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2015 Fiscal Year Annual Research Report

ゲノムを支える非コードDNA領域の機能

Administrative Group

Project AreaFunctions of non-coding DNA region for genome integrity
Project/Area Number 23114001
Research InstitutionNational Institute of Genetics

Principal Investigator

小林 武彦  東京大学, 分子細胞生物学研究所, 教授 (40270475)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 中山 潤一  名古屋市立大学, 大学院システム自然科学研究科, 教授 (60373338)
太田 邦史  東京大学, 総合文化研究科, 教授 (90211789)
Project Period (FY) 2011-04-01 – 2016-03-31
Keywords非コードDNA領域 / 染色体 / ゲノムの安定性 / クロマチン構造 / インターメア / セントロメア / テロメア
Outline of Annual Research Achievements

真核細胞ゲノムの大半はタンパク質をコードしていない非コードDNA領域である。この領域は染色体を制御、維持する作用を担っていると考えられるが、その実体は不明な点がほとんどである。本研究領域では研究者間の強力な連携体制を築き、非コードDNA領域による染色体制御機構の全貌解明を目的とする。本総括班では、各研究者間の共同研究・情報交換の促進や、対外的な成果発表・情報発信、我が国の関連領域への波及効果促進などを目指す。
本年度も当初の計画通り領域ホームページの更新、ニュースレター刊行を行った。8月には全班員参加で領域会議を葉山で開催した。続けて同月、海外から5名の研究者を招聘し外部評価を兼ねた国際シンポジウム「Non-coding DNA and Chromosome Integrity」を開催した。概ね高評価をいただけた。また3月には、過去の公募班員やこれまでに領域の研究計画に参画した学生、ポスドクなどの若手にも参加してもらい「終了シンポジウム」を東京大学で行った。シンポジウムでは、5年間の総括に加え、さらなる本分野の発展を目指し、柳田充弘評価委員による講演「染色体研究の展望」、最後に評価委員の5名先生をパネラーに迎え、「ゲノム研究の未来」について全員で議論した。学術調査官の先生にはすべての会議にはご参加いただき適切なアドバイスを頂戴した。

Research Progress Status

27年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

27年度が最終年度であるため、記入しない。

  • Research Products

    (23 results)

All 2016 2015 Other

All Journal Article (7 results) (of which Peer Reviewed: 7 results,  Open Access: 7 results,  Acknowledgement Compliant: 4 results) Presentation (6 results) (of which Int'l Joint Research: 4 results,  Invited: 3 results) Book (4 results) Remarks (4 results) Patent(Industrial Property Rights) (1 results) Funded Workshop (1 results)

  • [Journal Article] More than 10% of yeast genes are related to genome stability and influence cellular senescence via rDNA maintenance2016

    • Author(s)
      Saka K, Takahashi A, Sasaki M, Kobayashi T
    • Journal Title

      Nuclei Acid Res

      Volume: on line Pages: on line

    • DOI

      10.1093/nar/gkw110

    • Peer Reviewed / Open Access / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Extended string-like binding of the phosphorylated HP1α N-terminal tail to the lysine 9-methylated histone H3 tail.2016

    • Author(s)
      Shimojo H, Kawaguchi A, Oda T, Hashiguchi N, Omori S, Moritsugu K, Kidera A, Hiragami-Hamada K, Nakayama J, Sato M, Nishimura Y.
    • Journal Title

      Sci Rep.

      Volume: 6 Pages: on line

    • DOI

      10.1038/srep22527.

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Gic1 is a novel heterochromatin boundary protein in vivo.2016

    • Author(s)
      Mitsumori R, Shinmyozu K, Nakayama J, Uchida H, Oki M.
    • Journal Title

      Genes Genet Syst.

      Volume: in press Pages: in press

    • DOI

      in press

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] The Human PolI Transcription Terminator Complex Acts as a Replication Fork Barrier that Coordinates the Progress of Replication with rRNA Transcription Activity.2015

    • Author(s)
      Akamatsu Y, Kobayashi T.
    • Journal Title

      Mol Cell Biol

      Volume: 35 Pages: 1871-1881

    • DOI

      10.1128/MCB.01521-14

    • Peer Reviewed / Open Access / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Glycerophospholipid regulation of modality-specific sensory axon guidance in the spinal cord.2015

    • Author(s)
      Guy AT, Nagatsuka Y, Ooashi N, Inoue M, Nakata A, Greimel P, Inoue A, Nabetani T, Murayama A, Ohta K, Ito Y, Aoki J, Hirabayashi Y, Kamiguchi H.
    • Journal Title

      Science

      Volume: 349 Pages: 974-977

    • DOI

      10.1126/science.aab3516

    • Peer Reviewed / Open Access / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Dynamic transition of transcription and chromatin landscape during fission yeast adaptation to glucose starvation.2015

    • Author(s)
      Oda A, Takemata N, Hirata Y, Miyoshi T, Suzuki Y, Sugano S, Ohta K.
    • Journal Title

      Genes Cells

      Volume: 20 Pages: 392-407

    • DOI

      10.1111/gtc.12229

    • Peer Reviewed / Open Access / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Environmental Factors Affecting Pupation Decision in the Horned Flour Beetle Gnatocerus cornutus.2015

    • Author(s)
      Ozawa T, Ohta K, Shimada M, Okada K, Okada Y.
    • Journal Title

      Zoolog Sci

      Volume: 32 Pages: 183-187

    • DOI

      http://dx.doi.org/10.2108/zs140203

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Presentation] ヘテロクロマチン構造形成におけるCLRC複合体の役割2016

    • Author(s)
      中山潤一
    • Organizer
      第33回染色体ワークショップ・第14回核ダイナミクス研究会 合同大会
    • Place of Presentation
      松島一の坊(宮城県宮城郡松島町)
    • Year and Date
      2016-01-13 – 2016-01-13
  • [Presentation] グルコース飢餓ストレス時のセンス・アンチセンス長鎖非コードRNAを介した遺伝子発現制御2015

    • Author(s)
      小田有沙 太田邦史
    • Organizer
      BMB2015
    • Place of Presentation
      ポートピアホテル(兵庫県神戸市)
    • Year and Date
      2015-12-02 – 2015-12-02
  • [Presentation] rDNA stability determines the faye of cell2015

    • Author(s)
      Kobayashi T
    • Organizer
      国際シンポジウムMolecular Biology of Ageing
    • Place of Presentation
      オランダ、フローリンゲン
    • Year and Date
      2015-10-25 – 2015-10-28
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] More than 10 % of yeast genes are related to genome stability and influence cellular senescence via rDNA maintenance.2015

    • Author(s)
      Kobayashi T
    • Organizer
      国際シンポジウムNon-coding DNA and Chromosomal Integrity
    • Place of Presentation
      淡路夢舞台国際会議場(兵庫県淡路市)
    • Year and Date
      2015-08-07 – 2015-08-08
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Crosstalk between histone modifications during heterochromatin assembly.2015

    • Author(s)
      Nakayama J.
    • Organizer
      第8回分裂酵母国際学会
    • Place of Presentation
      生田神社会館(兵庫県神戸市)
    • Year and Date
      2015-06-22 – 2015-06-22
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Long noncoding RNAs stimulate promoter binding of the transcription factor Atf1 by antagonizing the Grougho/Tup1-like corepressors Tup11 and Tup122015

    • Author(s)
      Takemata N, Ohta K
    • Organizer
      Pombe2015
    • Place of Presentation
      生田神社会館(兵庫県神戸市)
    • Year and Date
      2015-06-21 – 2015-06-26
    • Int'l Joint Research
  • [Book] 岩波ジュニア新書「寿命はなぜ決まっているのかー長生き遺伝子のヒミツー」2016

    • Author(s)
      小林武彦
    • Total Pages
      240
    • Publisher
      岩波書店
  • [Book] 岩波ジュニア新書「生命デザイン学入門」2016

    • Author(s)
      小川(西秋)葉子、太田邦史
    • Total Pages
      224
    • Publisher
      岩波書店
  • [Book] ゲノムを司るインターメア:非コードDNAの新たな展開2015

    • Author(s)
      小林武彦 編
    • Total Pages
      248
    • Publisher
      化学同人
  • [Book] エピジェネティクス革命2015

    • Author(s)
      ネッサ・キャリー著 中山潤一訳
    • Total Pages
      428
    • Publisher
      丸善出版
  • [Remarks] ゲノムを支える非コードDNA領域の機能

    • URL

      http://www.nsc.nagoya-cu.ac.jp/~jnakayam/ncDNA.html

  • [Remarks] 小林研究室

    • URL

      http://lafula-com.info/kobayashiken/CytoGen/index.html

  • [Remarks] 中山研究室

    • URL

      http://www.nsc.nagoya-cu.ac.jp/~jnakayam/ncDNA.html

  • [Remarks] 太田研究室

    • URL

      http://www.ohta-lab.c.u-tokyo.ac.jp

  • [Patent(Industrial Property Rights)] 空間的な近さの概念を用いた生体分子データの3次元構造の再構2016

    • Inventor(s)
      平田祥人、小田有沙、太田邦史、合原一幸
    • Industrial Property Rights Holder
      平田祥人、小田有沙、太田邦史、合原一幸
    • Industrial Property Rights Type
      特許
    • Industrial Property Number
      特願2016-023214
    • Filing Date
      2016-02-10
  • [Funded Workshop] Non-coding DNA and Chromosomal Integrity2015

    • Place of Presentation
      淡路夢舞台国際会議場(兵庫県淡路市)
    • Year and Date
      2015-08-07 – 2015-08-08

URL: 

Published: 2017-01-06  

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