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2008 Fiscal Year Annual Research Report

酵母ミトコンドリア・小胞体タンパク質の機能発現・秩序維持システムの解明

Planned Research

Project AreaProtein community: organization and maintenance of protein functions
Project/Area Number 19058005
Research InstitutionNagoya University

Principal Investigator

遠藤 斗志也  Nagoya University, 大学院・理学研究科, 教授 (70152014)

Keywordsミトコンドリア / 酵母 / トランスロケータ / 小胞体 / 膜透過 / 品質管理
Research Abstract

(1) ミトコンドリア膜間部でジスルフィド結合を導入するTim40の結晶構造の決定
ミトコンドリア膜間部のタンパク質にジスルフィド結合を導入するTim40コアドメインについて, MBPとの融合タンパク質として結晶化, X線で構造を決定した。Tim40の三つのジスルフィド結合のうち一つが露出度が高く, 基質へのジスルフィド結合導入に直接関与すると考えられた。MBPとのリンカー部分はTim40の疎水性領域にヘリックス構造をつくって結合しており, 基質-Tim40相互作用を反映しているものと考えられた。
(2) ミトコンドリア内膜トランスロケータTIM23複合体の作動機構の解明
ミトコンドリア内膜膜透過装置TIM23複合体のサブユニットであるTim23とTim50が, その膜間部ドメインの相互作用を介して, 外膜から内膜へのタンパク質の受け渡しの効率を上げると共に, 内膜通過に必要なマトリクスのモータタンパク質群の活性化のスイッチを入れることができることを見いだした。
(3) 小胞体品質管理におけるMnl1p-PDI複合体の役割の解明
研究代表者らが発見した酵母小胞体Mnl1pと相互作用する因子として, ジスルフィドイソメラーゼ(PDI)を同定した。PDIはMnl1pのC端ドメインに結合して, 機能に必須のN端ドメインへの適切なジスルフィド結合導入を促進するが, ジスルフィド結合が形成された後もMnl1pと相互作用し続ける。PDIは従来は小胞体内では酸化型になっていると言われていたが, 還元型も存在することを見いだした。したがってPDIは異常タンパク質をMnl1pが認識すると異常タンパク質のジスルフィド結合を還元切断する, シャペロンとして可溶性に保つ, などの働きをすることで異常タンパク質の分解に貢献することが考えられる。

  • Research Products

    (37 results)

All 2009 2008

All Journal Article (7 results) (of which Peer Reviewed: 7 results) Presentation (29 results) Book (1 results)

  • [Journal Article] Structural stabilities of different regions of the titin I27 domain contribute differently to unfolding upon mitochondrial protein import2009

    • Author(s)
      T. Oguro, K. Yagawa, T. Momose, T. Sato, K. Yamano, and T. Endo
    • Journal Title

      J. Mol. Biol. 385

      Pages: 811-819

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Tim 23-Tim 50 pair coordinates functions of translocators and motor proteins in mitochondrial protein import2009

    • Author(s)
      Y. Tamura, Y. Harada, T. Shiota, K. Yamano, K. Watanabe, M. Yokota, H. Yamamoto, H. Sesaki, and T. Endo
    • Journal Title

      J. Cell Biol. 184

      Pages: 129-141

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Roles of protein disulfide isomerase-mediated disulfide bond formation of yeast Mnl1p in ER-associated degradation2009

    • Author(s)
      M. Sakoh-Nakatogawa, S. Nishikawa, and T. Endo
    • Journal Title

      J. Biol. Chem. 284

      Pages: 11815-11825

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Step size analyses of the mitochondrial Hsp70 import motor reveal the Brownian ratchet in operation2008

    • Author(s)
      K. Yamano, M. Kuroyanagi-Hasegawa, M. Esaki, M. Yokota, and T. Endo
    • Journal Title

      J. Biol. Chem. 283

      Pages: 27325-27332

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Identification and characterization of a Jemlp ortholog of Candida albicans : dissection of Jemlp functions in karyogamy and protein quality control in Saccharomyces cerevisiae2008

    • Author(s)
      T. Makio, S. Nishikawa, T. Nakayama, H. Nagai, and T. Endo
    • Journal Title

      Genes Cells 13

      Pages: 1015-1026

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Arabidopsis thaliana has a set of Jproteins in the endoplasmic reticulum that are conserved from yeast to animals and plants2008

    • Author(s)
      M. Yamamoto, D. Maruyama, T. Endo, and S. Nishikawa
    • Journal Title

      Plant Cell Physiol. 49

      Pages: 1547-1562

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Nuclear inner membrane fusion facilitated by yeast Jemlp is required for spindlepole body fusion but not for the first mitotic nuclear division during yeast mating2008

    • Author(s)
      S. Nishikawa, A. Hirata, and T. Endo
    • Journal Title

      Genes Cells 13

      Pages: 1185-1195

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] シロイヌナズナの生育における小胞体Jタンパク質(AtERdj3B)の解析2009

    • Author(s)
      山本雅也, 遠藤斗志也, 西川周一
    • Organizer
      第50回日本植物生理学会
    • Place of Presentation
      名古屋
    • Year and Date
      20090321-24
  • [Presentation] シロイヌナズナの雌性配偶体形成における小胞体Hsp70システムの機能解析2009

    • Author(s)
      丸山大輔, 山本雅也, 遠藤斗志也, 西川周一
    • Organizer
      第50回日本植物生理学会
    • Place of Presentation
      名古屋
    • Year and Date
      20090321-24
  • [Presentation] Structural basis of molecular recognition in mitochondrial protein import2009

    • Author(s)
      Toshiya Endo
    • Organizer
      International Symposium on Molecular Soft Interactions in Biological Systems
    • Place of Presentation
      Osaka
    • Year and Date
      20090122-23
  • [Presentation] Analyses of ER J protiens (AtERdj 3 B) in Arabidopsis thaliana2009

    • Author(s)
      Masaya Yamamoto, Toshiya Endo, and Shuh-ichi Nishikawa
    • Organizer
      The 1 st G-COE International Symposium on Elucidation and Desion of Materials and Molecular Function
    • Place of Presentation
      Nagoya
    • Year and Date
      20090113-14
  • [Presentation] Roles of protein disulfide isomerase-mediated disulfide bond formation of yeast Mnlln in ER-associated degradation2009

    • Author(s)
      Machiko Sakoh-Nakatogawa, Shuh-ichi Nishikawa. and Toshiva Endo
    • Organizer
      The 1 st G-COE International Symposium on Elucidation and Design of Materials and Molecular Function
    • Place of Presentation
      Nagoya
    • Year and Date
      20090113-14
  • [Presentation] Analysis of function of Pam 18, the subunit of the mitochondrial membrane translocator2009

    • Author(s)
      Mayumi Matunaga, Koji Yamano, an d Toshiya Endo
    • Organizer
      The 1 st G-COE International Symposium on Elucidation and Design of Materials and Molecular Function
    • Place of Presentation
      Nagoya
    • Year and Date
      20090113-14
  • [Presentation] ミトコンドリアジスルフィド結合導入タンパク質Tim40の構造解析2009

    • Author(s)
      河野慎, 百瀬隆喜, 寺尾佳代子, 山野晃史, 渡邉信久, 遠藤斗志也
    • Organizer
      生物物理学会中部支部講演会
    • Place of Presentation
      名古屋
    • Year and Date
      2009-03-31
  • [Presentation] he Hsp70 system in the endoplasmic reticulum is required for female gametogenesis in Arabidopsis thaliana2008

    • Author(s)
      Shuh-ichi Nishikawa, Daisuke Maruyama, Masaya Yamamoo, Saoko Noma, and Toshiya Endo
    • Organizer
      シンポジウム「拡大する品質管理の概念」BMB2008(第31回日本分子生物学会年会,第81回日本生化学会合同大会)
    • Place of Presentation
      神戸
    • Year and Date
      20081209-12
  • [Presentation] Biogenesis of beta-barrel proteins in the mitochondrial outer membrane2008

    • Author(s)
      Koji Yamano, Sachiko Tanaka, and Toshiva Endo
    • Organizer
      シンポジウム「タンパク質機能発現システム-シャペロンからトランスロケータまで」BMB2008(第31回日本分子生物学会年会, 第81回日本生化学会合同大会)
    • Place of Presentation
      神戸
    • Year and Date
      20081209-12
  • [Presentation] in vivo部位特異的光架橋法によるミトコンドリア外膜膜透過装置構成因子Tom22の機能解析2008

    • Author(s)
      塩田拓也, 間渕英, 山野晃史, 田村康, 遠藤斗志也
    • Organizer
      BMB2008(第31回日本分子生物学会年会,第81回日本生化学会合同大会)
    • Place of Presentation
      神戸
    • Year and Date
      20081209-12
  • [Presentation] Protein disulfide isomerase(PDI)は酵母小胞体関連分解因子Mnl1pのC末端領域を足場として, N末端ドメインにジスルフィド結合を導入する2008

    • Author(s)
      中戸川真智子, 西川周一, 遠藤斗志也
    • Organizer
      BMB2008(第31回日本分子生物学会年会,第81回日本生化学会合同大会)
    • Place of Presentation
      神戸
    • Year and Date
      20081209-12
  • [Presentation] 植物細胞における小胞体関連分解(ERAD)機構の解析2008

    • Author(s)
      山本雅也, 川鍋光慶, 林陽子, 遠藤斗志也, 西川周一
    • Organizer
      BMB2008(第31回日本分子生物学会年会, 第81回日本生化学会合同大会)
    • Place of Presentation
      神戸
    • Year and Date
      20081209-12
  • [Presentation] シロイヌナズナの雌性配偶体形成時の核融合に必要な小胞体Hsp70システムの解析2008

    • Author(s)
      丸山大輔, 山本雅也, 遠藤斗志也, 西川周一
    • Organizer
      BMB2008(第31回日本分子生物学会年会, 第81回日本生化学会合同大会)
    • Place of Presentation
      神戸
    • Year and Date
      20081209-12
  • [Presentation] ミトコンドリア行きシグナルとその受容体Tom20の同時改変2008

    • Author(s)
      水谷和揮, 吉久徹, 遠藤斗志也
    • Organizer
      BMB2008(第31回日本分子生物学会年会, 第81回日本生化学会合同大会)
    • Place of Presentation
      神戸
    • Year and Date
      20081209-12
  • [Presentation] ミトコンドリア膜透過装置維持に働くTam41のマルチコピーサプレッサータンパク質Sta65の機能解析2008

    • Author(s)
      原田佳宗, 遠藤斗志也
    • Organizer
      BMB2008(第31回日本分子生物学会年会,第81回日本生化学会合同大会)
    • Place of Presentation
      神戸
    • Year and Date
      20081209-12
  • [Presentation] ミトコンドリア移行シグナル認識におけるTom70の役割2008

    • Author(s)
      福井健, 高橋央, 北村真吾, 山野晃史, 横田美穂子, 遠藤斗志也
    • Organizer
      BMB2008(第31回日本分子生物学会年会, 第81回日本生化学会合同大会)
    • Place of Presentation
      神戸
    • Year and Date
      20081209-12
  • [Presentation] 小胞体関連分解においてタンパク質の異常構造, 糖鎖修飾はどのように認識されるのか?2008

    • Author(s)
      井澤俊明, 永井宏征, 遠藤斗志也, 西川周一
    • Organizer
      BMB2008(第31回日本分子生物学会年会,第81回日本生化学会合同大会)
    • Place of Presentation
      神戸
    • Year and Date
      20081205-12
  • [Presentation] NMRによるtitin 127変異体の力学的安定化機構の解明2008

    • Author(s)
      Keisuke Yagawa, Takaomi Oguro, Masahiro Maeda, Takehiro Sato, Takaki Momose, and Toshiya Endo
    • Organizer
      第46回生物物理学会年会
    • Place of Presentation
      福岡
    • Year and Date
      20081203-05
  • [Presentation] NMRを用いたミトコンドリアタンパク質輸送因子Tim21と呼吸鎖構成因子Qcr6との相互作用2008

    • Author(s)
      Takashi Yashiro, Takashi Yokoyama, Keiko Morishita, Masahiro Maeda, Takaki Momose, Kaori Wakamatsu, and Toshiya Endo
    • Organizer
      第46回生物物理学会年会
    • Place of Presentation
      福岡
    • Year and Date
      20081203-05
  • [Presentation] Scaffold-mediated disulfide bond formation in Mnl1p by PDI in Saccharomy cescerevisiae2008

    • Author(s)
      Machiko Nakatogawa, Shuh-ichi Nishikawa, and Toshiya Endo
    • Organizer
      EMBO Conference on Control, Co-ordination and Regulation of Protein Targeting and Translocation
    • Place of Presentation
      Saint Maxime, France
    • Year and Date
      20081025-29
  • [Presentation] Mdm 10-Tom 7 pair functions in assembly of Tom 40, a major beta-barrel protein in the mitochondrial outer membrane2008

    • Author(s)
      Koji Yamano, Sachiko Tanaka, and Toshiya Endo
    • Organizer
      EMBO Conference on Control, Co-ordination and Regulation of Protein Targeting and Translocation
    • Place of Presentation
      Saint Maxime, France
    • Year and Date
      20081025-29
  • [Presentation] Coordinated functions of mitochondrial translocator proteins for protein translocation across and into the membranes2008

    • Author(s)
      Toshiya Endo
    • Organizer
      EMBO Conference on Control, Co-ordination and Regulation of Protein Targeting and Translocation
    • Place of Presentation
      Saint Maxime, France
    • Year and Date
      20081025-25
  • [Presentation] 小胞体関連分解の基質認識機構におけるタンパク質の高次構造形成と糖鎖修飾の役割-改変した新規基質を用いた解析2008

    • Author(s)
      井澤俊明, 永井宏征, 遠藤斗志也, 西川周一
    • Organizer
      酵母遺伝学フォーラム第41回研究報告会
    • Place of Presentation
      札幌
    • Year and Date
      20080910-12
  • [Presentation] Control and alteration of protein traffic in the cell2008

    • Author(s)
      Toshiya Endo
    • Organizer
      The Uehara Memorial Foundaton Symposium "System Biology : The Challenge of Complexity"
    • Place of Presentation
      Tokyo
    • Year and Date
      20080630-0702
  • [Presentation] PDIによる酵母小胞体関連分解因子Mnl1pへのジスルフィド結合導入機構2008

    • Author(s)
      中戸川万智子, 西川周一, 遠藤斗志也
    • Organizer
      第8回日本蛋白質科学会年会ワークショップ「細胞品質管理に関わるジスルフィドネットワーク」
    • Place of Presentation
      東京
    • Year and Date
      20080610-12
  • [Presentation] In vivo部位特異的光架橋法によるミトコンドリア外膜膜透過装置構成因子Tom22のサブユニット間相互作用の解析2008

    • Author(s)
      塩田拓也, 間渕英, 山野晃史, P. G. Schultz, 遠藤斗志也
    • Organizer
      第72回生化学会中部支部例会
    • Place of Presentation
      岐阜
    • Year and Date
      2008-05-24
  • [Presentation] NMRによるβサンドイッチ型タンパク質titin I27変異体の力学的安定化機構の解明2008

    • Author(s)
      矢川啓介, 小黒隆臣, 前田正洋, 佐藤健大, 百瀬隆喜, 遠藤斗志也
    • Organizer
      第72回生化学会中部支部例会
    • Place of Presentation
      岐阜
    • Year and Date
      2008-05-24
  • [Presentation] 小胞体分子シャペロンPDIによる酵母小胞体関連分解因子Mnl1pへのユニークなジスルフィド結合導入機構2008

    • Author(s)
      中戸川万智子, 西川周一, 遠藤斗志也
    • Organizer
      第72回生化学会中部支部例会
    • Place of Presentation
      岐阜
    • Year and Date
      2008-05-24
  • [Presentation] 小胞体関連分解の基質認識機構におけるタンパク質の高次構造形成と糖鎖就職の役割-改変した新規基質を用いた解析2008

    • Author(s)
      井澤俊明, 永井宏征, 西川周一, 遠藤斗志也
    • Organizer
      第72回生化学会中部支部例会
    • Place of Presentation
      岐阜
    • Year and Date
      2008-05-24
  • [Book] Systems Biology - The Challenge of Complexity (eds. S. Nakanishi, R. Kageyama, and D. Watanabe)2009

    • Author(s)
      T. Endo
    • Total Pages
      129-134
    • Publisher
      Control and alteration of protein traffic in the cell

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Published: 2010-06-11   Modified: 2016-04-21  

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