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2014 年度 実績報告書

サンゴに共生する光合成性アピコンプレクサ類の比較ゲノム学的研究

公募研究

研究領域複合適応形質進化の遺伝子基盤解明
研究課題/領域番号 25128712
研究機関沖縄科学技術大学院大学

研究代表者

將口 栄一  沖縄科学技術大学院大学, その他の研究科, 研究員 (90378563)

研究期間 (年度) 2013-04-01 – 2015-03-31
キーワードSymibodinium / ゲノム構造 / イントロン / 遺伝子配置 / プラスチド / サンゴ / 共生 / 進化
研究実績の概要

褐虫藻Symbiodinium minutum(クレードB1)のプラスチドゲノムの全配列の決定とそのトランスクリプトームが非常に多くのRNA編集を受けているという結果を共同研究者らとまとめ、論文として報告した(Mungpakdee eta al., 2014)。また昨年度報告したS. minutumの核ゲノムの配列とその解析結果を報告した論文(Shoguchi et al., 2013)を中心に、渦鞭毛藻類のゲノム配列とそのユニークな構造に関しての総説を報告した(Shoguchi, 2014)。さらに共同研究者らとサンゴとその共生藻Symbiodiniumの共生関係をゲノム科学的研究により明らかにするために、これまで報告してきた結果についてまとめ、総説として報告した(Shinzato et al. 2014)。
褐虫藻クレードA3(2,200Mb)とC(2,700Mb)のゲノム概要配列(クレードB1と同程度の質)を決定し、そのゲノム上の遺伝子の位置を連携研究者らの協力を得つつ、決定した。当初計画していたアピコンプレクサを実験材料として用いることができなかったため、今年度はクレードA3, B1, Cを用いたサンゴへの共生実験に加え、サンゴのプラヌラ幼生に非常に感染しやすい2種の褐虫藻を用いた実験を追加した。実験の再現性を確認するため、サンゴAcropora digitiferaのプラヌラ幼生に3種の褐虫藻を感染させる実験を昨年度と同様に行った。サンゴ幼生を加えることにより発現変動する褐虫藻遺伝子を明らかにし、サンゴ幼生との共生に重要な遺伝子群の候補に関して、アピコンプレクサ遺伝子との類似性を比較解析しつつ、報告する予定である。

現在までの達成度 (段落)

26年度が最終年度であるため、記入しない。

今後の研究の推進方策

26年度が最終年度であるため、記入しない。

  • 研究成果

    (5件)

すべて 2014

すべて 雑誌論文 (4件) (うち査読あり 3件、 オープンアクセス 3件、 謝辞記載あり 2件) 学会発表 (1件) (うち招待講演 1件)

  • [雑誌論文] Massive gene transfer and extensive RNA editing of a symbiotic dinoflagellate plastid genome.2014

    • 著者名/発表者名
      Mungpakdee, S., Shinzato, C., Takeuchi, T., Kawashima, T., Koyanagi, R., Hisata, K., Tanaka, M., Goto, H., Fujie, M., Lin, S., Satoh, N. and Shoguchi, E.
    • 雑誌名

      Genome Biology and Evolutin

      巻: 6 ページ: 1408-1422

    • DOI

      10.1093/gbe/evu109

    • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] A genomic approach to coral-dinoflagellate symbiosis: studies of Acropora digitifera and Symbiodinium minutum.2014

    • 著者名/発表者名
      Shinzato, C., Mungpakdee, S., Satoh, N., and Shoguchi, E.
    • 雑誌名

      Frontiers in Microbiology

      巻: 5 ページ: 336

    • DOI

      10.3389/fmicb.2014.00336

    • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] An unusual dinoflagellate nuclear genome2014

    • 著者名/発表者名
      Shoguchi, E.
    • 雑誌名

      The Japanese Journal of Protozoology

      巻: 47 ページ: 5-12

    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] サンゴ礁を生んだ無脊椎動物と藻類の共生は, どのように進化したのか?2014

    • 著者名/発表者名
      將口栄一, 新里宙也
    • 雑誌名

      秀潤社

      巻: 33 ページ: 454-458

  • [学会発表] A first assembly of the Symbiodinium minutum nuclear genome reveals dinoflagellate gene structure2014

    • 著者名/発表者名
      Shoguchi, E
    • 学会等名
      JOINT AQUATIC SCIENCES MEETING 2014
    • 発表場所
      Oregon Convention Center
    • 年月日
      2014-05-18 – 2014-05-23
    • 招待講演

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公開日: 2016-06-01  

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