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2014 年度 実績報告書

植物幹細胞の生殖生長相転換とエピゲノムの相互作用

公募研究

研究領域ゲノム・遺伝子相関:新しい遺伝学分野の創成
研究課題/領域番号 26113713
研究機関横浜市立大学

研究代表者

辻 寛之  横浜市立大学, 木原生物学研究所, 准教授 (40437512)

研究期間 (年度) 2014-04-01 – 2016-03-31
キーワードメリステム / エピゲノム / イネ / 幹細胞 / フロリゲン
研究実績の概要

イネにおいて、栄養成長期から生殖生長期への転換は長距離移動性の情報伝達分子フロリゲン(正体はHd3aタンパク質)に完全に依存している。Hd3aとそのパラログRFT1を欠損するイネは生殖生長期へ移行できず、数年経過しても栄養生長期のまま維持される。生長相転換の際の遺伝子発現変化を網羅的に捉えるために、野生型イネとHd3a/RFT1二重RNAiイネの茎頂メリステムを単離してRNA-seqによる遺伝子発現の解析を実施した。その結果、フロリゲンによって発現誘導される遺伝子を約170個、発現抑制される遺伝子を約700個同定した。興味深いことに、発現抑制される遺伝子のうち500個以上がトランスポゾンであった。また、茎頂メリステムでどの程度のトランスポゾンが発現しているかを調査した結果、アノテーションの付与された長いトランスポゾン(平均3kb)のうち約60%で転写を確認することができた。したがってメリステムはトランスポゾンが活発に転写されており、生殖生長期の開始に伴ってこれらの一部がサイレンシングさせることが分かった。

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

1: 当初の計画以上に進展している

理由

フロリゲンがトランスポゾンのサイレンシングを誘導する機能を持つことを発見した。この発見は当初の予想を上回る成果である。

今後の研究の推進方策

生長相転換に伴うトランスポゾンのサイレンシングのメカニズムについて理解を深めるために、野生型イネの栄養生長メリステムと生殖生長メリステムのDNAメチローム解析を実施し、情報解析を進める。

  • 研究成果

    (7件)

すべて 2014 その他

すべて 国際共同研究 (1件) 雑誌論文 (3件) (うち国際共著 1件、 査読あり 3件、 オープンアクセス 1件) 学会発表 (2件) (うち国際学会 2件、 招待講演 2件) 備考 (1件)

  • [国際共同研究] Louisiana State University(米国)

    • 国名
      米国
    • 外国機関名
      Louisiana State University
  • [雑誌論文] Heterotrimeric G proteins control stem cellproliferation through CLAVATA signaling in Arabidopsis.2014

    • 著者名/発表者名
      Ishida T, Tabata R, Yamada M, Aida M, Mitsumasu K, Fujiwara M, Yamaguchi K, Shigenobu S, Higuchi M, Tsuji H, Shimamoto K, Hasebe M, Fukuda H, Sawa S.
    • 雑誌名

      EMBO rep.

      巻: 15 ページ: 1202-1209

    • DOI

      10.15252/embr.201438660

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Split luciferase complementation assay to detect regulated protein-protein interactions in rice protoplasts in a large-scale format.2014

    • 著者名/発表者名
      Fujikawa Y, Nakanishi T., Kawakami H, Yamasaki K, Sato HM, Tsuji H, Matsuoka M, Kato N.
    • 雑誌名

      Rice

      巻: 7 ページ: 11

    • DOI

      10.1186/s12284-014-0011-8

    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Florigen Signaling2014

    • 著者名/発表者名
      Tsuji H, Taoka K.
    • 雑誌名

      The Enzymes

      巻: 35 ページ: 113-144

    • DOI

      10.1016/B978-0-12-801922-1.00005-1

    • 査読あり
  • [学会発表] Coordination of flowing and gene expression by rice Hd3a florigen2014

    • 著者名/発表者名
      Tsuji, H.
    • 学会等名
      12th International Conference of Rice Functional Genomics
    • 発表場所
      Tucson, Arizona, USA
    • 年月日
      2014-11-17
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] he flowering hormone florigen: Its structure, receptor complex, and beyond2014

    • 著者名/発表者名
      Tsuji, H.
    • 学会等名
      第38回 内藤コンファレンス
    • 発表場所
      シャトレーゼ ガトーキングダム札幌(札幌市)
    • 年月日
      2014-10-09
    • 国際学会 / 招待講演
  • [備考] Website

    • URL

      http://hiroyukitsuji.tumblr.com

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公開日: 2017-01-06   更新日: 2022-01-27  

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