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2011 Fiscal Year Annual Research Report

メリステムにおける遺伝子産物の発現と細胞内動態の高感度解析

Planned Research

Project AreaPlant regulatory systems that control developmental interactions between meristems and lateral organs
Project/Area Number 19060016
Research InstitutionKyoto University

Principal Investigator

荒木 崇  京都大学, 生命科学研究科, 教授 (00273433)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 福田 裕穂  東京大学, 理学系研究科, 教授 (10165293)
Keywords植物 / 生体分子 / 網羅的遺伝子解析 / 分子間相互作用 / イメージング / マイクロアレイ / タイリングアレイ / ジーンチップ
Research Abstract

5年度目に当たる本年度は、公募班員を含む班員に対する支援事業を進めた。
本支援班の一つ目の目的は、シロイヌナズナ23K-DNAチップ、ヒャクニチソウDNAチップ、シロイヌナズナタイリングアレイを用いた網羅的な遺伝子発現解析を行い、そのデータを提供することである。本年度は、6研究室から延べ34件の遺伝子解析の依頼があった。これらの依頼に応えて解析を行い、その遺伝子発現データを班員に戻した。これらの解析から、メリステム関連遺伝子の発現プロファイルの取得、側根形成を支配する遺伝子の発現パターンの解明、WOX4下流遺伝子の同定、篤部関連遺伝子の同定など、植物メリステム研究に寄与する多くの成果があがった。
また、本支援班では、蛍光標識したタンパク質の組織内細胞内局在の解析の技術情報や、植物細胞内におけるタンパク質間相互作用解析のためのベクターなどを整備し班員に提供するとともに、必要な班員には共焦点レーザー顕微鏡の利用の便を図ることも目的としている。本年度は、分子量の小さい蛍光タグとしてテトラシステイン・タグ(ルミオ・タグ)の利用可能性を検討した。背景のシグナルが強いことから、植物における蛍光タグとしての利用には改善が必要なことがわかった。また、改良が加えられたimproved LOV(iLOV)ドメインの利用可能性の検討に着手した。以上に加え、BiFC法によるタンパク質間相互作用解析のためのベクターの配布1件と2件(2研究室)、の共焦点レーザー顕微鏡観察の技術支援をおこなった。
2011年11月には、連携研究者である奈良先端大・島本功教授がオーガナイザーとなり、テクニカル・ワークショップ「プロテオミクスを生命科学に活かす10の方法プロテオミクスを生命科学に活かす10の方法」(奈良先端大・植物グローバル教育プロジェクトとの共催)をおこない、技術交流を図った。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

班員に対する支援事業、その基礎となる研究、テクニカルワークショップの開催(奈良先端大・植物グローバル教育プロジェクトとの共催)の3点に関して、着実に実績を重ねていると考えられるため。

Strategy for Future Research Activity

平成24年度は最終年度に当たる。研究計画の変更はない。これまで通り、班員に対するシロイヌナズナDNAチップ、ヒャクニチソウDNAチップ、シロイヌ・ナズナタイリングアレイを用いた網羅的な遺伝子発現解析の支援、茎頂メリステムの細胞動態を解析するための材料提供と共焦点レーザー顕微鏡を用いた解析の支援などをおこなう。また、技術ワークショップを奈良先端大の植物グローバル教育プロジェクトとの共催により開催し、班員に対する情報提供をおこなう。

  • Research Products

    (30 results)

All 2012 2011

All Journal Article (10 results) (of which Peer Reviewed: 10 results) Presentation (19 results) Book (1 results)

  • [Journal Article] CRYPTIC PRECOCIOUS/MED12 is a novel flowering regulator with multiple target steps in Arabidopsis2012

    • Author(s)
      Imura, Y., Kobayashi, Y., Yamamoto, S., Furutani, M., Tasaka, M., Abe, M., and Araki, T
    • Journal Title

      Plant & Cell Physiology

      Volume: Vol.53、No.2 Pages: 287-303

    • DOI

      DOI:10.1093/pcp/pcs002

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] The TFL1 homologue KSN is a regulator of continuous flowering in rose and strawberry2012

    • Author(s)
      Iwata, H., Gaston, A., Remay, A., Thouroude, T., Jeauffre, J., Kawamura, K., Oyant, L.H., Araki, T., Denoyes, B., Foucher, F.
    • Journal Title

      Plant Journal

      Volume: 69 Pages: 116-125

    • DOI

      0.1111/j.1365-313X.2011.04776.x

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Dynamics of Arabidopsis SUN proteins during mitosis and involvement in nuclear shaping2011

    • Author(s)
      Oda, Y. and Fukuda, H
    • Journal Title

      Plant Journal

      Volume: Vol.66、No.4 Pages: 629-641

    • DOI

      DOI:10.1111/j.1365-313X.2011.04523.x

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Mitogen-Activated Protein Kinase regulated by the CLAVATA receptors contributes to the shoot apical meristem homeostasis2011

    • Author(s)
      Betsuyaku, S., Takahashi, F., Kinoshita, A., Miwa, H., Shinozaki, K., Fukuda, H., Sawa, S.
    • Journal Title

      Plant & Cell Physiology

      Volume: 52 Pages: 14-29

    • DOI

      10.1093/pcp/pcq157

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] CLE peptides can negatively regulate protoxylem vessel formation via cytokinin signaling2011

    • Author(s)
      Kondo, Y., Hirakawa Y., Kieber, J., Fukuda, H.
    • Journal Title

      Plant & Cell Physiology

      Volume: 52 Pages: 37-48

    • DOI

      10.1093/pcp/pcq129

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] ANGUSTIFOLIA3 plays roles in adaxial/abaxial patterning and growth in leaf morphogenesis2011

    • Author(s)
      Horiguchi, G., Nakayama, H., Ishikawa N., Kubo, M., Demura, T., Fukuda, H., Tsukaya, H.
    • Journal Title

      Plant & Cell Physiology

      Volume: 52 Pages: 112-124

    • DOI

      10.1093/pcp/pcq178

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Establishment and maintenance of vascular cell communities through local signaling2011

    • Author(s)
      Hirakawa Y., Kondo, Y., Fukuda, H.
    • Journal Title

      Current Opinion in Plant Biology

      Volume: 14 Pages: 17-23

    • DOI

      10.1016/j.pbi.2010.09.011

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] The CKH2/PKL chromatin remodeling factor negatively regulates cytokinin responses in Arabidopsis calli2011

    • Author(s)
      Furuta, K., Kubo, M., Sano, K., Demura, T., Fukuda, H., Liu, Y.-G., Shibata, D., Kakimoto, T.
    • Journal Title

      Plant & Cell Physiology

      Volume: 52 Pages: 618-628

    • DOI

      10.1093/pcp/pcr022

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] The CKH1/EER4 gene encoding a TAF12-like protein negatively regulates cytokinin sensitivity in Arabidopsis thaliana2011

    • Author(s)
      Kubo, M., Furuta, K., Demura, T., Fukuda, H., Liu, Y.-G., Shibata, S., Kakimoto, T.
    • Journal Title

      Plant & Cell Physiology

      Volume: 52 Pages: 1095-1106

    • DOI

      10.1093/pcp/pcr060

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] A novel function of TDIF-related peptides : Promotion of axillary bud formation2011

    • Author(s)
      Yaginuma, H., Hirakawa, Y., Kondo, Y., Ohashi-Ito, K., Fukuda, H.
    • Journal Title

      Plant & Cell Physiology

      Volume: 52 Pages: 1354-1364

    • DOI

      10.1093/pcp/pcr081

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] Vascular stem cell fates are controlled by a CLE peptide secreted from the stem cell niche2012

    • Author(s)
      福田裕穂
    • Organizer
      10th TLL Life Sciences symposium "Chemical Communication"
    • Place of Presentation
      Singapore(招待講演)
    • Year and Date
      20120130-20120131
  • [Presentation] Vascular stem cell fates controlled by small peptides2012

    • Author(s)
      福田裕穂、近藤侑貴、平川有宇樹
    • Organizer
      The Croucher Advanced Study Institute Symposium "Frontier in Cell Biology Research", The Chinese University of Hong Kong
    • Place of Presentation
      Hong Kong, China(招待講演)
    • Year and Date
      20120104-20120106
  • [Presentation] Arabidopsis FT florigen in floral transition and beyond2012

    • Author(s)
      荒木崇
    • Organizer
      日本植物生理学会第53回年会
    • Place of Presentation
      京都産業大学(京都市)(シンポジウム)(招待講演)
    • Year and Date
      2012-03-18
  • [Presentation] シロイヌナズナCRYPTIC PRECOCIOUS (CRP)遺伝子の機能解析2012

    • Author(s)
      井村有里, 小林恭士, 山本純子, 古谷将彦, 阿部光知, 田坂昌生, 荒木崇
    • Organizer
      日本植物生理学会第53回年会
    • Place of Presentation
      京都産業大学(京都市)(一般発表)(ポスター)
    • Year and Date
      2012-03-18
  • [Presentation] シロイヌナズナの側芽分裂組織の相転換におけるFTとBRC1/TCP18の役割の解析2012

    • Author(s)
      丹羽優喜, 遠藤求, 荒木崇
    • Organizer
      日本植物生理学会第53回年会
    • Place of Presentation
      京都産業大学(京都市)(一般発表)(口頭)
    • Year and Date
      2012-03-17
  • [Presentation] リシ酸化によるbZIP型転写因子FDの機能制御機構とタンパク質キナーゼの探索2012

    • Author(s)
      川本望, 笹部美知子, 町田泰則, 遠藤求, 荒木崇
    • Organizer
      日本植物生理学会第53回年会
    • Place of Presentation
      京都産業大学(京都市)(一般発表)(口頭)
    • Year and Date
      2012-03-17
  • [Presentation] 構成的アプローチによる植物の生物時計の組織特異的な役割の解明2012

    • Author(s)
      遠藤求, Steve Kay, 荒木崇
    • Organizer
      日本植物生理学会第53回年会
    • Place of Presentation
      京都産業大学(京都市)(一般発表)(口頭)
    • Year and Date
      2012-03-17
  • [Presentation] 植物の成長相転換における制御因子の祖先的機能の探索2012

    • Author(s)
      酒井友希, 荒木崇
    • Organizer
      日本植物生理学会第53回年会
    • Place of Presentation
      京都産業大学(京都市)(シンポジウム)(招待講演)
    • Year and Date
      2012-03-16
  • [Presentation] 花芽形成のマスター制御因子LEAFYの祖先的機能の探索2012

    • Author(s)
      酒井友希, 伊藤美沙, 川本麻美, 宮下結衣, 宇山和樹, 辻井由香, 遠藤求, 石崎公庸, 大和和幸, 河内孝之, 荒木崇
    • Organizer
      日本植物生理学会第53回年会
    • Place of Presentation
      京都産業大学(京都市)(一般発表)(口頭)
    • Year and Date
      2012-03-16
  • [Presentation] 花成研究の動向と今後の展望-モデル植物を中心に-2011

    • Author(s)
      荒木崇
    • Organizer
      園芸学会平成23年度秋季年会
    • Place of Presentation
      岡山大学(岡山市)(シンポジウム)(招待講演)
    • Year and Date
      2011-09-24
  • [Presentation] 苔類ゼニゴケにおけるLEAFY相同遺伝子MpLFYの機能解析2011

    • Author(s)
      酒井友希, 宮下結衣, 宇山和樹, 辻井由香, 遠藤求, 石崎公庸, 大和和幸, 河内孝之, 荒木崇
    • Organizer
      日本植物学会第75回大会
    • Place of Presentation
      東京大学駒場キャンパス(東京都)(一般発表)(口頭)
    • Year and Date
      2011-09-17
  • [Presentation] 苔類ゼニゴケにおけるLEAFY相同遺伝子MpLFYの直接制御標的の探索2011

    • Author(s)
      川本麻美, 酒井友希, 宇山和樹, 辻井由香, 遠藤求, 石崎公庸, 大和和幸, 河内孝之, 荒木崇
    • Organizer
      日本植物学会第75回大会
    • Place of Presentation
      東京大学駒場キャンパス(東京都)(一般発表)(口頭)
    • Year and Date
      2011-09-17
  • [Presentation] FT蛋白質の輸送と茎頂における下流遺伝子の発現制御の解析2011

    • Author(s)
      佐々木陽平, 吉田昌泰, 野田口理孝, 大門靖史, 阿部光知, 遠藤求, 荒木崇
    • Organizer
      日本植物学会第75回大会
    • Place of Presentation
      東京大学駒場キャンパス(東京都)(一般発表)(口頭)
    • Year and Date
      2011-09-17
  • [Presentation] シロイヌナズナFT蛋白質と相互作用する新奇転写因子の探索と花成における機能解析2011

    • Author(s)
      丹羽優喜, 光田展隆, 遠藤求, 高木優, 荒木崇
    • Organizer
      日本植物学会第75回大会
    • Place of Presentation
      東京大学駒場キャンパス(東京都)(一般発表)(口頭)
    • Year and Date
      2011-09-17
  • [Presentation] リン酸化によるbZIP型転写因子FDの機能制御機構の解析2011

    • Author(s)
      川本望, 遠藤求, 笹部美知子, 町田泰則, 荒木崇
    • Organizer
      日本植物学会第75回大会
    • Place of Presentation
      東京大学駒場キャンパス(東京都)(一般発表)(口頭)
    • Year and Date
      2011-09-17
  • [Presentation] 生物時計の組織特異的な機能分担の解析に向けて2011

    • Author(s)
      遠藤求, Steve Kay, 荒木崇
    • Organizer
      日本植物学会第75回大会
    • Place of Presentation
      東京大学駒場キャンパス(東京都)(一般発表)(口頭)
    • Year and Date
      2011-09-17
  • [Presentation] MIDD1 a novel membrane-associated MAP regulating secondary wall patterns2011

    • Author(s)
      福田裕穂
    • Organizer
      18th International Botanical Congress (IBC2011)
    • Place of Presentation
      Melbourne Congress and Exhibition Centre (Melbourne(招待講演)
    • Year and Date
      2011-07-26
  • [Presentation] Functional analysis of MpLFY, the homolog of LEAFY in Marchantia polymorpha(シンポジウムSYM042 "Developmental genetics and cell biology of Marchantia polymorpha")2011

    • Author(s)
      酒井友希, 宮下結衣, 宇山和樹, 辻井由香, 遠藤求, 石崎公庸, 大和和幸, 河内孝之, 荒木崇
    • Organizer
      18th International Botanical Congress (IBC2011)
    • Place of Presentation
      Melbourne Congress and Exhibition Centre (Melbourne(招待講演)
    • Year and Date
      2011-07-25
  • [Presentation] Maintenance of vascular stem cells by a peptide2011

    • Author(s)
      福田裕穂
    • Organizer
      A symposium "Recent Advances in Plant and Microbial Biology" IPMB
    • Place of Presentation
      Taiwan(招待講演)
    • Year and Date
      2011-06-06
  • [Book] In "Methods in Molecular Biology : The Plant Cell Wall", Vol.715(eds.Z.A.Popper)2011

    • Author(s)
      Karkonen, A., Santanen, A., Iwamoto K., Fukuda, H.
    • Total Pages
      310
    • Publisher
      Humana Press

URL: 

Published: 2013-06-26  

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