2007 Fiscal Year Annual Research Report
| Project Area | Genome Barriers in Plant Reproduction |
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18075012
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| Research Institution | National Institute of Genetics |
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Principal Investigator |
倉田 のり National Institute of Genetics, 系統生物研究センター, 教授 (90178088)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
渡辺 正夫 東北大学, 大学院・生命科学研究科, 教授 (90240522)
堤 伸浩 東京大学, 大学院・農学生命科学研究科, 教授 (00202185)
鳥山 欽哉 東北大学, 大学院・農学研究科, 教授 (20183882)
松岡 信 名古屋大学, 生物機能開発利用研究センター, 教授 (00270992)
服部 束穂 名古屋大学, 生物機能開発利用研究センター, 教授 (10164865)
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| Keywords | 植物生殖 / 発現解析 / マイクロアレイ |
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| Research Abstract |
「植物ゲノム障壁」の支援班における研究サポートは、(1)生殖の全過程について、マイクロアレイによる遺伝子発現プロファイルを作成し、遺伝子発現の全体像を基盤情報として整備する(2)これらの情報解析をサポートするツールを提供して速やかに個々の班員の研究に役立てること、(3)個別課題のマイクロアレイ実験をサポートすること、である。この目的に沿って、今年度は以下の成果を得た。十分な解析情報を得てきわめて有用なデータ共有利用システムが作ることができ、班員個別研究のサポートも効率よく行う事ができた。
1、イネ生殖ステージの発現プロフィール解析
イネ生殖ステージは、穎花または葯で10ステージ12組織、受粉から受精までの柱頭および子房で5ステージ7組織、受精から胚乳分化発生期までの5ステージ10組織からサンプルを収集し、Affymetrix社のアレイを用いて全組織についてのハイブリダイゼーション実験と発現データの取得が終了した。また減数分裂期から成熟花粉形成までの葯サンプルを、レーザーマイクロダイセクションにより花粉母細胞とタペート組織に切り分け、ステージ毎のRNAでアレイ実験を実施した。
2、イネ生殖ステージの発現情報の効率的解析システムの構築
これらのデータは、公募課題により構築されたデータベース"Oryza Express"より班内公開を開始し、全遺伝子の発現検索が可能となった。このシステムを用いて、個々の班員の研究も加速している。
3、イネ、アラビドプシス、オオムギのアレイ解析実験のサポート
班員からの要望を受け、7課題の総計44アレイ実験を実施し、データを返送した。
今後の予定としては、生殖ステージにおける5万の遺伝子の発現変動(パターンおよび発現量)を種々の方法で解析し論文にまとめると同時に、個々のステージにおいての特徴的発現遺伝子の機能解析についても、発生プログラムとの関連づけを目指して解析を進める予定である。
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