Noncoding RNA neo-taxonomy

2018 Fiscal Year Annual Research Report

• Project Area: Neo-taxonomy of noncoding RNAs
• Project/Area Number: 26113001
• Research Institution: Hokkaido University
• Principal Investigator: 廣瀬 哲郎 北海道大学, 遺伝子病制御研究所, 教授 (30273220)
• Co-Investigator(Kenkyū-buntansha): 泊 幸秀 東京大学, 定量生命科学研究所, 教授 (90447368)
• Project Period (FY): 2014-07-10 – 2019-03-31
• Keywords: ノンコーディングRNA / 若手支援 / 国際シンポジウム

Outline of Annual Research Achievements

総括班としての領域最終年度の主な活動は、国際シンポジウムの開催、若手の海外学会での発表支援、領域内共同研究の推進、領域会議の開催などであり、当初からの計画は滞りなく遂行することができた。まず国際シンポジウムとして、日本ーオーストラリア合同シンポジウム（JAJ2018）を11月に札幌にて開催し、Archa Fox, Thomas Preiss, Greg Goodall, Charles Bondなどオーストラリアを代表するncRNA研究者が、領域班員と共に最先端の講演を行った。また12月には、Roy Parker, Simon Alberti, Eric Miskaといった一流ncRNA研究者によるTokyo RNA Club meetingを東京で開催し、いずれも若手研究者を含む領域班員との交流が有意義な形で行われた。このほかの活動として、前年に引き続き、若手研究者の海外学会での発表のための旅費支援である「若手フェローシップ制度」から11件の海外渡航を支援した。さらに学会見聞記を領域ホームページのブログにて発表してもらった。こうした活動によって、次世代のRNA研究を担う若手研究者の国際見聞を広げることに貢献できたと考えられる。また最後の領域班会議が2月に東京で開催され、これまでの成果と今後の本学問分野の方向性について活発な議論が交わされた。この他の活動として、領域内共同研究を論文として成果発表することを推進するために、引き続き共同研究論文の掲載費やオープンアクセス費のサポートを行った。上記の総括班によるサポート活動は、領域内にとどまらず我が国のRNA研究の活性化に大いに貢献したと考えられる。

Research Progress Status

平成30年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

平成30年度が最終年度であるため、記入しない。

Research Products

• [Int'l Joint Research] University of Western Australia(オーストラリア)
  • Country Name: AUSTRALIA
  • Counterpart Institution: University of Western Australia
• [Int'l Joint Research] Stanford University/University of Texas/Northwestern University(米国)
  • Country Name: U.S.A.
  • Counterpart Institution: Stanford University/University of Texas/Northwestern University
  • # of Other Institutions: 1
• [Int'l Joint Research] DZHK/IMB-Mainz/Helmholtz Zentrum(ドイツ)
  • Country Name: GERMANY
  • Counterpart Institution: DZHK/IMB-Mainz/Helmholtz Zentrum
• [Int'l Joint Research] CNRS/University of Toulouse(フランス)
  • Country Name: FRANCE
  • Counterpart Institution: CNRS/University of Toulouse
• [Int'l Joint Research] Francis Crick Institute(英国)
  • Country Name: UNITED KINGDOM
  • Counterpart Institution: Francis Crick Institute
• [Int'l Joint Research]
  • # of Other Countries: 3
• [Journal Article] Cap-specific terminal N6-methylation of RNA by an RNA polymerase II-associated methyltransferase (2019)
  • Author(s): Akichika S, Hirano S, Shichino Y, Sugita A, Suzuki T, Nishimasu H, Ishitani R, Sugita A, Hirose Y, Iwasaki S, Nureki O, Suzuki T
  • Journal Title: Science Volume: 363 Pages: eaav0080
  • DOI: 10.1126/science.aav0080
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Distinct and collaborative functions of Yb and Armitage in transposon-targeting piRNA biogenesis (2019)
  • Author(s): Ishizu H, Kinoshita T, Hirakata S, Komatsuzaki C, Siomi MC
  • Journal Title: Cell Report（in press） Volume: - Pages: -
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Functional Domains of NEAT1 Architectural lncRNA Induce Paraspeckle Assembly through Phase Separation. (2018)
  • Author(s): Yamazaki T, Souquere S, Chujo T, Kobelke S, Chong YS, Fox AH, Bond CS, Nakagawa S, Pierron G, Hirose T.
  • Journal Title: Molecular Cell Volume: 70 Pages: 1038-1053
  • DOI: 10.1016/j.molcel.2018.05.019.
  • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
• [Journal Article] UPA-seq: prediction of functional lncRNAs using differential sensitivity to UV crosslinking (2018)
  • Author(s): Komatsu T, Yokoi S, Fujii K, Mito M, Kimura Y, Iwasaki S, Nakagawa S.
  • Journal Title: RNA Volume: 24 Pages: 1785-1802
  • DOI: 10.1261/rna.067611.118
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Conformational Activation of Argonaute by Distinct yet Coordinated Actions of the Hsp70 and Hsp90 Chaperone Systems (2018)
  • Author(s): Tsuboyama K, Tadakuma H, Tomari Y
  • Journal Title: Molecular Cell Volume: 70 Pages: 722-729
  • DOI: 10.1016/j.molcel.2018.04.010
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Construction of integrated gene logic-chip. (2018)
  • Author(s): Masubuchi T, Endo M, Iizuka R, Iguchi A, Yoon DH, Sekiguchi T, Qi H, Iinuma R, Miyazono Y, Shoji S, Funatsu T, Sugiyama H, Harada Y, Ueda T, Tadakuma H.
  • Journal Title: Nature Nanotechnology Volume: 13 Pages: 933-940
  • DOI: 10.1038/s41565-018-0202-3.
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Dissecting the roles of miR-140 and its host gene. (2018)
  • Author(s): Inui M, Mokuda S, Sato T, Tamano M, Takada S, Asahara H
  • Journal Title: Nature Cell Biology Volume: 20 Pages: 516-518
  • DOI: 10.1038/s41556-018-0077-4.
  • Peer Reviewed
• [Presentation] Metabolic and Chemical Regulation of RNA Modifications Associated with Various Biological Processes (2019)
  • Author(s): 鈴木勉
  • Organizer: RNA Editing Gordon Research Conference,Next-Generation Epitranscriptomics in Health and Disease
  • Int'l Joint Research / Invited
• [Presentation] Requirements for multivalent Yb body assembly in piRNA-mediated transposon silencing in Drosophila (2019)
  • Author(s): 塩見美喜子
  • Organizer: 40th LORNE GENOME CONFERENCE 2019
  • Int'l Joint Research / Invited
• [Presentation] Cartilage Development and Homeostasis via Pre- and Post-Transcriptional Regulation (2019)
  • Author(s): 浅原弘嗣
  • Organizer: Gordon Research Conference, Cartilage Biology and Pathology
  • Int'l Joint Research / Invited
• [Presentation] Nuclear architecture by long noncoding RNAs through phase separation. (2018)
  • Author(s): 廣瀬哲郎
  • Organizer: China Nucleic Acids Forum 2018
  • Int'l Joint Research / Invited
• [Presentation] Prediction of functional lncRNAs using UPA-seq (2018)
  • Author(s): 中川真一
  • Organizer: CSH Asia Meeting “RNA Biology"
  • Int'l Joint Research / Invited
• [Presentation] 3´-end maturation of silkworm piRNAs―a conserved mechanism of piRNA biogenesis (2018)
  • Author(s): 泊幸秀
  • Organizer: EMBO Workshop "piRNAs and PIWI proteins"
  • Int'l Joint Research / Invited
• [Funded Workshop] The 2nd Japan Australia joint RNA meeting (2018)
• [Funded Workshop] 25th Tokyo RNA Club meeting (2018)
• [Funded Workshop] MBSJ2018 symposium, workshop (2018)