細胞機能を司るオルガネラ・ゾーンの解読

2022 年度 実績報告書

• 研究領域: 細胞機能を司るオルガネラ・ゾーンの解読
• 研究課題/領域番号: 22H04899
• 研究機関: 東京医科歯科大学
• 研究代表者: 清水 重臣 東京医科歯科大学, 難治疾患研究所, 教授 (70271020)
• 研究期間 (年度): 2022-04-01 – 2023-03-31
• キーワード: オルガネラ / ミトコンドリア / ゴルジ体 / 小胞体

研究実績の概要

オルガネラ・ゾーン研究を継続する上で、研究者間の連携を維持すること、情報交換を行うことを目的に、オルガネラゾーンセミナーを毎月オンラインで開催し、2023年3月までに通算21回のオンラインセミナーを開催した。これを基盤として、領域内外の研究者との議論、情報の相互交換、共同研究の推進を図ることができた。
また、新型コロナ感染症の影響で前年度に開催できなかった国際シンポジウムを立教大学において開催し、オルガネラ研究の第一人者であるPietro De Camilli教授、Alissa M Weaver教授、Jaakko Saraste教授、Byung Il Lee教授、Fabien Alpy教授を含めて、約100名の国内外の研究者が参加した。同シンポジウムでは、招聘した教授からの講演を聴取するとともに、最新のオルガネラ解析技術などに関する意見交換を行い、共同研究を打ち合わせた。
さらに、各計画班、公募班の先生方からの情報提供を受けて、５年間の領域の研究を総括を行うとともに、事後評価報告書の作成を行なった。また、報告書に対するフィードバックを行い、オルガネラゾーン研究の更なる研究の進捗を図った。

現在までの達成度 (段落)

令和4年度が最終年度であるため、記入しない。

今後の研究の推進方策

令和4年度が最終年度であるため、記入しない。

研究成果

• [国際共同研究] Penn State University/Washington University/Harvard University(米国)
  • 国名: 米国
  • 外国機関名: Penn State University/Washington University/Harvard University
• [国際共同研究] Yonsei University(韓国)
  • 国名: 韓国
  • 外国機関名: Yonsei University
• [国際共同研究] Barcelona University(スペイン)
  • 国名: スペイン
  • 外国機関名: Barcelona University
• [雑誌論文] Nickel particles are present in Crohn's disease tissue and exacerbate intestinal inflammation in IBD susceptible mice (2022)
  • 著者名/発表者名: Matsuda Hiroki、Nibe-Shirakihara Yoichi、Tamura Akiko、Aonuma Emi、Arakawa Satoko、Otsubo Kana、Nemoto Yasuhiro、Nagaishi Takashi、Tsuchiya Kiichiro、Shimizu Shigeomi、Ma Averil、Watanabe Mamoru、Uo Motohiro、Okamoto Ryuichi、Oshima Shigeru
  • 雑誌名: Biochemical and Biophysical Research Communications 巻: 592 ページ: 74～80
  • DOI: 10.1016/j.bbrc.2021.12.111
• [雑誌論文] Absence of ULK1 decreases AMPK activity in the kidney, leading to chronic kidney disease progression (2022)
  • 著者名/発表者名: Yanagi Tomoki、Kikuchi Hiroaki、Susa Koichiro、Takahashi Naohiro、Bamba Hiroki、Suzuki Takefumi、Nakano Yuta、Fujiki Tamami、Mori Yutaro、Ando Fumiaki、Mandai Shintaro、Mori Takayasu、Takeuchi Koh、Honda Shinya、Torii Satoru、Shimizu Shigeomi、Rai Tatemitsu、Uchida Shinichi、Sohara Eisei
  • 雑誌名: Genes to Cells 巻: 28 ページ: 5～14
  • DOI: 10.1111/gtc.12989
• [雑誌論文] FLIP-based autophagy-detecting technique reveals closed autophagic compartments (2022)
  • 著者名/発表者名: Sakurai Hajime Tajima、Arakawa Satoko、Noguchi Saori、Shimizu Shigeomi
  • 雑誌名: Scientific Reports 巻: 12 ページ: 5721
  • DOI: 10.1038/s41598-022-26430-5
• [雑誌論文] Nanaomycin E inhibits NLRP3 inflammasome activation by preventing mitochondrial dysfunction (2022)
  • 著者名/発表者名: Matsui Yudai、Takemura Naoki、Shirasaki Yoshitaka、Takahama Michihiro、Noguchi Yoshihiko、Ikoma Kenta、Pan Yixi、Nishida Shuhei、Taura Manabu、Nakayama Akiyoshi、Funatsu Takashi、Misawa Takuma、Harada Yoshie、Sunazuka Toshiaki、Saitoh Tatsuya
  • 雑誌名: International Immunology 巻: 34 ページ: 505～518
  • DOI: 10.1093/intimm/dxac028
• [雑誌論文] Oridonin suppresses particulate-induced NLRP3-independent IL-1α release to prevent crystallopathy in the lung (2022)
  • 著者名/発表者名: Ikoma Kenta、Takahama Michihiro、Kimishima Atsushi、Pan Yixi、Taura Manabu、Nakayama Akiyoshi、Arai Masayoshi、Takemura Naoki、Saitoh Tatsuya
  • 雑誌名: International Immunology 巻: 34 ページ: 493～504
  • DOI: 10.1093/intimm/dxac018
• [雑誌論文] Cellular ESCRT components are recruited to regulate the endocytic trafficking and RNA replication compartment assembly during classical swine fever virus infection (2022)
  • 著者名/発表者名: Liu Chun-chun、Liu Ya-yun、Zhou Jiang-fei、Chen Xi、Chen Huan、Hu Jia-huan、Chen Jing、Zhang Jin、Sun Rui-cong、Wei Jian-chao、Go Yun Young、Morita Eiji、Zhou Bin
  • 雑誌名: PLOS Pathogens 巻: 18 ページ: e1010294
  • DOI: 10.1371/journal.ppat.1010294
• [雑誌論文] Impact of Nuclear Envelope Stress on Physiological and Pathological Processes in Central Nervous System (2022)
  • 著者名/発表者名: Kamikawa Yasunao、Saito Atsushi、Imaizumi Kazunori
  • 雑誌名: Neurochemical Research 巻: 47 ページ: 2478～2487
  • DOI: 10.1007/s11064-022-03608-x
• [雑誌論文] Compartmentalization of casein kinase 1 γ CSNK1G controls the intracellular trafficking of ceramide (2022)
  • 著者名/発表者名: Goto Asako、Sakai Shota、Mizuike Aya、Yamaji Toshiyuki、Hanada Kentaro
  • 雑誌名: iScience 巻: 25 ページ: 104624～104624
  • DOI: 10.1016/j.isci.2022.104624
• [雑誌論文] Hyperosmotic Stress Induces Phosphorylation of CERT and Enhances Its Tethering throughout the Endoplasmic Reticulum (2022)
  • 著者名/発表者名: Shimasaki Kentaro、Kumagai Keigo、Sakai Shota、Yamaji Toshiyuki、Hanada Kentaro
  • 雑誌名: International Journal of Molecular Sciences 巻: 23 ページ: 4025～4025
  • DOI: 10.3390/ijms23074025
• [雑誌論文] Omega-3 fatty acid epoxides produced by PAF-AH2 in mast cells regulate pulmonary vascular remodeling (2022)
  • 著者名/発表者名: Moriyama Hidenori,Endo Jin,Kataoka Masaharu,Shimanaka Yuta,Kono Nozomu,Sugiura Yuki,Goto Shinichi,Kitakata Hiroki,Hiraide Takahiro,Yoshida Naohiro,Isobe Sarasa,Yamamoto Tsunehisa,Shirakawa Kohsuke,Anzai Atsushi,Katsumata Yoshinori,Suematsu Makoto,Kosaki Kenjiro,Fukuda Keiichi,Arai Hiroyuki,Sano Motoaki
  • 雑誌名: Nature Communications 巻: 13 ページ: 1234
  • DOI: 10.1038/s41467-022-30621-z
• [雑誌論文] Role of the Orphan Transporter SLC35E1 in the Nuclear Egress of Herpes Simplex Virus 1 (2022)
  • 著者名/発表者名: Maeda Fumio、Kato Akihisa、Takeshima Kosuke、Shibazaki Misato、Sato Ryota、Shibata Takuma、Miyake Kensuke、Kozuka-Hata Hiroko、Oyama Masaaki、Shimizu Eigo、Imoto Seiya、Miyano Satoru、Adachi Shungo、Natsume Tohru、Takeuchi Koh、Maruzuru Yuhei、Koyanagi Naoto、Jun Arii、Yasushi Kawaguchi
  • 雑誌名: Journal of Virology 巻: 96 ページ: 2301
  • DOI: 10.1128/jvi.00306-22
• [雑誌論文] Hippo-TAZ signaling is the master regulator of the onset of triple-negative basal-like breast cancers (2022)
  • 著者名/発表者名: Soyama Hirotoshi、Nishio Miki、Otani Junji、Sakuma Toshiko、Takao Shintaro、Hara Shigeo、Masuda Takaaki、Mimori Koshi、Toyokuni Shinya、Lydon John P.、Nakao Kazuwa、Nishina Hiroshi、Fukumoto Takumi、Maehama Tomohiko、Suzuki Akira
  • 雑誌名: Proceedings of the National Academy of Sciences 巻: 119 ページ: 265
  • DOI: 10.1073/pnas.2123134119
• [雑誌論文] Compartment-specific tuning of dendritic feature selectivity by intracellular Ca ²⁺ release (2022)
  • 著者名/発表者名: O’Hare Justin K.、Gonzalez Kevin C.、Herrlinger Stephanie A.、Hirabayashi Yusuke、Hewitt Victoria L.、Blockus Heike、Szoboszlay Miklos、Rolotti Sebi V.、Geiller Tristan C.、Negrean Adrian、Chelur Vikas、Polleux Franck、Losonczy Attila
  • 雑誌名: Science 巻: 375 ページ: 382
  • DOI: 10.1126/science.abm1670
• [雑誌論文] GET pathway mediates transfer of mislocalized tail-anchored proteins from mitochondria to the ER (2022)
  • 著者名/発表者名: Matsumoto Shunsuke、Ono Suzuka、Shinoda Saori、Kakuta Chika、Okada Satoshi、Ito Takashi、Numata Tomoyuki、Endo Toshiya
  • 雑誌名: Journal of Cell Biology 巻: 221 ページ: 202
  • DOI: 10.1083/jcb.202104076
• [雑誌論文] Quality-controlled ceramide-based GPI-anchored protein sorting into selective ER exit sites (2022)
  • 著者名/発表者名: Rodriguez-Gallardo Sofia、Sabido-Bozo Susana、Ikeda Atsuko、Araki Misako、Okazaki Kouta、Nakano Miyako、Aguilera-Romero Auxiliadora、Cortes-Gomez Alejandro、Lopez Sergio、Waga Miho、Nakano Akihiko、Kurokawa Kazuo、Mu?iz Manuel、Funato Kouichi
  • 雑誌名: Cell Reports 巻: 39 ページ: 110768～110768
  • DOI: 10.1016/j.celrep.2022.110768
• [雑誌論文] The TGN/EE SNARE protein SYP61 and the ubiquitin ligase ATL31 cooperatively regulate plant responses to carbon/nitrogen conditions in Arabidopsis (2022)
  • 著者名/発表者名: Hasegawa Yoko、Huarancca Reyes Thais、Uemura Tomohiro、Baral Anirban、Fujimaki Akari、Luo Yongming、Morita Yoshie、Saeki Yasushi、Maekawa Shugo、Yasuda Shigetaka、Mukuta Koki、Fukao Yoichiro、Tanaka Keiji、Nakano Akihiko、Takagi Junpei、Bhalerao Rishikesh P、Yamaguchi Junji、Sato Takeo
  • 雑誌名: The Plant Cell 巻: 34 ページ: 1354～1374
  • DOI: 10.1093/plcell/koac014
• [雑誌論文] CDP-ribitol prodrug treatment ameliorates ISPD-deficient muscular dystrophy mouse model (2022)
  • 著者名/発表者名: Tokuoka Hideki、Imae Rieko、Nakashima Hitomi、Manya Hiroshi、Masuda Chiaki、Hoshino Shunsuke、Kobayashi Kazuhiro、Lefeber Dirk J.、Matsumoto Riki、Okada Takashi、Endo Tamao、Kanagawa Motoi、Toda Tatsushi
  • 雑誌名: Nature Communications 巻: 13 ページ: 1265
  • DOI: 10.1038/s41467-022-29473-4
• [雑誌論文] Genome-wide CRISPR screen reveals CLPTM1L as a lipid scramblase required for efficient glycosylphosphatidylinositol biosynthesis (2022)
  • 著者名/発表者名: Wang Yicheng、Menon Anant K.、Maki Yuta、Liu Yi-Shi、Iwasaki Yugo、Fujita Morihisa、Guerrero Paula A.、Silva Daniel Var?’n、Seeberger Peter H.、Murakami Yoshiko、Kinoshita Taroh
  • 雑誌名: Proceedings of the National Academy of Sciences 巻: 119 ページ: 7211
  • DOI: 10.1073/pnas.2115083119
• [雑誌論文] <i>O</i> ‐GlcNAcylation regulates β1,4‐GlcNAc‐branched <i>N</i> ‐glycan biosynthesis via the OGT/SLC35A3/GnT‐IV axis (2022)
  • 著者名/発表者名: Song Wanli、Isaji Tomoya、Nakano Miyako、Liang Caixia、Fukuda Tomohiko、Gu Jianguo
  • 雑誌名: The FASEB Journal 巻: 36 ページ: 210
  • DOI: 10.1096/fj.202101520R
• [学会発表] Biological roles of GOMED (2023)
  • 著者名/発表者名: Shigeomi Shimizu
  • 学会等名: Organellar Zone International Symposium
  • 国際学会 / 招待講演
• [備考] オルガネラゾーン ホームページ
  • URL: https://www.tmd.ac.jp/organellezone/index.html
• [学会・シンポジウム開催] Organellar Zone International Symposium (2023)