2013 Fiscal Year Annual Research Report
統合失調症を含む精神疾患の病態に関与する網羅的ｒａｒｅ ｖａｒｉａｎｔｓの探索
| Project Area | Personal genome-based initiatives toward understanding bran diseases |
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| Project/Area Number |
22129007
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| Research Institution | Tokyo Metropolitan Institute of Medical Science |
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Principal Investigator |
糸川 昌成 公益財団法人東京都医学総合研究所, 精神行動医学研究分野, 参事研究員 (40332324)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
新井 誠 公益財団法人東京都医学総合研究所, 精神行動医学研究分野, 主席研究員 (80356253)
瀧澤 俊也 東海大学, 医学部, 教授 (70197234)
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| Project Period (FY) |
2010-06-23 – 2015-03-31
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| Keywords | 統合失調症 |
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| Research Abstract |
地理的に閉鎖された地域で50名からなる統合失調症多発大家系を取集した。家系から発症者と非発症者11例よりパーソナルゲノムの再同意を取り付け、リンパ球から抽出したDNAを用いて次世代シークエンサーによる全ゲノムresequenceを実施した。連鎖解析を行い、ロッド値が1以上の座位にある変異に絞り込みを行った。さらにbioinfomaticsにより配列情報から変異の絞り込みを行い、これまで候補遺伝子として有望と考えられた遺伝子に劣性遺伝モデルに一致するミスセンス変異をふたつ同定した。発症者ではふたつを同時に保有し、非発症者ではふたつはヘテロか野生型だった。当該遺伝子が本家系においてrare variantとして罹患者に共有されていたので、一般症例に敷衍する形で研究を発展させた。具体的には統合失調症255例と対照195例を用いてassociation studyを行った。NCBIに登録された当該遺伝子領域の38SNPsについて検討した。NLS直下のエクソンにある二つのSNPが有意に統合失調症と関連した（P=8x10-7, 1x10-7)。Bonferoni補正後も有意だった（Odds ratio = 1.69 (CF:1.26-2.26)）。また、resequenceを行ったところ25のnovel rare varinatsが同定された。このうち患者のみでexclusiveに同定されたSNVsが9か所あったが、全てcystein-boxtとNLSの近傍から同定された。以上の結果から、多発家系からWhole genome resequenceによって同定された患者で共有されたnovel misssense rare varinatを持っていた候補遺伝子は、一般症例においても関連し、当該遺伝子が統合失調症の病態に寄与する可能性が示唆された。
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| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.
Reason
国内で初めて統合失調症多発大家系のパーソナルゲノムを実施し、有望な変異を同定するに至っている。さらにこの結果を一般症例に敷衍して一般症例でも関連を同定できたから。
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| Strategy for Future Research Activity |
論文化を進める。並行して第2家系の収集を進め、全ゲノムシークエンスを実施する予定である。
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Research Products
(12 results)
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[Journal Article] Genome-wide association study identifies a potent locus associated with human opioid sensitivity.2014
Author(s)
Nishizawa D, Fukuda K, Kasai S, Hasegawa J, Aoki Y, Nishi A, Saita N, Koukita Y, Nagashima M, Katoh R, Satoh Y, Tagami M, Higuchi S, Ujike H, Ozaki N, Inada T, Iwata N, Sora I, Iyo M, Kondo N, Won MJ, Naruse N, Uehara-Aoyama K, Itokawa M, Koga M, Arinami T, Kaneko Y, Hayashida M, Ikeda K.
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Journal Title
Mol Psychiatry
Volume: 19(1)
Pages: 55-62
DOI
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[Journal Article] 統合失調症の遺伝子研究における課題と展望.2013
Author(s)
糸川昌成, 新井誠, 宮下光弘, 小堀晶子, 畠山幸子, 鳥海和也, 市川智恵, 大島健一, 新里和弘, 岡崎祐士, 齋藤正彦
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Journal Title
精神医学
Volume: 55(12)
Pages: 1133-1143
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[Journal Article] An association analysis of the cardiomyopathy-associated 5 (CMYA5) genewith schizophrenia in a Japanese population.2013
Author(s)
Furukawa M, Tochigi M, Otowa T, Arinami T, Inada T, Ujike H, Watanabe Y, Iwata N, Itokawa M, Kunugi H, Hashimoto R, Ozaki N, Kakiuchi C, Kasai K, Sasaki T
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Journal Title
Psychiatr Genet.
Volume: 23(4)
Pages: 179-180
DOI
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[Journal Article] Genome-wide association study of schizophrenia using microsatellite markers in the Japanese population.2013
Author(s)
Shibata H, Yamamoto K, Sun Z, Oka A, Inoko H, Arinami T, Inada T, Ujike H, Itokawa M, Tochigi M, Watanabe Y, Someya T, Kunugi H, Suzuki T, Iwata N, Ozaki N, Fukumaki Y
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Journal Title
Psychiatr Genet
Volume: 23(3)
Pages: 117-123
DOI
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[Presentation] Clinical features of schizophrenia with enhanced carbonyl stress.
Author(s)
Miyashita M, Arai M, Kobori A, Ichikawa T, Toriumi K, Yuzawa H, Nohara I, Arai M, Obata N, Okazaki Y, Yoshikawa T, Amano N, Itokawa M.
Organizer
11th World Congress of Biological Psychiatry
Place of Presentation
京都
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[Presentation] Overcoming the heterogeneity of schizophrenia by profiling of carbonyl stress biomarkers.
Author(s)
Arai M, Xue M, Masania J, Shaheen F, Miyashita M, Ichikawa T, Toriumi K, Kobori A, Yoshikawa T, Itokawa M, Rabbani N, Thornalley P
Organizer
11th World Congress of Biological Psychiatry
Place of Presentation
京都
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