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2020 Fiscal Year Annual Research Report

時間と場が制御する脳発生の数理モデル化とシミュレーション

Planned Research

Project AreaInterplay of developmental clock and extracellular environment in brain formation
Project/Area Number 16H06486
Research InstitutionKyoto University

Principal Investigator

安達 泰治  京都大学, ウイルス・再生医科学研究所, 教授 (40243323)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 亀尾 佳貴  京都大学, ウイルス・再生医科学研究所, 助教 (60611431)
Project Period (FY) 2016-06-30 – 2021-03-31
Keywords脳・神経 / 発生・分化 / 細胞・組織 / 生物物理学 / 数理工学
Outline of Annual Research Achievements

本研究では、現象の数理モデル化とシミュレーションを駆使し、時間と場に依存した脳発生制御機構を多細胞ダイナミクスに基づいて統合的に理解することを目的としている。そのため、分子・細胞・組織・器官レベルにおいて得られた個別の知見をコンピュータ内に集約し、それらを統合した脳発生シミュレーションプラットフォームの構築を進めてきた。

(A) 微小細胞間隙における神経細胞遊走の数理モデリング: 脳の発生過程において、新しく誕生した神経細胞は、機能を発揮すべき目的地まで長い距離を遊走する。この細胞遊走の過程で、神経細胞は、他の細胞群によって作られる微小間隙を通過しなければならない。しかしながら、間隙サイズに比べて大きな細胞核を持つ神経細胞が、いかにしてこの微小間隙をすり抜けるのかは未だ明らかでない。そこで、神経細胞による微小間隙通過の力学的メカニズムを明らかにするため、細胞遊走の数理モデルを構築した。特に、微小間隙通過時に生じる細胞後端のアクトミオシン収縮に着目し、微小間隙を通過する神経細胞を観察したin vitro実験をシミュレーションにより再現することにより、その力学的役割を検討した。

(B) 小脳皮質におけるしわ形成メカニズムの検討: 前年度までに構築した脳形態形成の数理モデルを小脳皮質のしわ形成に適用し、計算機シミュレーションにより、小脳に特徴的なしわ構造が形成されるメカニズムについて検討した。その結果、小脳皮質に見られる一方向性の規則正しいしわ構造は、左右軸方向に沿って配向した顆粒細胞の平行線維に働く張力によって誘導される可能性が示唆された。また、形態形成の進行とともに、小脳皮質の変形にともなってバーグマングリア線維に沿った顆粒細胞の移動方向が変化し、それが組織の不均一な組織成長を引き起こすことにより、しわの伸長が促進されることが示された。

Research Progress Status

令和2年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

令和2年度が最終年度であるため、記入しない。

  • Research Products

    (11 results)

All 2022 2021 2020

All Journal Article (3 results) (of which Peer Reviewed: 3 results,  Open Access: 2 results) Presentation (8 results) (of which Int'l Joint Research: 2 results)

  • [Journal Article] Cerebellar foliation via non-uniform cell accumulation caused by fiber-guided migration of granular cells2021

    • Author(s)
      Takeda Hironori、Kameo Yoshitaka、Yamaguchi Takahiro、Nakajima Kazunori、Adachi Taiji
    • Journal Title

      Journal of Biomechanical Science and Engineering

      Volume: 16 Pages: 20-00515

    • DOI

      10.1299/jbse.20-00516

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Continuum modeling for neuronal lamination during cerebral morphogenesis considering cell migration and tissue growth2020

    • Author(s)
      Takeda Hironori、Kameo Yoshitaka、Adachi Taiji
    • Journal Title

      Computer Methods in Biomechanics and Biomedical Engineering

      Volume: 24 Pages: 799~805

    • DOI

      10.1080/10255842.2020.1852554

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] An energy landscape approach to understanding variety and robustness in tissue morphogenesis2020

    • Author(s)
      Takeda Hironori、Kameo Yoshitaka、Inoue Yasuhiro、Adachi Taiji
    • Journal Title

      Biomechanics and Modeling in Mechanobiology

      Volume: 19 Pages: 471~479

    • DOI

      10.1007/s10237-019-01222-5

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Presentation] 神経線維の配向に依存した小脳の平行なしわ形成過程の力学的検討2022

    • Author(s)
      山口嵩洋,竹田宏典,亀尾佳貴,安達泰治
    • Organizer
      日本機械学会第32回バイオフロンティア講演会
  • [Presentation] Mechanical modeling of brain morphogenesis caused by multicellular dynamics2022

    • Author(s)
      Yoshitaka Kameo, Hironori Takeda, Taiji Adachi
    • Organizer
      International Symposium on Development and Plasticity of Neural System
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] 神経細胞の増殖と移動にともなう脳形態形成の数理モデリング2021

    • Author(s)
      亀尾佳貴, 竹田宏典, 安達泰治
    • Organizer
      第60回日本生体医工学会大会
  • [Presentation] 生体組織の形態形成の理解に向けた連続体力学シミュレーション2021

    • Author(s)
      竹田宏典, 亀尾佳貴, 安達泰治
    • Organizer
      日本機械学会第33回バイオエンジニアリング講演会
  • [Presentation] 神経線維の配向による材料異方性を考慮した小脳しわ形成の有限要素解析2021

    • Author(s)
      山口嵩洋, 竹田宏典, 亀尾佳貴, 安達泰治
    • Organizer
      日本機械学会第33回バイオエンジニアリング講演会
  • [Presentation] 生体組織の成長により生じる分岐現象のエネルギー地形に基づく理解2021

    • Author(s)
      竹田宏典,亀尾佳貴,安達泰治
    • Organizer
      日本機械学会M&M2021材料力学カンファレンス
  • [Presentation] Finite Element Analysis of Parallel Folding during Cerebellar Morphogenesis Considering Oriented Nerve Fibers2021

    • Author(s)
      Takahiro Yamaguchi, Hironori Takeda, Yoshitaka Kameo, Taiji Adachi
    • Organizer
      The 11th Asian-Pacific Conference on Biomechanics (APBiomech2021)
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] 細胞移動と組織成長から生じる脳形態形成の有限要素解析2020

    • Author(s)
      竹田宏典,亀尾佳貴,安達泰治
    • Organizer
      日本機械学会第31回バイオフロンティア講演会

URL: 

Published: 2022-12-28  

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