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2020 Fiscal Year Annual Research Report

翻訳速度調節機構を基盤としたパラメトリック生物学の創成の促進・発展

Administrative Group

Project AreaParametric biology based on translation rate regulatory mechanism
Project/Area Number 20H05782
Research InstitutionKyoto University

Principal Investigator

土居 雅夫  京都大学, 薬学研究科, 教授 (20432578)

Project Period (FY) 2020-10-02 – 2023-03-31
Keywords翻訳 / パラメトリック制御
Outline of Annual Research Achievements

翻訳パラメトリック生物学の創成に向け、総括班として領域方針の策定・企画・評価を行った。特にA01班(土居、京大、翻訳速度制御を介した睡眠・代謝・体内時計のパラメトリック制御)、A02班(岩崎、理研、新規Disome-Seq法: パラメトリックなリボソーム渋滞の網羅的探索)、A03班(原田、阪大・細胞内局所パラメトリック翻訳における物理化学的調節機構)、A04班(池内、東大、柔軟な神経らしさを作り出すパラメトリック翻訳制御)の4班間で行う共同研究の支援を行った。コアメンバーによる月例会議の他、全体の領域会議を令和2年12月28日に領域アドバイザーの本間さと札幌花園病院睡眠医療センターセンター長ならびに梅田眞郷京都大学名誉教授、および学術調査官の田中良和東北大学教授の陪席のもと行った。これに加え、領域外の研究者仲間を交えたParametric Translation Club(http://parametric-translation.pharm.kyoto-u.ac.jp/club.html)を新たに発足させ、令和3年2月2日に研究討論会を行うことができた。またさらに、令和2年10月に領域ホームページを立ち上げ、その中で、計画班員全員による研究の紹介動画の発信や、領域で生まれた最新の研究成果の報告を行った(http://parametric-translation.pharm.kyoto-u.ac.jp/)。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

当初の活動計画に従って翻訳速度調節機構を基盤としたパラメトリック生物学の創成の促進・発展を目指した総括班による支援活動を行うことができた。総括班は、計画研究の研究代表者4名(土居・岩崎・原田・池内)と温度制御・計測技術を担当する計画研究の研究分担者1名(岡部)の計5名で構成し、領域代表者の土居を研究代表者、他の班員を連携研究者とした。このような体制において当初の活動計画に従い以下の計画を実施することができた。すなわち、総括班代表の土居が中心となって事務局を運営し、領域会議(2020/12/28)と月例コア会議を実施し、革新的な技術や成果の創出のための創造的な研究活動の後押しすることができた。これに加えParametric Translation Clubを新たに発足させ、班員と外部識者を混じえた研究論文討論会(2021/2/2)を行うことができた。さらに岩崎が中心となり次世代シークエンサーRibo-Seq技術習得のためのブートキャンプの開催準備を整えるとともに、領域融合型若手育成支援活動を原田・岡部が中心となり行った。またさらに、池内・土居が中心となって本領域の紹介動画やホームページの新規作成を行い、本領域の研究活動を広く一般に伝えるためのプラットフォームを作ることができた。このように当該領域の総括班活動は大変順調に進んでおり、今後の研究活動のための重要な土台作りをすることができたといえる。

Strategy for Future Research Activity

前年度に引き続き、当初の活動計画に従って翻訳速度調節機構を基盤としたパラメトリック生物学の創成の促進・発展を目指した総括班による支援活動を行う。特に、今後はこれまでの活動を継続するとともに、研究成果の発信として、日本分子生物学会や日本生物物理学会などの各学会年会においてシンポジウムを開催する計画である。昨年度発足させたParametric Translation Clubにおいてはさらにこれを充実させ当該メンバーによるミニシンポジウムと新知見勉強会を行う予定である。これにより、本領域への関心・参画希望をもつ仲間を集め、研究拠点の多面的な深化・発展に努めてゆきたいと考えている。

  • Research Products

    (20 results)

All 2021 2020 Other

All Int'l Joint Research (1 results) Journal Article (6 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Peer Reviewed: 2 results,  Open Access: 2 results) Presentation (11 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Invited: 2 results) Remarks (2 results)

  • [Int'l Joint Research] Taipei Medical University(その他の国・地域)

    • Country Name
      その他の国・地域
    • Counterpart Institution
      Taipei Medical University
  • [Journal Article] Role of α2δ3 in Cellular Synchronization of the Suprachiasmatic Nucleus Under Constant Light Conditions2021

    • Author(s)
      Matsuo Masahiro、Seo Kazuyuki、Mizuguchi Naoki、Yamazaki Fumiyoshi、Urabe Shoichi、Yamada Naoto、Doi Masao、Tominaga Keiko、Okamura Hitoshi
    • Journal Title

      Neuroscience

      Volume: 461 Pages: 1~10

    • DOI

      10.1016/j.neuroscience.2021.02.016

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Hyperpolyploidization of hepatocyte initiates preneoplastic lesion formation in the liver2021

    • Author(s)
      Lin Heng、Huang Yen-Sung、Fustin Jean-Michel、Doi Masao、Chen Huatao、Lai Hui-Huang、Lin Shu-Hui、Lee Yen-Lurk、King Pei-Chih、Hou Hsien-San、Chen Hao-Wen、Young Pei-Yun、Chao Hsu-Wen
    • Journal Title

      Nature Communications

      Volume: 12 Pages: 645

    • DOI

      10.1038/s41467-020-20572-8

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Time-Restricted G-Protein Signaling Pathways via GPR176, Gz, and RGS16 Set the Pace of the Master Circadian Clock in the Suprachiasmatic Nucleus2020

    • Author(s)
      Nakagawa Shumpei、Nguyen Pham Khanh Tien、Shao Xinyan、Doi Masao
    • Journal Title

      International Journal of Molecular Sciences

      Volume: 21 Pages: 5055~5055

    • DOI

      10.3390/ijms21145055

    • Open Access
  • [Journal Article] 時計遺伝子の転写のシス制御エレメントに点変異を入れると体内時計はどうなるのか2020

    • Author(s)
      Nguyen Pham Khanh Tien、土居雅夫
    • Journal Title

      生化学

      Volume: 92 Pages: 735~739

    • DOI

      10.14952/SEIKAGAKU.2020.920735

  • [Journal Article] 変温動物の日内体温制御2020

    • Author(s)
      三宅 崇仁、土居 雅夫
    • Journal Title

      新学術領域研究 温度生物学ハンドブック

      Volume: NA Pages: NA

  • [Journal Article] 体内時計の中枢を調節するG蛋白質共役型受容体2020

    • Author(s)
      嶋谷 寛之、土居 雅夫
    • Journal Title

      膜タンパク質工学ハンドブック エヌ・ティー・エス出版

      Volume: NA Pages: 344~348

  • [Presentation] Research for drug discovery aimed at circadian rhythm regulation by time-restricted gating of G-protein signaling2021

    • Author(s)
      Masao Doi
    • Organizer
      第85回日本循環器学会学術集会
    • Invited
  • [Presentation] The E’-box of Per2 is essential for daily maintenance of organismal behavior and physiology.2020

    • Author(s)
      Masao Doi
    • Organizer
      SRBR 2020, Society for research on biological rhythms
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] 時計遺伝子のシス制御エレメントが個体の活動や生理リズムの維持に与える影響の範囲・限界2020

    • Author(s)
      土居雅夫
    • Organizer
      第43回日本分子生物学会年会
    • Invited
  • [Presentation] Circadian PER2 protein oscillations do not persist when de novo translation is inhibited in cultured mouse embryonic fibroblasts2020

    • Author(s)
      Xinyan Shao, Takahito Miyake, and Masao Doi
    • Organizer
      第43回日本分子生物学会年会
  • [Presentation] 体内時計の温度同調機構:生理的な範囲の温度変化が培養マウス繊維芽細胞の分子時計に与える影響について2020

    • Author(s)
      井ノ上 雄一、三宅 崇仁、土居 雅夫
    • Organizer
      第43回日本分子生物学会年会
  • [Presentation] 加齢性睡眠障害/早朝覚醒の鍵を握る生体リズム機構2020

    • Author(s)
      土居雅夫
    • Organizer
      AMED老化メカニズムの解明・制御プロジェクト「老化研究産学連携シンポジウム」
  • [Presentation] 体内時計の時差への適応・光同調を担う視交叉上核Gタンパク質共役型受容体2020

    • Author(s)
      山口賀章、岡村 均、土居雅夫
    • Organizer
      第27回日本時間生物学会年会
  • [Presentation] Role of N-glycosylation of GPR176: A potential link between N-glycosylation and human chronotype2020

    • Author(s)
      中川峻平、土居雅夫
    • Organizer
      第27回日本時間生物学会年会
  • [Presentation] 体内時計の制御に関わるGz共役型オーファン受容体Gpr176のN型糖鎖修飾型糖鎖修飾の役割2020

    • Author(s)
      王 甜宇、土居雅夫
    • Organizer
      第93回日本生化学会大会
  • [Presentation] Gz共役型オーファン受容体Gpr176のハイスループットリガンドスクリーニング法の確立2020

    • Author(s)
      中川峻平、土居雅夫
    • Organizer
      第93回日本生化学会大会
  • [Presentation] 脳内サーカディアンリズム中枢を制御する時間選択的Gタンパク質シグナル伝達経路GPR176-Gz-RGS16の役割2020

    • Author(s)
      土居雅夫
    • Organizer
      第93回日本生化学会大会
  • [Remarks] 京都大学大学院薬学研究科医薬創成情報科学専攻システムバイオロジー分野

    • URL

      http://systems-biology.pharm.kyoto-u.ac.jp/

  • [Remarks] 文部科学省学術変革領域(B) パラメトリク翻訳

    • URL

      http://parametric-translation.pharm.kyoto-u.ac.jp/

URL: 

Published: 2021-12-27  

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