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2014 年度 実績報告書

生体内でポリアミンが起こす環化反応の検証とターゲット探索

公募研究

研究領域天然物ケミカルバイオロジー:分子標的と活性制御
研究課題/領域番号 26102743
研究機関独立行政法人理化学研究所

研究代表者

田中 克典  独立行政法人理化学研究所, 田中生体機能合成化学研究室, 准主任研究員 (00403098)

研究期間 (年度) 2014-04-01 – 2016-03-31
キーワード細胞・組織 / 抗体 / 有機化学 / アクロレイン / ポリアミン
研究実績の概要

平成26年度では、アミノ基を多数持つポリアミンに加えて、さらに水酸基を持つアミノアルコール天然物であるスフィンゴシンやノルアドレナリンも形式的な[4+4]環化反応を起こすことを見出した。このように、報告者の見出した反応は天然でも普遍的に進行している。さらに、これら[4+4]環化反応の生成物である8員環誘導体は、分子中のアセタールの安定化度合いよって、放置しておくだけで次第に、現在、酸化ストレス条件下でのアクロレインマーカーとして利用されている3-ホルミル-3,4-デヒドロピペリジン(FDP)へと変換されることを見出した。最もアセタールの安定化効果が小さいと考えられる8員環化合物の1つ、2,6,9-トリアザビシクロ[3.3.1]ノナンの場合では、2日間でほぼ定量的に対応するFDPへと変換される。これまでに報告者が得た成果を総合的に考えると、酸化ストレス条件下では、生体内アミンがアクロレインと反応し、報告者が見出した形式的な[4+4]環化反応が優先的に進行し、まずは8員環化合物を与えている。しかし、8員環化合物は比較的不安定であり、次第により熱学的に安定なFDP化合物へと変換され、そしてこれが安定に取り扱いやすいバイオマーカーとして認識されていると考えられる。逆の観点から、生体内アミンとアクロレインとの反応性一番先に生成する化合物は8員環化合物である。当初、8員環化合物の抗体を作成して生体内での生成を確認しようと考えていたが、8員環化合物の不安定性のため、モノクロナール抗体を作成することが困難であった。しかし、その反応性を詳細に検討することにより、思いがけずこの8員環化合物の生成を間接的に証明することができた。さらに、現在臨床などで使用されているFDPの新しい生成機構を提唱した。

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

2: おおむね順調に進展している

理由

当初の計画に従って、生体内で一般的に様々なアミンがアクロレインとの反応によって8員環化合物を与えることを明らかにした。また、この8員環化合物の抗体こそ作成することは困難であったものの、その化学的反応性の知見から、これを間接的に証明できた。

今後の研究の推進方策

平成27年度では、8員環のエピジェネティクスやクロマチン凝集に関する効果を検討する。予備結果から、1,5-ジアザシクロオクタンは、ヒストンの特定リジン残基のメチル化レベルを顕著に向上させることを見出している。様々なポリアミン誘導体や1,3-ジアミン誘導体を合成し、アクロレインとの環化反応に付すことにより、8員環ライブラリーを合成する。この中から、エピジェネティクスを選択的に制御する化合物やクロマチンの凝集効果を示す化合物を探索する。さらにこれらの結果をもとに、8員環化合物の各種標識体を調製し、細胞内での挙動観察やターゲット分子の探索を行い、エピジェネティクス制御機構を検討する。

  • 研究成果

    (35件)

すべて 2015 2014 その他

すべて 雑誌論文 (3件) (うち査読あり 3件、 オープンアクセス 2件、 謝辞記載あり 3件) 学会発表 (27件) (うち招待講演 10件) 図書 (2件) 備考 (3件)

  • [雑誌論文] Exclusive Formation of Imino [4+4] cycloaddition Products with Biologically Relevant Amines: Plausible Candidates for Acrolein Biomarkers and Biofunctional Modulators2015

    • 著者名/発表者名
      A. Tsutsui, A. R. Pradipta, E. Saigitbatalova, A. Kurbangalieva, K. Tanaka
    • 雑誌名

      Med. Chem. Commun.

      巻: 6 ページ: 431-436

    • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] Imino [4+4] cycloaddition products as exclusive and biologically relevant acrolein-amine conjugates are intermediates of 3-formyl-3,4-dehydropiperidine (FDP), an acrolein biomarker2014

    • 著者名/発表者名
      M. Takamatsu, K. Fukase, A. Kurbangalieva, K. Tanaka
    • 雑誌名

      Bioorg. Med. Chem.

      巻: 22 ページ: 6380-6386

    • 査読あり / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] 生体内合成化学治療を実現する~動物内で生理活性分子を全合成~2014

    • 著者名/発表者名
      田中克典
    • 雑誌名

      生命化学研究レター「研究紹介」

      巻: 46 ページ: 15-20

    • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
  • [学会発表] Therapeutic in vivo synthetic chemistry: Synthetic studies of bioactive compounds in live mouse2015

    • 著者名/発表者名
      Ambara R. Pradipta, Kazuki Tsubokura, Akihiro Ogura, Katsunori Tanaka
    • 学会等名
      日本化学会第95春季年会
    • 発表場所
      船橋
    • 年月日
      2015-03-26 – 2015-03-29
    • 招待講演
  • [学会発表] ポリアミン由来環化化合物によるアミロイド-β-ペプチドの線維化抑制効果2015

    • 著者名/発表者名
      筒井歩、座古保、Bu Tong、山口芳樹、前田瑞夫、田中克典
    • 学会等名
      日本化学会第95春季年会
    • 発表場所
      日大理工学部船橋キャンパス(千葉県船橋市)
    • 年月日
      2015-03-26 – 2015-03-29
  • [学会発表] Ageladine A誘導体のワンポット合成と神経分化促進活性2015

    • 著者名/発表者名
      岩田隆幸、大塚悟史、坪倉一輝、新井大祐、深瀬浩一、中尾洋一、田中克典
    • 学会等名
      日本化学会第95春季年会
    • 発表場所
      日大理工学部船橋キャンパス(千葉県船橋市)
    • 年月日
      2015-03-26 – 2015-03-29
  • [学会発表] アクロレインによる生体内での8員環化合物の生成とその酸化ストレスマーカーへの変換2015

    • 著者名/発表者名
      高松正之, 深瀬浩一, 田中克典
    • 学会等名
      日本化学会第95春季年会
    • 発表場所
      日大理工学部船橋キャンパス(千葉県船橋市)
    • 年月日
      2015-03-26 – 2015-03-29
  • [学会発表] 生体内合成化学治療への戦略:酸化ストレス条件下での還元反応の開発2015

    • 著者名/発表者名
      坪倉一輝、中尾洋一、田中克典
    • 学会等名
      日本化学会第95春季年会
    • 発表場所
      日大理工学部船橋キャンパス(千葉県船橋市)
    • 年月日
      2015-03-26 – 2015-03-29
  • [学会発表] 有機合成化学を起点とするものづくり戦略:特別企画講演 趣意説明2015

    • 著者名/発表者名
      田中克典
    • 学会等名
      日本化学会第95春季年会
    • 発表場所
      日大理工学部船橋キャンパス(千葉県船橋市)
    • 年月日
      2015-03-26 – 2015-03-26
    • 招待講演
  • [学会発表] Therapeutic In Vivo Synthetic Chemistry: Synthesis of Bioactive Compounds in Live Animals2014

    • 著者名/発表者名
      田中克典
    • 学会等名
      ICCEOCA-9/NICCEOCA
    • 発表場所
      astin Hotel Petaling Jaya, Malaysia
    • 年月日
      2014-12-02 – 2014-12-02
    • 招待講演
  • [学会発表] Biologically relevant imino [4+4] cycloaddition products are intermediates of 3-formyl-3,4-dehydropiperidine (FDP)2014

    • 著者名/発表者名
      Masayuki Takamatsu, Koichi Fukase, Katsunori Tanaka
    • 学会等名
      Noyori-School RIKEN
    • 発表場所
      IPC生産性国際交流センター(神奈川県葉山町)
    • 年月日
      2014-12-01 – 2014-12-02
  • [学会発表] Asymmetric Synthesis of Chiral Diamines by Imino Cyclization2014

    • 著者名/発表者名
      Ambara R. Pradipta, Katsunori Tanaka
    • 学会等名
      The 3rd International Seminar on Chemistry 2014 - Innovation and Advances in Chemistry for the 21st Century Challenges
    • 発表場所
      Universitas Padjadjaran, Bandung, Indonesia
    • 年月日
      2014-11-20 – 2014-11-21
  • [学会発表] Therapeutic In Vivo Synthetic Chemistry by Glycocarriers2014

    • 著者名/発表者名
      田中克典
    • 学会等名
      SFG-JSCR Joint Meeting 2014, Satelite 1: Chemical Aspects of Glycobiology
    • 発表場所
      Hilton Hawaiian Village Waikiki Beach Resort, USA
    • 年月日
      2014-11-16 – 2014-11-16
    • 招待講演
  • [学会発表] Polyamine cyclic compounds inhibited fibrillation of amyloid-β-peptide2014

    • 著者名/発表者名
      Ayumi Tsutsui, Tamotsu Zako, Tong Bu, Yoshiki Yamaguchi, Mizuo Maeda, Katsunori Tanaka
    • 学会等名
      第51回ペプチド討論会
    • 発表場所
      徳島大学蔵本キャンパス(徳島県徳島市)
    • 年月日
      2014-10-22 – 2014-10-24
  • [学会発表] Acrolein detection by in vivo synthetic chemistry: Unexplored reactivity of acrolein with azide2014

    • 著者名/発表者名
      Elena Saigitbatalova, Ambara R. Pradipta, Misako Taichi, Almira Kurbangalieva, Katsunori Tanaka
    • 学会等名
      第51回ペプチド討論会
    • 発表場所
      徳島大学蔵本キャンパス(徳島県徳島市)
    • 年月日
      2014-10-22 – 2014-10-24
  • [学会発表] One-Pot Total Synthesis of Ageladine A Inspired by Arginine Post-Translational Modification and its Application to Bioactivity Remodeling2014

    • 著者名/発表者名
      Takayuki Iwata, Koichi Fukase, Katsunori Tanaka
    • 学会等名
      第5回大津会議
    • 発表場所
      大津プリンスホテル(滋賀県大津市)
    • 年月日
      2014-10-20 – 2014-10-21
  • [学会発表] アルギニンの翻訳後修飾に学ぶ血管新生阻害剤ageladine Aのワンポット全合成と活性リモデリング分子の創製2014

    • 著者名/発表者名
      岩田隆幸、大塚悟史、坪倉一輝、新井大祐、深瀬浩一、中尾洋一、田中克典
    • 学会等名
      第56回天然有機化合物討論会
    • 発表場所
      高知県立県民文化ホール(高知県高知市)
    • 年月日
      2014-10-15 – 2014-10-17
  • [学会発表] 生体内合成化学治療2014

    • 著者名/発表者名
      田中克典
    • 学会等名
      早稲田ー理研合同ミニシンポジウム
    • 発表場所
      軽井沢早稲田大学セミナーハウス(長野県軽井沢)
    • 年月日
      2014-10-12 – 2014-10-12
    • 招待講演
  • [学会発表] Polyamine-derived [4+4] cycloaddition products as biologically relevant compounds and their effects on Aβ fibrillation2014

    • 著者名/発表者名
      Ayumi Tsutsui, Tamotsu Zako, Tong Bu, Yoshiki Yamaguchi, Mizuo Maeda, Katsunori Tanaka
    • 学会等名
      Swiss-Japanese Chemical Biology Symposium 2014
    • 発表場所
      University of Bern, Bern, Switzerland
    • 年月日
      2014-10-02 – 2014-10-04
  • [学会発表] One-Pot Total Synthesis and Bioactivity Remodeling of Ageladine A2014

    • 著者名/発表者名
      Takayuki Iwata, Koichi Fukase, Katsunori Tanaka
    • 学会等名
      Swiss-Japanese Chemical Biology Symposium
    • 発表場所
      University of Bern, Bern, Switzerland
    • 年月日
      2014-10-02 – 2014-10-04
  • [学会発表] Therapeutic In Vivo Synthetic Chemistry: Synthesis of Bioactive Compounds in Live Animals2014

    • 著者名/発表者名
      田中克典
    • 学会等名
      Swiss-Japanese Chemical Biology Symposium 2014
    • 発表場所
      University of Bern, Bern, Switzerland
    • 年月日
      2014-10-02 – 2014-10-02
    • 招待講演
  • [学会発表] One-Pot Total Synthesis of Ageladine A: Remodeling of Bioactivity2014

    • 著者名/発表者名
      Takayuki Iwata, Koichi Fukase, Katsunori Tanaka
    • 学会等名
      EPFL-Osaka University workshop
    • 発表場所
      Lausanne, Switzerland
    • 年月日
      2014-09-29 – 2014-09-29
  • [学会発表] N-アルキル共役イミンの環化反応を利用したキラルジアミン合成2014

    • 著者名/発表者名
      Ambara R. Pradipta, 田中克典
    • 学会等名
      第44複素環化学討論会
    • 発表場所
      北海道大学(北海道札幌市)
    • 年月日
      2014-09-12 – 2014-09-12
  • [学会発表] Therapeutic In Vivo Synthetic Chemistry: Total Synthesis of Bioactive Compounds in Live Animals2014

    • 著者名/発表者名
      田中克典
    • 学会等名
      CCS-CSJ Forum 2014
    • 発表場所
      Peking University, Peking, China
    • 年月日
      2014-08-05 – 2014-08-05
    • 招待講演
  • [学会発表] 生体内合成治療 ~生きている動物内での合成研究~2014

    • 著者名/発表者名
      田中克典
    • 学会等名
      FIBER未来大学 Lectures in NanoBioNow Series
    • 発表場所
      神戸学院大学ポートアイランドキャンパス(兵庫県神戸市)
    • 年月日
      2014-07-29 – 2014-07-29
    • 招待講演
  • [学会発表] 共役イミンの[4+4]反応を用いた細胞内での生理活性アルカロイド合成研究2014

    • 著者名/発表者名
      高松正之, 深瀬浩一, 田中克典
    • 学会等名
      天然物化学談話会
    • 発表場所
      岡山大学(岡山県倉敷市)
    • 年月日
      2014-07-02 – 2014-07-04
  • [学会発表] 生体内におけるポリアミン環化体の存在とAβ線維化制御の可能性2014

    • 著者名/発表者名
      筒井歩、座古保、Bu Tong、今牧理恵、北爪しのぶ、山口芳樹、谷口直之、前田瑞夫、田中克典
    • 学会等名
      ケミカルバイオロジー学会第9年会
    • 発表場所
      大阪大学(大阪府豊中市)
    • 年月日
      2014-06-11 – 2014-06-13
  • [学会発表] Exploring Overlooked Chemistry and Biology of Unsaturated Imines towards In Vivo Glycan Dynamics and Polyamine Functions2014

    • 著者名/発表者名
      田中克典
    • 学会等名
      RIKEN-Max Planck Joint Research Center for Systems Chemical Biology, 3rd Annual Symposium
    • 発表場所
      Schloss Ringberg, Munchen, Germany
    • 年月日
      2014-05-23 – 2014-05-23
    • 招待講演
  • [学会発表] Drug delivery via therapeutic in vivo synthesis2014

    • 著者名/発表者名
      Kenward Vong, Katsunori Tanaka
    • 学会等名
      第3回理研-ソウル大学ワークショップ
    • 発表場所
      理化学研究所(埼玉県和光市)
    • 年月日
      2014-04-21 – 2014-04-22
  • [学会発表] New Paradigm of Synthetic Chemistry in Live Cell and Animal2014

    • 著者名/発表者名
      田中克典
    • 学会等名
      The 3rd RIKEN-SNU Workshop on Chemical Biology for Health and Resource Sciences
    • 発表場所
      ホテルメトロポリタン(東京都豊島区)
    • 年月日
      2014-04-20 – 2014-04-20
    • 招待講演
  • [図書] 有機合成実験法ハンドブック 第2版、第11章 クロマトグラフィーによる分析と分取2015

    • 著者名/発表者名
      土川博史, 田中克典
    • 総ページ数
      -
    • 出版者
      丸善出版
  • [図書] 有機合成実験法ハンドブック 第2版、第12章 機器分析による分析2015

    • 著者名/発表者名
      土川博史, 難波康祐, 中尾佳亮, 田中克典
    • 総ページ数
      -
    • 出版者
      丸善出版
  • [備考] 田中生体機能合成化学研究室オリジナルホームページ

    • URL

      http://www.riken.jp/nori-tanaka-lab/

  • [備考] 田中生体機能合成化学研究室

    • URL

      http://www.riken.jp/research/labs/associate/biofunct_synth_chem/

  • [備考] 理研ニュース (No.405 March 2015)

    • URL

      http://www.riken.jp/~/media/riken/pr/publications/news/2015/rn201503.pdf

URL: 

公開日: 2016-06-01  

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