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2021 Fiscal Year Annual Research Report

Functional regulation of ubiquitin chains using chemo-technologies

Planned Research

Project AreaNew frontier for ubiquitin biology driven by chemo-technologies
Project/Area Number 18H05499
Research InstitutionKyoto University

Principal Investigator

岩井 一宏  京都大学, 医学研究科, 教授 (60252459)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 二木 史朗  京都大学, 化学研究所, 教授 (50199402)
Project Period (FY) 2018-06-29 – 2023-03-31
Keywordsユビキチン / ユビキチンシグナル / 炎症シグナル / 直鎖状ユビキチン鎖
Outline of Annual Research Achievements

本研究ではケモテクノロジーを用いて5年間の研究期間中にユビキチン修飾の多様な機能を解析することを目指す。4年目である本年度は以下の3項目から研究を推進した。
1.ケモテクノロジーを用いたLUBACリガーゼの制御とその応用展開:研究代表者らはLUBACによる直鎖状ユビキチン鎖生成はB細胞リンパ腫発症に寄与することを示していたが、他の計画研究の代表である吉田と開発したLUBAC阻害剤を用いて、LUBACがBリンパ腫の増殖を抑制することを個体レベルで示した(Jo et al. Blood 2020)。さらに、LUBAC複合体の結晶構造を踏まえた新規LUBAC抑制剤の開発も進めている。これまでの解析でリード化合物が取得できなかったので、AI創薬に着手した。
2.ユビキチン修飾の新機能のケモテクノロジー解析:M1鎖とUBDの結合阻害の試験管内スクリーニング系でM1鎖とHOIL-1L NZFの結合を阻害する化合物を同定した。さらに基礎的検討で同化合物が細胞内でもM1鎖とHOIL-1L NZFの結合を阻害する可能性を見出している。また、HOIL-1L、SHARPINのNZFと直鎖状ユビキチン鎖との結合阻害によって、刺激依存的に細胞を死に導くことができることを示す予備的知見を得た。
3. LUBACはHOIP、HOIL-1L、SHARPINの3サブユニットから構成され、活性中心であるHOIPだけでなく、HOIL-1Lもユビキチンリガーゼ活性を持つ。本年度、研究代表者らはHOIL-1Lリガーゼ活性を欠失がLUBACのM1鎖形成能を亢進させて細胞内感染菌の感染を抑制することを見出した。そこで、HOIL-1Lユビキチンリガーゼ活性阻害剤のスクリーニング系を構築して、吉田とともに化合物の一次スクリーニングを施行し、LUBAC賦活剤の生成に挑んでいる。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

本領域の吉田とともに開発してきた個体に投与可能なLUBAC阻害剤がB細胞リンパ腫の治療薬となることのPOCが取得できたので、本領域でより副作用の少ない阻害剤開発を推進している。

Strategy for Future Research Activity

ケミカルツールを用いたユビキチン系の解析をより一層推進する。

  • Research Products

    (9 results)

All 2022 2021

All Journal Article (5 results) (of which Peer Reviewed: 5 results) Presentation (4 results) (of which Int'l Joint Research: 2 results,  Invited: 3 results)

  • [Journal Article] Glycogen synthase downregulation rescues the amylopectinosis of murine RBCK1 deficiency2022

    • Author(s)
      Nitschke S, Sullivan MA, Mitra S, Marchioni CR, Lee JPY, Smith BH, Ahonen S, Wu J, Chown EE, Wang P, Petkovic S, Zhao X, DiGiovanni LF, Perri AM, Israelian L, Grossman TR, Kordasiewicz H, Vilaplana F, Iwai K, Nitschke F, Minassian BA
    • Journal Title

      Brain

      Volume: In press Pages: In press

    • DOI

      10.1093/brain/awac017

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] ABIN1 is a signal‐induced autophagy receptor that attenuates NF‐κB activation by recognizing linear ubiquitin chains2022

    • Author(s)
      Shinkawa Y, Imami K, Fuseya Y, Sasaki K, Ohmura K, Ishihama Y, Morinobu A, Iwai K.
    • Journal Title

      FEBS Letters

      Volume: In press Pages: In press

    • DOI

      10.1002/1873-3468.14323

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Loss of peptide: N-glycanase causes proteasome dysfunction mediated by a sugar-recognizing ubiquitin ligase2021

    • Author(s)
      Yoshida Y, Asahina M, Murakami A, Kawawaki J, Yoshida M, Fujinawa R, Iwai K, Tozawa R, Matsuda N, Tanaka K and Suzuki T.
    • Journal Title

      Proceedings of the National Academy of Sciences

      Volume: 118 Pages: e2102902118

    • DOI

      10.1073/pnas.2102902118

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Expression, solubility monitoring, and purification of the co-folded LUBAC LTM domain by structure-guided tandem folding in autoinducing cultures2021

    • Author(s)
      Walinda E, Morimoto D, Sorada T, Iwai K and Sugase K
    • Journal Title

      Protein Expression and Purification

      Volume: 187 Pages: 105953~105953

    • DOI

      10.1016/j.pep.2021.105953

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Liquid Droplet Formation and Facile Cytosolic Translocation of IgG in the Presence of Attenuated Cationic Amphiphilic Lytic Peptides2021

    • Author(s)
      Iwata T, Hirose H, Sakamoto K, Hirai Y, Arafiles JVV, Akishiba M, Imanishi M, Futaki S
    • Journal Title

      Angewandte Chemie International Edition

      Volume: 60 Pages: 19804~19812

    • DOI

      10.1002/anie.202105527

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] Linear ubiquitination : a new regulator of chronic inflammation and oncogenesis2021

    • Author(s)
      Iwai, K.
    • Organizer
      第44日本基礎老化学会大会 International Symposium “Mechanism of aging”
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] 直鎖状ユビキチン鎖の発見とその機能2021

    • Author(s)
      岩井 一宏
    • Organizer
      第94回日本生化学会大会シンポジウム 「プロテオスタシスの理解と革新的医療の創出」
  • [Presentation] 炎症応答を制御するユニークなユビキチン修飾系と炎症性疾患への寄与2021

    • Author(s)
      岩井 一宏
    • Organizer
      第30回関西ライフサイエンス リーディングサイエンティストセミナー
    • Invited
  • [Presentation] Attenuated cationic lytic peptides for intracellular delivery2021

    • Author(s)
      Futaki, S.
    • Organizer
      The 2021 International Chemical Congress of Pacific Basin Societies (Pacifichem 2021)
    • Int'l Joint Research / Invited

URL: 

Published: 2022-12-28  

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