• 研究課題をさがす
  • 研究者をさがす
  • KAKENの使い方
  1. 課題ページに戻る

2014 年度 実績報告書

脊椎動物の人工ゲノム倍化によるアダプテーション原理の解明

公募研究

研究領域ゲノムアダプテーションのシステム的理解
研究課題/領域番号 25125716
研究機関山形大学

研究代表者

越智 陽城  山形大学, 医学部, 助教 (00505787)

研究期間 (年度) 2013-04-01 – 2015-03-31
キーワードゲノム進化 / 遺伝子発現調節 / 人工ゲノム倍化 / ゼノパストロピカリス / 胚発生
研究実績の概要

脊椎動物は進化の過程で遺伝子とその発現を調節するシス配列 (エンハンサーやサイレンサー)が倍増する全ゲノム重複を2回経験した。これにより遺伝子回路が高度化し、私たちの発達した臓器や脳、それに起因する複雑な生理特性と行動がもたらされたと考えられている。しかしながら、脊椎動物の進化の鍵となる全ゲノム倍化が起きたとき、ゲノムに何がおきたのか、遺伝子の発現状態やそのシス調節配列がどのように働いたのかは全くわかっていない。この問題は、現存する動物のゲノム配列を比較するだけでは永遠に解決し得ず、ゲノム配列に進化の痕跡を求めるのではなく、倍化を人工的に再現し、進化の初期状態を観察する必要がある。本研究は、脊椎動物なかでも容易にゲノムを倍化させることができるネッタイツメガエルを用いて、倍化直後の遺伝子発現の動態とエピゲノム状態を解析することで、脊椎動物の進化の初期になにが起きたのか解明することを目的としている。昨年度までに、2倍体胚と比べて、正常に発生した倍化体胚で1,779遺伝子の発現の減少がみられ、発現の亢進がみられたものは514遺伝子であった。これらの発現変動がみられた遺伝子のなかには、発生制御遺伝子は含まれていないことを明らかにしていた。今年度は、倍化体の個体サイズや核のサイズを測定した結果、2倍体胚と4倍体胚でほとんど変わらない事を明らかにした。これらの結果は、脊椎動物の全ゲノム倍化直後の胚で正常に発生する個体は、発生制御遺伝子の発現量のバランス調節や個体サイズの調整が起きていることを示唆するものである。

現在までの達成度 (段落)

26年度が最終年度であるため、記入しない。

今後の研究の推進方策

26年度が最終年度であるため、記入しない。

  • 研究成果

    (16件)

すべて 2015 2014

すべて 雑誌論文 (3件) (うち査読あり 2件、 オープンアクセス 1件、 謝辞記載あり 1件) 学会発表 (13件) (うち招待講演 4件)

  • [雑誌論文] ヒストン脱メチル化因子Jmjd3による眼形成遺伝子Pax6の発現制御2015

    • 著者名/発表者名
      川口茜、越智陽城、須藤則広、荻野肇
    • 雑誌名

      21世紀の遺伝学(XI)

      巻: 89 ページ: 8

  • [雑誌論文] Transcriptional regulators in the Hippo signaling pathway control organ growth in Xenopus tadpole tail regeneration2014

    • 著者名/発表者名
      Hayashi S., Ochi H., Ogino H., Kawasumia A., Kameid Y., Tamura K., Yokoyama H.
    • 雑誌名

      Developmental Biology

      巻: 396 ページ: 31-41

    • DOI

      10.1016/j.ydbio.2014.09.018.

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Six1 is a key regulator of the developmental and evolutionary architecture of sensory neurons in craniates2014

    • 著者名/発表者名
      Yajima H., Suzuki M., Ochi H., Ikeda K., Sato S., Yamamura KI., Ogino H., Ueno, N., Kawakami K
    • 雑誌名

      BMC Biology

      巻: 12 ページ: 40

    • DOI

      10.1186/1741-7007-12-40

    • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
  • [学会発表] ツメガエルのゲノム情報とトランスジェニック技術を使った再生応答エンハンサーの同定2014

    • 著者名/発表者名
      越智陽城
    • 学会等名
      第1回イベリアイモリの会
    • 発表場所
      鳥取県鳥取市鳥取大学医学部
    • 年月日
      2014-12-05
  • [学会発表] 全ゲノム倍化直後の脊椎動物胚の遺伝子発現動態2014

    • 著者名/発表者名
      Ochi H. and Ogino H.
    • 学会等名
      第37回日本分子生物学会, ワークショップ: 生態進化発生学 (Eco-Evo-Devo)とは言うけども
    • 発表場所
      神奈川県横浜市パシフィック横浜
    • 年月日
      2014-11-25 – 2014-11-27
    • 招待講演
  • [学会発表] ゲノム編集技術TALENとCRISPR/Cas9を用いた遺伝子発現調節領域のゲノムワイドな機能解析2014

    • 著者名/発表者名
      鈴木菜花、星島一幸、荻野肇、*越智陽城
    • 学会等名
      第22回山形分子生物学セミナー
    • 発表場所
      山形県山形市山形大学理学部
    • 年月日
      2014-11-08
  • [学会発表] ゲノム編集技術 TALENを用いたアカハライモリのチロシナーゼ遺伝子の破壊2014

    • 著者名/発表者名
      平野 高大、越智陽城、星島一幸、竹島一仁、星島一幸、渡辺-高山絵理子、渡辺明彦
    • 学会等名
      第22回山形分子生物学セミナー
    • 発表場所
      山形県山形市山形大学理学部
    • 年月日
      2014-11-08
  • [学会発表] Gene expression dynamics in the artificially genome duplicated vertebrate embryo.2014

    • 著者名/発表者名
      Ochi H.
    • 学会等名
      第86回日本遺伝学会, ワークショップ: ゲノム編集技術と両生類遺伝学の最先端
    • 発表場所
      滋賀県長浜市長浜バイオ大学
    • 年月日
      2014-09-17 – 2014-09-19
    • 招待講演
  • [学会発表] Modification of cell differentiation competence by histione H3K27 demethylase.2014

    • 著者名/発表者名
      Ogino H., Sudou S., Kawaguchi A. and Ochi H.
    • 学会等名
      第85回 日本動物学会, ワークショップ: ナショナルバイオリソース
    • 発表場所
      宮城県仙台市東北大学
    • 年月日
      2014-09-11 – 2014-09-13
    • 招待講演
  • [学会発表] Identification of a cis-regulagory module for glomerular regeneration using comparative genomics and transgenesis techniques for amphbian.2014

    • 著者名/発表者名
      Nanoka S., Hoshijima K., Ogino H., Ochi H.
    • 学会等名
      第85回 日本動物学会 ワークショップ: ゲノム情報と胚誘導形態形成研究のクロストーク
    • 発表場所
      宮城県仙台市東北大学
    • 年月日
      2014-09-11 – 2014-09-13
    • 招待講演
  • [学会発表] Transcriptional regulators in hippo pathway control organ growth during tail regeneration in Xenopus tadpoles2014

    • 著者名/発表者名
      林 真一、越智陽城、荻野 肇、川住 愛子、亀井 保博、田村 宏治、横山 仁
    • 学会等名
      第85回 日本動物学会
    • 発表場所
      宮城県仙台市東北大学
    • 年月日
      2014-09-11 – 2014-09-13
  • [学会発表] Identification of cis-regulatory module for the glomerular regeneration using comparative genomics and transgenesis techniques for amphibian.2014

    • 著者名/発表者名
      Nanoka S., Ogino H., Ochi H.
    • 学会等名
      International Workshop on Developmental and Regeneration Biology in Yamagata
    • 発表場所
      山形県山形市山形大学理学
    • 年月日
      2014-09-10
  • [学会発表] Tyrosinase gene knockout by TALEN technology in the red-bellied newt, Cynops pyrrhogaste2014

    • 著者名/発表者名
      Hirano K., Ochi H., Hoshijima K., Takeshima K., Watanabe E. and Watanabe A.
    • 学会等名
      International Workshop on Developmental and Regeneration Biology in Yamagata
    • 発表場所
      山形県山形市山形大学理学部
    • 年月日
      2014-09-10
  • [学会発表] The impact of whole genome duplication on vertebrate evolution: Lessons from theartificially tetraploidized embryo2014

    • 著者名/発表者名
      Nanoka S., Ogino H., Ochi H.
    • 学会等名
      47th Japanese Society of Developmental Biologist/Asia-Pacific Developmental Biology Network
    • 発表場所
      愛知県名古屋市ウインク愛知
    • 年月日
      2014-05-27 – 2014-05-30
  • [学会発表] Identfication of a cis-regulatory module for glomerular regeneration2014

    • 著者名/発表者名
      Sasaki Y., Tamura Y., Hoshijima K., Ogino H., Ochi, H.
    • 学会等名
      47th Japanese Society of Developmental Biologist/Asia-Pacific Developmental Biology Network
    • 発表場所
      愛知県名古屋市ウインク愛知
    • 年月日
      2014-05-27 – 2014-05-30
  • [学会発表] Activation of H3K27 methlytransferase and demethylase genes during Xenopus tail regeneration2014

    • 著者名/発表者名
      Kawaguchi A., Ochi H., Sudou N., Ogino H.
    • 学会等名
      47th Japanese Society of Developmental Biologist/Asia-Pacific Developmental Biology Network
    • 発表場所
      愛知県名古屋市ウインク愛知
    • 年月日
      2014-05-27 – 2014-05-30

URL: 

公開日: 2016-06-01  

サービス概要 検索マニュアル よくある質問 お知らせ 利用規程 科研費による研究の帰属

Powered by NII kakenhi