ヘテロだらけ現象の解析

2014 年度 実績報告書

• 研究領域: ゲノム・遺伝子相関：新しい遺伝学分野の創成
• 研究課題/領域番号: 26113703
• 研究機関: 東京大学
• 研究代表者: 藤原 徹 東京大学, 農学生命科学研究科, 教授 (80242163)
• 研究期間 (年度): 2014-04-01 – 2016-03-31
• キーワード: T-DNA / シロイヌナズナ / ヘテロ接合体

研究実績の概要

hdk変異株のマッピングを進めた。まず、ゲノム配列解析を行った。次世代シークエンサーによって得られたデータを対照配列と比較し、ゲノムに300カ所程度のSNPが存在することを見いだした。さらにFASTシステムを用いてhdk表現型を判定するシステムを用いて、hdkが分離するF2集団からhfk個体を選び出しbulkで抽出したDNAを用いて、MutMap法により原因遺伝子の存在する領域を推定した。またこのマッピングの過程で、hdkを示すF2で共通してヘテロとなっている領域が染色体５番以外にも見いだされた。hdkとなる染色体の領域は昨年までに明らかにしていた染色体5番以外にも存在している可能性が考えられる。
hdk現象の細胞生物学的観察のために異なる蛍光タンパク質を配偶子で発現する形質転換系統を独立に6系統作出した。

現在までの達成度 (区分)

3: やや遅れている

理由

変異株の原因遺伝子マッピングは、その表現型解析の難しさと変異の少なさから、予想よりも進展は遅れている。

今後の研究の推進方策

マッピングについては、F2個体数を増やす等してマッピングを行っていく。また、hdk現象の細胞生物学的観察のために異なる蛍光タンパク質を配偶子で発現する形質転換系統については、現象の観察を進めて行く。

研究成果

• [学会発表] Analysis of an Arabidopsis thaliana Mutant which Preferentially Produces Heterozygotes (2015)
  • 著者名/発表者名: Ryuichiro Futagoishi, Akiko Yoshinaga, Kyoko Miwa, Toru Fujiwara
  • 学会等名: 第56回日本植物生理学会年会
  • 発表場所: 東京農業大学（世田谷区）
  • 年月日: 2015-03-16 – 2015-03-18
• [学会発表] ヘテロだらけ現象の解析 (2014)
  • 著者名/発表者名: 二子石龍一郎
  • 学会等名: 新学術領域ゲノム・遺伝子相関平成26年度若手の会
  • 発表場所: 上郷・森の家（横浜）
  • 年月日: 2014-10-31 – 2014-10-31