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2013 年度 実績報告書

複合体構造解析による細菌毒素の標的結合タンパク質認識機構の解明

公募研究

研究領域細胞シグナリング複合体によるシグナル検知・伝達・応答の構造的基礎
研究課題/領域番号 25121733
研究種目

新学術領域研究(研究領域提案型)

研究機関京都産業大学

研究代表者

津下 英明  京都産業大学, 総合生命科学部, 教授 (40299342)

研究期間 (年度) 2013-04-01 – 2015-03-31
キーワードモノADPリボシル化 / SpvB / アクチン / C3 / RhoA / 翻訳後修飾 / 結晶構造解析 / ホスト認識
研究概要

多くの病原性細菌モノADPリボシル化毒素(ADPRT)を持ち、ヒトの重要な蛋白質を標的に修飾することで、その機能を不活性化する。我々はウエルシュ菌由来TypeIV ADPRTであるIaとアクチンの複合体構造を明らかにし、そのADPリボシル化を複合体結晶中でとらえることに成功している。(PNAS(2008),PNAS(2013))。この研究をさらに発展させる。1、サルモネラのマクロファージへの感染に重要で、生存に必須であるTypeIV ADPRT に属するSpvBの構造決定を目的とする。SpvB の活性部位ドメインであるC末端ドメインの構造は明らかになっているが、まだ未知の全長での構造決定を目的として、その発現精製と結晶化を行った。PEG4000を沈殿剤として用いて、大きさ50umのフットボール型の結晶が得られた。大きさと形ともに良くないが、その反射は4.5Å分解能まで得られて正方晶系であった。反射点のモザイク性は悪くなく、大きな結晶を用いればよいデータが得られる可能性は高い。現在この結晶の改良を続けている。2、TypeIII ADPRTのC3毒素は低分子量GタンパクRhoAのAsn41をADPリボシル化することでシグナル伝達を阻害する。C3毒素は生化学研究でRhoAの役割を調べるためによく使われてきたが、この修飾の分子レベルの構造は分かっていない。我々は今回、ADPリボシル化したRhoAの初めての構造を高い分解能:1.2Åで明らかにした。RhoAにおいてGTP型のon,GDP型のoffで大きなコンフォメーション変化を起こすswitchIループがあり、このswitchIループの端に、ADPリボシル化されるAsn41は存在する。立体構造に基づいて不活性化の機構を説明した。

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

2: おおむね順調に進展している

理由

1、SpvBの全長での構造決定するためには、まだ精製結晶化で工夫がいるが、すでに結晶が得られていることから、近いうちに十分構造決定可能と考えている。
2、我々のIaとアクチン複合体構造は、その反応を理解するために重要な1歩となった。TypeIII ADPRTのC3毒素とRhoA複合体構造を明らかにすることが、次の大きな目的であるが、ADPリボシル化したRhoAの構造を初めて明らかにしたことは、次のステップに進むためにも、非常に大きな意味がある。

今後の研究の推進方策

SpvBの全長での構造決定に向けて研究を進める。また、ADPリボシル化したRhoAの立体構造に基づいた不活性化の機構を説明するために、まだ構造生物学が関与できる欠けているピースがあり、それを埋めることが重要と考えている。

  • 研究成果

    (8件)

すべて 2014 2013 その他

すべて 雑誌論文 (2件) (うち査読あり 2件) 学会発表 (5件) (うち招待講演 1件) 備考 (1件)

  • [雑誌論文] Crystallization and preliminary X-ray diffraction studies of a surface mutant of the middle domain of PB2 from human influenza A (H1N1) virus2014

    • 著者名/発表者名
      Tsurumura T, Qiu H, Yoshida T, Tsumori Y, Tsuge H.
    • 雑誌名

      Acta Crystallogr F Struct Biol Commun.

      巻: 70 ページ: 72-75

    • DOI

      10.1107/S2053230X13032603

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Conformational Polymorphism of m(7)GTP in Crystal Structure of the PB2 Middle Domain from Human Influenza A Virus2013

    • 著者名/発表者名
      Tsurumura T, Qiu H, Yoshida T, Tsumori Y, Hatakeyama D, Kuzuhara T, Tsuge H.
    • 雑誌名

      PLoS One

      巻: 8(11) ページ: -

    • 査読あり
  • [学会発表] インンフルエンザウィルスRNAポリメラーゼ CAP結合とその構造2013

    • 著者名/発表者名
      鶴村俊治、秋こう、吉田徹、津守耶良、津下英明
    • 学会等名
      ビタミンB研究協議会
    • 発表場所
      ウインクあいち(名古屋)
    • 年月日
      20131102-20131102
  • [学会発表] 分解能決定におけるCChalf とR 値の関係性の考察2013

    • 著者名/発表者名
      江村晃太・吉田徹・津下英明
    • 学会等名
      日本結晶学会
    • 発表場所
      熊本大学(熊本)
    • 年月日
      20131012-20131012
  • [学会発表] ATPase,GTPaseを標的とした細菌毒素による翻訳後修飾の構造生物学2013

    • 著者名/発表者名
      津下英明
    • 学会等名
      日本女子大学「理学セミナー」
    • 発表場所
      日本女子大学(東京)
    • 年月日
      20131002-20131002
    • 招待講演
  • [学会発表] Substrate Selectivity of Monoacylglycerol Lipase based on the Crystal Structure2013

    • 著者名/発表者名
      T.Tsurumura and H.Tsuge
    • 学会等名
      Structural Life Science 7th International Conference on Structural Genomics
    • 発表場所
      京王プラザホテル(札幌)
    • 年月日
      20130729-20130801
  • [学会発表] Application of iota-toxin and actin complex crystal as the ADP-ribosylation reaction chamber2013

    • 著者名/発表者名
      T.Tsurumura and H.Tsuge
    • 学会等名
      International Symposium on Diffraction Structural Biology(ISDSB)
    • 発表場所
      吹上ホール(名古屋)
    • 年月日
      20130526-20130529
  • [備考] 京都産業大学 総合生命科学部 タンパク質構造生物学研究室

    • URL

      http://www.cc.kyoto-su.ac.jp/~tsuge/tsugelab/index.html

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公開日: 2015-05-28  

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