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2019 Fiscal Year Annual Research Report

Understanding of chemical communications and higher-order functional evaluation of bioactive ligands by spatiotemporal analysis

Planned Research

Project AreaFrontier research of chemical communications
Project/Area Number 17H06409
Research InstitutionOsaka University

Principal Investigator

菊地 和也  大阪大学, 工学研究科, 教授 (70292951)

Project Period (FY) 2017-06-30 – 2022-03-31
Keywords化学プローブ / 破骨細胞 / 内在性膜蛋白質 / 時空間解析 / 蛍光イメージング
Outline of Annual Research Achievements

本研究では、これまで開発してきた化学プローブを用いた時空間解析技術を統合し、天然・人工リガンドとなる化合物の動作原理を可視化して示すことを目的と する。測定したい分子との反応に着目して化学プローブをデザインするという発想を基に、時間を特定して標的となる生体分子に機能性蛍光分子を導入する原理 を開発する。分子認識あるいは酵素反応といった生体内で起こる反応を分光情報(蛍光特性変化等)へ変換できる化学プローブをデザイン・合成する。開発した 化学プローブを応用して、分子リガンドの機能を時空間的に解明するための技術プラットフォームを確立する。本プラットフォームを基盤として、本領域におけ る分野融合研究を推進し、新規生物活性リガンドの高次機能評価・スクリーニングを行い、「化学コミュニケーション」の統合的理解を深める。 具体的な例としては、破骨細胞の骨吸収活性をイメージングする化学プローブの開発、内在性膜タンパク質(GPCR)のリガンド結合に伴う構造変化をイメージン グできる化学プローブの開発を中心に取り組む。
本年度は、骨組織の細胞挙動を探る新たなイメージングプローブの開発に取り組んだ。骨組織表面だけでなく、深部に送達されるようビスフォスホネート構造を骨ミネラル成分であるヒドロキシアパタイトへの結合が弱いリセドロネートを導入し再設計した。pH応答性、及び非応答性のプローブを合成し、それぞれの蛍光強度のpH変化による挙動を調べた。内在性膜蛋白質のリガンド結合に伴う構造変化をイメージングできるプローブの開発においては、細胞膜に結合する環境応答性蛍光色素であるNile redを用い、当研究室で開発されたPYPタグリガンドと連結した蛋白質ラベル化プローブを合成した。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

今年度は骨組織の細胞挙動を探るイメージングプローブにおいて、従来の破骨細胞だけでなく、より深部に位置する骨細胞の活性を検出可能なプローブをデザイン、合成することができた。また、内在性膜蛋白質の機能をイメージングできるプローブ開発も順調に進んでいる。

Strategy for Future Research Activity

今後は、骨細胞の機能を可視化するために二光子励起顕微鏡を用いたイメージングを行う。骨組織表面だけでなく、より組織内部の骨小腔に焦点を当ててイメージングを行うことで、骨細胞の機能を可視化する。骨小腔のpHを可視化することで、骨細胞による骨組織の吸収(骨細胞性骨溶解)の検出を目指す。また、生理活性リガンドによって骨小腔のpHがどのように変わるかをイメージングによって明らかにする。内在性蛋白質のイメージングについては、標的となる内在性膜蛋白質を特異的に認識するラクダ科動物由来抗体断片(ナノボディ)を用い、当研究室で開発したPYPタグを融合発現させた蛋白質を調製する。ここに、標的結合時に蛍光強度を上昇させる環境応答性色素を用いたプローブを結合させることで、小分子・蛋白質ハイブリッドプローブを創製する。ハイブリッドプローブのナノボディが標的膜蛋白質を認識すると、色素が細胞膜に近接、結合し蛍光強度が上昇すると考えられる。このプローブを応用し、内在性膜蛋白質の機能をイメージングによって検出する系を確立する。

  • Research Products

    (14 results)

All 2020 2019

All Journal Article (8 results) (of which Int'l Joint Research: 3 results,  Peer Reviewed: 8 results,  Open Access: 2 results) Presentation (6 results) (of which Int'l Joint Research: 4 results,  Invited: 6 results)

  • [Journal Article] Sensing Peroxynitrite in Different Organelles of Murine RAW264.7 Macrophages With Coumarin-Based Fluorescent Probes2020

    • Author(s)
      Weber Maria、Yamada Namiko、Tian Xue、Bull Steven D.、Minoshima Masafumi、Kikuchi Kazuya、Mackenzie Amanda B.、James Tony D.
    • Journal Title

      Frontiers in Chemistry

      Volume: 8 Pages: 39

    • DOI

      10.3389/fchem.2020.00039

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Engineered Protein-tag for Rapid Live-cell Fluorogenic Visualization of Proteins by Anionic Probes2020

    • Author(s)
      Gao Jingchi、Hori Yuichiro、Nishiura Miyako、Bordy Mathieu、Hasserodt Jens、Kikuchi Kazuya
    • Journal Title

      Chemistry Letters

      Volume: 49 Pages: 232~235

    • DOI

      10.1246/cl.190875

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Live-Cell Imaging of Protein Degradation Utilizing Designed Protein-Tag Mutant and Fluorescent Probe with Turn-Off Switch2019

    • Author(s)
      Gao Jingchi、Hori Yuichiro、Takeuchi Osamu、Kikuchi Kazuya
    • Journal Title

      Bioconjugate Chemistry

      Volume: 31 Pages: 577~583

    • DOI

      10.1021/acs.bioconjchem.9b00696

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Photolytic Release of a Caged Inhibitor of an Endogenous Transcription Factor Enables Optochemical Control of CREB-Mediated Gene Expression2019

    • Author(s)
      Imoto Takuma、Kawase Akihiro、Minoshima Masafumi、Yokoyama Tatsushi、Bito Haruhiko、Kikuchi Kazuya
    • Journal Title

      Organic Letters

      Volume: 22 Pages: 22~25

    • DOI

      10.1021/acs.orglett.9b03568

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Development of Fluorogenic Probes for Rapid High‐Contrast Imaging of Transient Nuclear Localization of Sirtuin?32019

    • Author(s)
      Gao Jingchi、Hori Yuichiro、Shimomura Takashi、Bordy Mathieu、Hasserodt Jens、Kikuchi Kazuya
    • Journal Title

      ChemBioChem

      Volume: 21 Pages: 656~662

    • DOI

      10.1002/cbic.201900568

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Improvement in Photostability of Fluorescein by Lanthanide Ions Based on Energy Transfer-based Triplet State Quenching2019

    • Author(s)
      Imoto Takuma、Muramatsu Masayasu、Miyasaka Hiroshi、Mizukami Shin、Kikuchi Kazuya
    • Journal Title

      Chemistry Letters

      Volume: 48 Pages: 1181~1184

    • DOI

      10.1246/cl.190469

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] In Vivo Multicolor Imaging with Fluorescent Probes Revealed the Dynamics and Function of Osteoclast Proton Pumps2019

    • Author(s)
      Minoshima Masafumi、Kikuta Junichi、Omori Yuta、Seno Shigeto、Suehara Riko、Maeda Hiroki、Matsuda Hideo、Ishii Masaru、Kikuchi Kazuya
    • Journal Title

      ACS Central Science

      Volume: 5 Pages: 1059~1066

    • DOI

      10.1021/acscentsci.9b00220

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Chemical Tools with Fluorescence Switches for Verifying Epigenetic Modifications2019

    • Author(s)
      Hori Yuichiro、Kikuchi Kazuya
    • Journal Title

      Accounts of Chemical Research

      Volume: 52 Pages: 2849~2857

    • DOI

      10.1021/acs.accounts.9b00349

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] New Biological Findings which were Revealed by Designed Fluorescent Probes2019

    • Author(s)
      Kazuya Kikuchi
    • Organizer
      Chemical Biology & Physiology Conference 2019
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] In vivo Multicolor Imaging with Fluorescent Probes Revealed Dynamics and Function of Osteoclast Proton Pumps2019

    • Author(s)
      Kazuya Kikuchi
    • Organizer
      16th International, Methods & Applications of Fluorescence (Roger Y Tsien Memorial Symposium)
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] in vivo Chemical Probes for MRI and Fluorescence Imaging2019

    • Author(s)
      Kazuya Kikuchi
    • Organizer
      ICBIC-19, International Conference on Biological Inorganic Chemistry
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Development of Multifunctional 19F MRI Contrast Agents Based on Fluorine-encapsulated Silica Nanoparticle2019

    • Author(s)
      Kazuya Kikuchi
    • Organizer
      The Future of Molecular MR: A Cellular and Molecular Imaging Workshop
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] 化学プローブによって明らかになった生命現象2019

    • Author(s)
      菊地和也
    • Organizer
      日本分析化学会第68年会
    • Invited
  • [Presentation] イメージングプローブのデザイン・合成によるケミカルバイオロジー研究2019

    • Author(s)
      菊地和也
    • Organizer
      第19回日本蛋白質科学会年会 第71回日本細胞生物学会大会 合同年次学会
    • Invited

URL: 

Published: 2021-12-27  

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