ数
      7
    • 出版者
      医歯薬出版
  • [図書] 細胞工学 8月号 特集:テイルアンカー型タンパク質の細胞内輸送と膜挿入機構~現代生物学に残された謎の一つがいま解かれる~Overview~2013

    • 著者名/発表者名
      藤木 幸夫
    • 総ページ数
      3
    • 出版者
      秀潤社
  • [図書] 細胞工学 8月号 特集:テイルアンカー型タンパク質の細胞内輸送と膜挿入機構~テイルアンカー型ペルオキシソームタンパク質の輸送機構2013

    • 著者名/発表者名
      八木田 悠一、 藤木 幸夫
    • 総ページ数
      6
    • 出版者
      秀潤社

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公開日: 2015-05-28  

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