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2012 Fiscal Year Annual Research Report

メリステムにおける遺伝子産物の発現と細胞内動態の高感度解析

Planned Research

Project AreaPlant regulatory systems that control developmental interactions between meristems and lateral organs
Project/Area Number 19060016
Research InstitutionKyoto University

Principal Investigator

荒木 崇  京都大学, 生命科学研究科, 教授 (00273433)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 福田 裕穂  東京大学, 理学系研究科, 教授 (10165293)
Project Period (FY) 2007-07-25 – 2013-03-31
Keywords植物 / 生体分子 / 網羅的遺伝子解析 / 分子間相互作用 / イメージング / マイクロアレイ / タイリングアレイ / ジーンチップ
Research Abstract

最終年度に当たる本年度は、公募班員を含む班員に対する支援事業をおこなった。
本支援班の一つ目の目的は、シロイヌナズナ23K-DNAチップ、ヒャクニチソウDNAチップ、シロイヌナズナタイリングアレイを用いた網羅的な遺伝子発現解析を行い、そのデータを提供することである。本年度は、7研究室から延べ39件の遺伝子解析の依頼があった。これらの依頼に応えて解析を行い、その遺伝子発現データを班員に戻した。これらの解析から、新規オーキシン関連遺伝子の同定、膜交通関連遺伝子の発現プロファイルの取得、側根形成を支配する遺伝子の発現パターンの解明、維管束転写因子の下流遺伝子発現のプロファイル取得、感染におけるシグナル遺伝子の同定、ペプチド誘導性遺伝子の発見など、植物メリステム研究に寄与する多くの成果があがった。
また、本支援班では、蛍光標識したタンパク質の組織内・細胞内局在の解析の技術情報や、植物細胞内におけるタンパク質問相互作用解析のためのベクターなどを整備し班員に提供するとともに、必要な班員には共焦点レーザー顕微鏡の利用の便を図ることも目的としている。本年度は、分子量の小さい蛍光タグとして改良が加えられたphiLOVドメインの利用可能性の検討を進め、蛍光強度・退光しにくさ等の点で、以前のiLOVより大幅に改善していることを確認した。FTタンパク質の輸送・動態の解析に利用を始めた。以上に加え、BiFC法によるタンパク質問相互作用解析のためのベクターの配布2件と1件(1研究室)の共焦点レーザー顕微鏡観察の技術支援をおこなった。
2012年11月には、連携研究者である奈良先端大・島本功教授がオーガナイザーとなり、ワークショップ「明日の植物科学を探る-ゲノムから細胞機能の統合を目指して-」(奈良先端大・植物科学グローバルトップ教育推進プログラムとの共催)をおこない、多数の参加者を得て、技術交流を図った。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

班員の支援は予定通り行うことにより、それぞれ所期の成果が挙げることができ、本特定領域研究における研究の進展に寄与することができたため。

  • Research Products

    (28 results)

All 2013 2012

All Journal Article (9 results) (of which Peer Reviewed: 7 results) Presentation (18 results) Book (1 results)

  • [Journal Article] The florigen genes FT and TSF modulate lateral shoot outgrowth in Arabidopsis thaliana.2013

    • Author(s)
      Hiraoka, K., Yamaguchi, A., Abe, M., Araki, T.
    • Journal Title

      Plant & Cell Physiology

      Volume: 54 Pages: 352-368

    • DOI

      10.1093/pcp/pcs168

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Plant meristems and organogenesis : the new era of plant developmental research. (Editorial)2013

    • Author(s)
      Machida, Y., Fukaki, H., Araki, T.
    • Journal Title

      Plant & Cell Physiology

      Volume: 54 Pages: 295-301

    • DOI

      10.1093/pcp/pct034

  • [Journal Article] BRANCHED1 interacts with FLOWERING LOCUS T to repress the floral transition of the axillary meristems in Arabidopsis.2013

    • Author(s)
      Niwa, M., Daimon, Y., Kurotani, K., Higo, A, Pruneda-Paz, J. L., Breton, G., Mitsuda, N., Kay, S. A., Ohme-Takagi, M., Endo, M., Araki, T.
    • Journal Title

      Plant Cell

      Volume: 25(印刷中)

    • DOI

      10.1105/tpc.112.109090

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Phloem long-distance delivery of FLOWERING LOCUS T (FT) to the apex.2013

    • Author(s)
      Yoo, S. -C., Chen, C., Rojas, M., Daimon, Y., Ham, B.K., Araki, T., Lucas, W.
    • Journal Title

      Plant Journal

      Volume: 74(印刷中)

    • DOI

      10.1111/tpj.12213

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Auxin-associated initiation of vascular cell differentiation by LONESOME HIGHWAY.2013

    • Author(s)
      Ohashi-Ito, K, Obuchi, M., Kojima, M., Sakakibara, H., Fukuda, H.
    • Journal Title

      Development

      Volume: 140 Pages: 765-769

    • DOI

      10.1242/dev.087924

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] An atypical b HLH transcription factor regulate early xylem development downstream of auxin.2013

    • Author(s)
      Ohashi-Ito, K., Matsukawa, M., Fukuda, H.
    • Journal Title

      Plant & Cell Physiology

      Volume: 54 Pages: 398-405

    • DOI

      10.1093/pcp/pct013

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] 植物固有の転写因子LEAFYとゼニゴケの有性生殖2012

    • Author(s)
      荒木崇
    • Journal Title

      植物科学の最前線(BSJ-Review)

      Volume: 3 Pages: 134-158

    • DOI

      http://bsj.or.jp/frontier/BSJreview2012B8.pdf)

  • [Journal Article] Initiation of cell wall pattern by a Rho- and microtubule-driven symmetry breaking.2012

    • Author(s)
      Oda, Y., Fukuda, H.
    • Journal Title

      Science

      Volume: 337 Pages: 1333-1336

    • DOI

      10.1126/science.1222597

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] The proteasome is responsible for caspase-3-like activity during xylem development.2012

    • Author(s)
      Han, J., Lin, W, Oda, Y., Cui, K. M., Fukuda, H., He, X. Q.
    • Journal Title

      Plant Journal

      Volume: 72 Pages: 129-141

    • DOI

      10.1111/j.1365-313X.2012.05070.x

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] シロイヌナズナBRC1はFT/TSFと相互作用して側芽の相転換を抑制する2013

    • Author(s)
      丹羽優喜, 遠藤求, 荒木崇
    • Organizer
      日本植物生理学会2013年度年会
    • Place of Presentation
      岡山市・岡山大学津島キャンパス(ポスター発表)
    • Year and Date
      2013-03-23
  • [Presentation] 苔類ゼニゴケにおけるmiR156およびSBP型転写因子の解析2013

    • Author(s)
      山口礼子, 宮下結衣, 吉川学, 酒井友希, 石崎公庸, 河内孝之, 荒木崇
    • Organizer
      日本植物生理学会2013年度年会
    • Place of Presentation
      岡山市・岡山大学津島キャンパス(ポスター発表)
    • Year and Date
      2013-03-23
  • [Presentation] NIMA関連キナーゼは花成制御因子FT, TFL1と相互作用する2013

    • Author(s)
      高谷彰吾, 池田龍也, 川本望, 酒井達也, 平山隆志, 後藤弘爾, 荒木崇, 高橋卓, 本瀬宏康
    • Organizer
      日本植物生理学会2013年度年会
    • Place of Presentation
      岡山市・岡山大学津島キャンパス(ポスター発表)
    • Year and Date
      2013-03-23
  • [Presentation] phyB相互作用因子PHLによる花成制御2013

    • Author(s)
      遠藤求, 長谷あきら, 荒木崇
    • Organizer
      日本植物生理学会2013年度年会
    • Place of Presentation
      岡山市・岡山大学津島キャンパス
    • Year and Date
      2013-03-22
  • [Presentation] シロイヌナズナ14-3-3タンパク質の花成における役割の解析2013

    • Author(s)
      肥後あすか, 川本望, 丹羽優喜, 山口礼子, 遠藤求, 荒木崇
    • Organizer
      日本植物生理学会2013年度年会
    • Place of Presentation
      岡山市・岡山大学津島キャンパス
    • Year and Date
      2013-03-22
  • [Presentation] リン酸化によるbZIP型転写因子FDの機能制御機構とタンパク質キナーゼの探索2013

    • Author(s)
      川本望, 笹部美知子, 遠藤求, 町田泰則, 荒木崇
    • Organizer
      日本植物生理学会2013年度年会
    • Place of Presentation
      岡山市・岡山大学津島キャンパス
    • Year and Date
      2013-03-22
  • [Presentation] 原核生物型PEBPファミリータンパク質CORのシロイヌナズナとゼニゴケにおける機能解析2013

    • Author(s)
      森花小百合, 竹本覚, 辻井由香, 有手友嗣, 竹村美保, 酒井友希, 山口礼子, 遠藤求, 石崎公庸, 大和和幸, 河内孝之, 荒木崇
    • Organizer
      日本植物生理学会2013年度年会
    • Place of Presentation
      岡山市・岡山大学津島キャンパス
    • Year and Date
      2013-03-21
  • [Presentation] Regulation of microtubule organization directing spatial patterning of wall assembly during xylem cell formation in Arabidopsis.2012

    • Author(s)
      福田裕穂, 小田祥久
    • Organizer
      Gordon Conference "Plant & Microbial Cytoskeleton"
    • Place of Presentation
      Proctor Academy, Andover NH, USA(招待講演)
    • Year and Date
      20120812-20120817
  • [Presentation] シロイヌナズナFTおよびTSFフロリゲンの側枝形成・伸長における役割2012

    • Author(s)
      荒木崇
    • Organizer
      第85回日本生化学会年会
    • Place of Presentation
      福岡市・福岡国際会議場(招待講演)
    • Year and Date
      2012-12-15
  • [Presentation] 転写因子の機能から迫る陸上植物の有性生殖メカニズムの進化-安定して次世代を残すために-2012

    • Author(s)
      酒井友希, 荒木崇
    • Organizer
      第35回日本分子生物学会年会
    • Place of Presentation
      福岡市・福岡国際会議場(招待講演)
    • Year and Date
      2012-12-13
  • [Presentation] Flagella and related genes. in "Genome Session (omnibus)"2012

    • Author(s)
      荒木崇
    • Organizer
      International Marchantia Workshop 2012
    • Place of Presentation
      熊本県阿蘇郡・ホテルグリーンピア南阿蘇
    • Year and Date
      2012-11-16
  • [Presentation] Role of LEAFY in gametophyte development and function.2012

    • Author(s)
      酒井友希, 宮下結衣, 宇山和樹, 辻井由香, 山口礼子, 荒木崇
    • Organizer
      International Marchantia Workshop 2012
    • Place of Presentation
      熊本県阿蘇郡・ホテルグリーンビア南阿蘇(招待講演)
    • Year and Date
      2012-11-15
  • [Presentation] 二次細胞壁パターンの数理解析にむけて2012

    • Author(s)
      小田祥久, 福田裕穗
    • Organizer
      日本植物学会第76回大会
    • Place of Presentation
      姫路市・兵庫県立大学姫路書写キャンパス(招待講演)
    • Year and Date
      2012-09-16
  • [Presentation] 花成と有性生殖を支える成長システムの統合的理解に向けて2012

    • Author(s)
      荒木崇
    • Organizer
      日本植物学会第76回大会
    • Place of Presentation
      姫路市・兵庫県立大学姫路書写キャンパス(招待講演)
    • Year and Date
      2012-09-15
  • [Presentation] シロイヌナズナBRC1/TCP18はFTと相互作用して側芽分裂細織の相転換を抑制する2012

    • Author(s)
      丹羽優喜, 遠藤求, 荒木崇
    • Organizer
      日本植物学会第76回大会
    • Place of Presentation
      姫路市・兵庫県立大学姫路書写キャンパス
    • Year and Date
      2012-09-15
  • [Presentation] 苔類ゼニゴケにおけるSBP型転写因子の解析2012

    • Author(s)
      山口礼子, 宮下結衣, 酒井友希, 石崎公庸, 河内孝之, 荒木崇
    • Organizer
      日本植物学会第76回大会
    • Place of Presentation
      姫路市・兵庫県立大学姫路書写キャンパス(ポスター発表)
    • Year and Date
      2012-09-15
  • [Presentation] 超解像イメージングで挑む木部細胞分化の分子ダイナミクス2012

    • Author(s)
      小田祥久, 福田裕穂
    • Organizer
      日本植物学会第76回大会
    • Place of Presentation
      姫路市・兵庫県立大学姫路書写キャンパス(招待講演)
    • Year and Date
      2012-09-15
  • [Presentation] 開始から完了まで-維管束分化の統合的理解に向けて-2012

    • Author(s)
      伊藤(大橋)恭子, 福田裕穂
    • Organizer
      日本植物学会第76回大会
    • Place of Presentation
      姫路市・兵庫県立大学姫路書写キャンパス(招待講演)
    • Year and Date
      2012-09-15
  • [Book] Plant Signaling Peptides. (ed. R, Irving and C. Gehring) (Peptide regulating vascular development.の章を分担執筆)2012

    • Author(s)
      Fukuda, H.
    • Total Pages
      284
    • Publisher
      Springer

URL: 

Published: 2014-07-16  

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