• 研究課題をさがす
  • 研究者をさがす
  • KAKENの使い方
  1. 課題ページに戻る

2013 年度 実績報告書

ゲノム変動を制御するクロマチン核内空間配置メカニズムの解明

公募研究

研究領域ゲノムアダプテーションのシステム的理解
研究課題/領域番号 25125703
研究種目

新学術領域研究(研究領域提案型)

研究機関東北大学

研究代表者

原田 昌彦  東北大学, (連合)農学研究科(研究院), 准教授 (70218642)

研究期間 (年度) 2013-04-01 – 2015-03-31
キーワードゲノム変動 / DNA損傷修復 / 細胞核 / クロマチン / アクチン関連タンパク質 / クロマチンリモデリング複合体
研究概要

生命がゲノムを安定に維持する上で、DNA二重鎖切断は大きな脅威である。そのため、核内では速やかにDNAを修復することが試みられる。しかし、修復が困難な場合には、ゲノムを大規模に組み換えて生存を図ることがあり、これによってゲノムアダプテーションが起こる。しかし、その機能については、不明な点が多い。我々は、出芽酵母をモデル系として、その機構の解明に取り組んでいる。これまでに、出芽酵母においてDNA二重鎖切断部位が、核膜タンパク質である核膜孔複合体とMps3タンパク質に結合することで、核膜近傍に移行することが報告されている。我々は、この機構に、SWR1クロマチンリモデリング複合体と、INO80クロマチンリモデリング複合体の両者が、異なった機構で関与することを明らかにした。さらに、核膜孔複合体とMps3が、DNA修復反応の進行や、正確な組み換え反応において、協調的に機能することを明らかにした。これらの結果は、クロマチンレベルと細胞核レベルのエピジェネティック制御が、ゲノムアダプテーションに関与することを示している。さらに、脊椎動物細胞を用いた解析によって、アクチン重合阻害剤を作用させた際に、DNA修復反応が低下することが示された。このことは、アクチン細胞骨格がDNA修復反応に関与していることを示している。細胞核内のアクチンがDNA修復に関与するかを明らかにするために、細胞核内でアクチンフィラメントを形成する系を構築し、今後これを実験に用いることとした。

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

2: おおむね順調に進展している

理由

DNA二重鎖切断部位が、細胞核内において核膜近傍に移行するメカニズムはほとんど不明であったが、我々の解析によってSWR1およびINO80クロマチンリモデリング複合体が、この機構に関与していることを明らかにすることができた。また、DNA二重鎖切断部位が核膜近傍に移行することの生物学的意義についても、核膜孔複合体とMps3が協調して、DNA修復の進行や、正確な組み換え反応に寄与することを明らかにすることができた。さらに、脊椎動物の核骨格とDNA損傷修復の関連を解析する実験系を開発した。

今後の研究の推進方策

DNA二重鎖切断修復に関するゲノムアダプテーションにおいて、SWR1およびINO80クロマチンリモデリング複合体が重要な役割を果たすことが示されたので、これらがどのような分子機構によって、このゲノムアダプテーションに関与するかを明らかにする。また、核膜孔複合体およびMps3が、DNA損傷修復のプロセスや、正確な組み明け反応にどのように関与するかについても、その分子機構を明らかにする。さらに、核内でのアクチン核骨格がDNA損傷修復やゲノムアダプテーションにどのように関与するかを明らかにするため、これまでに作成した核内アクチンフィラメントを形成する細胞を利用した解析を行う。

  • 研究成果

    (23件)

すべて 2014 2013 その他

すべて 雑誌論文 (4件) (うち査読あり 4件) 学会発表 (16件) (うち招待講演 3件) 図書 (2件) 備考 (1件)

  • [雑誌論文] Possible involvement of LKB1-AMPK signaling in non-homologous end joining.2014

    • 著者名/発表者名
      Ui, A., Ogiwara, H., Nakajima, S., Kanno, S., Watanabe, R., Harata, M., Okayama, H., Harris, C.C., Yokota, J., Yasui, A., and Kohno, T.
    • 雑誌名

      Oncogene

      巻: 33 ページ: 1640-1648

    • DOI

      10.1038/onc.2013.125

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Improvement of the transformation efficiency of Saccharomyces cerevisiae by altering carbon sources in pre-culture2014

    • 著者名/発表者名
      Konishi, T., et al.
    • 雑誌名

      Bioscience, Biotechnology and Biochemistry

      巻: in press ページ: in press

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Reorganization of Damaged Chromatin by the Exchange of Histone Variant H2A.Z-22014

    • 著者名/発表者名
      Nishibuchi, I., et al.
    • 雑誌名

      International Journal of Radiation Oncology, Biology, Physics

      巻: in press ページ: in press

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Structural polymorphism in the L1 loop regions of human H2A.Z.1 and H2A.Z.2.2013

    • 著者名/発表者名
      Horikoshi N, et al.
    • 雑誌名

      Acta Crystallogr D Biol Crystallogr.

      巻: 69 ページ: 2431-2439

    • DOI

      10.1107/S090744491302252X

    • 査読あり
  • [学会発表] 細胞分化における核内アクチンの機能解析2014

    • 著者名/発表者名
      山本浩志
    • 学会等名
      農芸化学会2014年度大会
    • 発表場所
      生田
    • 年月日
      20140328-20140330
  • [学会発表] 遺伝子欠損細胞を用いたヒストンバリアントH2A.Zの機能解析2014

    • 著者名/発表者名
      奥裕行
    • 学会等名
      農芸化学会2014年度大会
    • 発表場所
      生田
    • 年月日
      20140328-20140330
  • [学会発表] 転写およびアクチンダイナミクス制御におけるアクチンファミリーArp5, Arp8の機能解析2014

    • 著者名/発表者名
      村上寛和
    • 学会等名
      農芸化学会2014年度大会
    • 発表場所
      生田
    • 年月日
      20140328-20140330
  • [学会発表] Roles of actin-related proteins in chromatin function and nuclear organization Masahiko Harata2013

    • 著者名/発表者名
      Masahiko Harata
    • 学会等名
      Annual Meeting, American Society of Cell Biology meeting
    • 発表場所
      New Orleans, USA
    • 年月日
      20131214-20131218
  • [学会発表] ヒトINO80クロマチンリモデリング複合体による遺伝子発現の酸化ストレス応答制御2013

    • 著者名/発表者名
      原田昌彦
    • 学会等名
      第36回日本分子生物学会年会
    • 発表場所
      神戸
    • 年月日
      20131203-20131206
  • [学会発表] Arp4による核内アクチンダイナミクスとゲノム機能の制御2013

    • 著者名/発表者名
      山崎祥他
    • 学会等名
      第31回 染色体ワークショップ・第12回 核ダイナミクス研究会
    • 発表場所
      箱根
    • 年月日
      20131125-20131126
  • [学会発表] ヒストンバリアントH2A.Zアイソフォームの転写制御における機能解析2013

    • 著者名/発表者名
      日下部将之
    • 学会等名
      第31回 染色体ワークショップ・第12回 核ダイナミクス研究会
    • 発表場所
      箱根
    • 年月日
      20131125-20131126
  • [学会発表] 平成25年度遺伝研研究会「クロマチンによる遺伝情報のエピジェネティック制御機構」2013

    • 著者名/発表者名
      原田 昌彦
    • 学会等名
      アクチン・ヒストン両ファミリーによる核・クロマチン機能制御
    • 発表場所
      三島
    • 年月日
      20131017-20131018
    • 招待講演
  • [学会発表] Contribution of SWR1- and INO80 chromatin remodeling complexes to the spatial positioning of DNA double-strand break.2013

    • 著者名/発表者名
      Masahiko Harata
    • 学会等名
      酵母エピジェネティックス国際シンポジウム
    • 発表場所
      福井市
    • 年月日
      20130902-20130904
  • [学会発表] Actin family proteins involved in the functional organization of the nucleus2013

    • 著者名/発表者名
      Masahiko Harata
    • 学会等名
      23th Wilhelm Bernhard Workshop on the cell nucleus
    • 発表場所
      Debrecen, Hungary
    • 年月日
      20130819-20130823
    • 招待講演
  • [学会発表] Contribution of histone variant H2A.Z isoforms to transcriptional activation in hyper-acetylated chromatin2013

    • 著者名/発表者名
      Masayuki Kusakabe
    • 学会等名
      23rd Wilhelm Bernhard Workshop on the Cell Nucleus
    • 発表場所
      Debrecen, Hungary
    • 年月日
      20130819-20130823
  • [学会発表] INVOLVEMENT OF THE NUCLEAR ACTIN-RELATED PROTEIN ARP4 IN THE SUBCELLULAR LOCALIZATION AND POLYMERIZATION OF ACTIN2013

    • 著者名/発表者名
      Shota Yamazaki
    • 学会等名
      23rd Wilhelm Bernhard Workshop on the Cell Nucleus
    • 発表場所
      Debrecen, Hungary
    • 年月日
      20130819-20130823
  • [学会発表] Involvement of nuclear actin- and myosin-families in genome function2013

    • 著者名/発表者名
      Masahiko Harata
    • 学会等名
      NIH Tohoku University JSPS Symposium
    • 発表場所
      仙台
    • 年月日
      20130509-20130511
  • [学会発表] アクチンファミリーによる細胞核・クロマチンの機能構造形成

    • 著者名/発表者名
      原田昌彦
    • 学会等名
      第86回日本生化学会大会シンポジウム「細胞核内構造体の構築原理と高次生命機能」
    • 発表場所
      横浜
    • 招待講演
  • [学会発表] 転写制御におけるヒストンバリアントH2A.Zアイソフォームの機能解析

    • 著者名/発表者名
      日下部将之
    • 学会等名
      日本生化学会東北支部会第79回例会・シンポジウム
    • 発表場所
      仙台
  • [学会発表] Analyses of human INO80 complex involvement in gene expression regulation under oxidative stress condition

    • 著者名/発表者名
      Yuichiro Takahashi
    • 学会等名
      第86回日本生化学会大会
    • 発表場所
      横浜
  • [図書] 染色体と細胞核のダイナミクスス-DNAを操る細胞の仕組み- 原口徳子・平岡泰編 11章 核骨格と核タンパク質2013

    • 著者名/発表者名
      原田昌彦
    • 総ページ数
      236 (196-183)
    • 出版者
      化学同人
  • [図書] ベーシックマスター分子生物学(改訂版) 東中川徹、大山隆、清水光弘編 第8章 翻訳の調節2013

    • 著者名/発表者名
      原田昌彦
    • 総ページ数
      439 (216-241)
    • 出版者
      オーム社
  • [備考] http://www.harata-lab.org/

URL: 

公開日: 2015-05-28  

サービス概要 検索マニュアル よくある質問 お知らせ 利用規程 科研費による研究の帰属

Powered by NII kakenhi