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2014 年度 実績報告書

質量分析による蛋白質複合体形成動的メカニズムの解明

公募研究

研究領域生命分子システムにおける動的秩序形成と高次機能発現
研究課題/領域番号 26102530
研究機関大阪大学

研究代表者

内山 進  大阪大学, 工学(系)研究科(研究院), 准教授 (90335381)

研究期間 (年度) 2014-04-01 – 2016-03-31
キーワード質量分析 / 複合体 / サブユニット / タンパク質
研究実績の概要

採択初年度である本年度は複合体での質量分析を可能とするための装置のセットアップを行いながら、共同研究先である名古屋市立大学の八木より送付された試料の測定を中心に研究を進めた。まず、プロテアソームサブユニットであるα7について、共同研究者である京都大学の杉山らによって報告されているの多量体状態の確認を行った。報告内容と同様にα7が14量体を形成し、14量体は7量体同士が2つ相互作用した状態であることが確認出来た。さらにこの状態にα6サブユニットを添加するとα6はα7に結合し、さらに14量体を解離させ、最終的に8量体のみが生じることが明らかとなった。また、α7の14量体にDMSOを添加すると質量分解能が高い7量体に解離することを見出した。なお、α6が主に単量体から形成されていることも複合体の質量分析により確認を行っている。さらに、領域内共同研究として、創価大学の池口らが研究を行っているFerritinの多量体状態の測定、についても実施した。

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

2: おおむね順調に進展している

理由

当初計画したプロテアソームサブユニットα7の複合体の質量分析の実現に成功し、さらに、α6サブユニットとの相互作用による解離の観測にも成功している。このように当初計画した複合体質量分析による測定が実現できている。さらに、領域内共同研究の推進にむけた発表を行い、実際に共同研究を積極的に行っていることから、計画は順調に進展しているといえる。

今後の研究の推進方策

既に中性子散乱を用いて報告されているα7のサブユニット交換について複合体質量分析を用いた検証を行う。さらに他のサブニットが添加された際の複合体の化学量論を順次決定する。複合体形成速度についても測定を行い、交換のカイネティクスに迫る。イオンモビリティー法を用いてドリフトタイムを測定し、一方、衝突断面積のシミュレーション結果と対比することで、α7およびα6が結合した際の複合体のアセンブリー状態を解明する。
また、抗体と抗原、さらにFc受容体が形成する複合体を質量分析及び超遠心分析を用いて解析することで、エピトープと複合体サイズ、さらにはFc受容体との相互作用状態を解明する。
領域内共同研究についても加速させ、様々な系の動的なアセンブリーを質量分析を用いて解明することを目指す。

  • 研究成果

    (5件)

すべて 2015 2014

すべて 雑誌論文 (4件) (うち査読あり 4件、 オープンアクセス 1件、 謝辞記載あり 4件) 学会発表 (1件)

  • [雑誌論文] Structural basis for PPARgamma transactivation by endocrine disrupting organotin compounds.2015

    • 著者名/発表者名
      Harada, S., Hiromori, Y., Nakamura, S., Kawahara, K., Fukakusa, S., Maruno, T., Noda, M., Uchiyama, S., Fukui, K., Nishikawa, J., Nagase, H., Kobayashi, Y., Yoshida, T., Ohkubo, T., Nakanishi, T.
    • 雑誌名

      Sci. Rep

      巻: 5:8520 ページ: 1-7

    • DOI

      10.1038/srep08520.

    • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] Structural basis of CpG and inhibitory DNA recognition by Toll-like receptor 9.2015

    • 著者名/発表者名
      Ohto, U., Shibata, T., Tanji, H., Krayukhina, E., Uchiyama, S., Miyake, K., and Shimizu, T.
    • 雑誌名

      Nature

      巻: 520 ページ: 702-705

    • DOI

      10.1038/nature14138

    • 査読あり / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] Crystal structure of extracellular domain of human lectin-like transcript 1 (LLT1), the ligand for natural killer receptor-P1A.2015

    • 著者名/発表者名
      Kita, S., Matsubara, H., Kasai, Y., Tamaoki, T., Okabe, Y., Fukuhara, H., Kamishikiryo, J., Krayukhina, E., Uchiyama, S., Ose, T., Kuroki, K., Maenaka, K.
    • 雑誌名

      European Journal of Immunology

      巻: 未定 ページ: 未定

    • DOI

      10.1002/eji.201545509.

    • 査読あり / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] Pepsin immobilization on an aldehyde-modified polymethacrylate monolith and its application for protein analysis2014

    • 著者名/発表者名
      Han, W., Yamauchi, M., Hasegawa, U., Noda, M., Fukui, K., van der Vlies, Uchiyama, S., and Uyama, H.
    • 雑誌名

      J. Biosci. Bioeng.

      巻: 119 ページ: 505-510

    • DOI

      j.jbiosc.2014.10.018.

    • 査読あり / 謝辞記載あり
  • [学会発表] 水素重水素交換質量分析による蛋白質間相互作用解析及び構造変化モニタリング2014

    • 著者名/発表者名
      野田勝紀、宗京香織、山内美夏、内山 進、福井希一
    • 学会等名
      第14回蛋白質科学会年会
    • 発表場所
      神奈川県横浜市
    • 年月日
      2014-06-27 – 2014-06-27

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公開日: 2016-06-01  

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