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2014 Fiscal Year Annual Research Report

DNAータンパク質クロスリンクとクロマチンリモデリング

Planned Research

Project AreaCoupling of replication, repair and transcription, and their common mechanism of chromatin remodeling
Project/Area Number 22131010
Research InstitutionHiroshima University

Principal Investigator

井出 博  広島大学, 理学(系)研究科(研究院), 教授 (30223126)

Project Period (FY) 2010-04-01 – 2015-03-31
KeywordsDNA複製 / ゲノム損傷 / クロマチンリモデリング
Outline of Annual Research Achievements

放射線および抗がん剤が誘発するDNA-タンパク質クロスリンク(DPC)損傷について検討した。放射線では,マウス移植腫瘍をX線および炭素イオン線で照射し,蛍光標識によりDPCを定量した。DPCは線量依存的に増加したが,X線・炭素イオン線ともに,常酸素腫瘍に比べ低酸素腫瘍の方が生成量は多かった。また,高LET放射線である炭素イオン線の方がX線に比べDPC生成量は多かった。これらの結果から,放射線によるDPC生成は,細胞の酸素分圧と放射線の電離密度に依存することが示された。放射線によるDPC生成には,DNAラジカルとタンパク質ラジカルの再結合が関わっている。酸素はこれらのラジカルに付加し不活性化するため,DPC生成効率が下がると考えた。一方,高LET放射線は局所的なラジカル密度を増加するためラジカル再結合が促進され,DPC生成効率が上がると考えた。次に,他のDNA損傷との生物影響を比較するため,DPC由来の蛍光をcalibrationし,単位線量(1 Gy)あたりの生成数を求めた。その結果,常酸素下におけるDPCの生成数は,ピリミジン塩基損傷,プリン塩基損傷,DNA一本鎖切断と同程度であることが明らかとなった。抗がん剤では,培養細胞をDNA代謝酵素阻害剤で処理し,DNAを精製後,原子間力顕微鏡(AFM)でDPCを観察した。未処理の細胞ではDPCはわずかにしか観察されなかったが,処理後には明確な増加が認められた。topoisomerase I阻害剤およびDNA methyltransferase阻害剤ではDNA鎖内部にDPCが認められたのに対し,topoisomerase II阻害剤では,DNA鎖末端にDPCが認められた。今後,これらのDPCの修復動態をAFMで調べる予定である。

Research Progress Status

26年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

26年度が最終年度であるため、記入しない。

  • Research Products

    (10 results)

All 2015 2014

All Journal Article (4 results) (of which Peer Reviewed: 4 results,  Open Access: 3 results,  Acknowledgement Compliant: 2 results) Presentation (5 results) (of which Invited: 1 results) Book (1 results)

  • [Journal Article] Induction of DNA-protein cross-links by ionizing radiation and their elimination from the genome2015

    • Author(s)
      Nakano T., Mitsusada Y., Salem A., Shoulkamy M., Sugimoto T., Hirayama R., Uzawa A., Furusawa Y., and Ide H.
    • Journal Title

      Mutation Research

      Volume: 771 Pages: 45-50

    • DOI

      10.1016/j.mrfmmm.2014.12.003

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Restriction-modification system with methyl-inhibited base excision and abasic-site cleavage activities2015

    • Author(s)
      Fukuyo M., Nakano T., Zhang Y., Furuta Y., Ishikawa K., Watanabe-Matsui M., Yano H., Hamakawa T., Ide H., and Kobayashi I.
    • Journal Title

      Nucleic Acids Research

      Volume: 43 Pages: 2841-2852

    • DOI

      10.1093/nar/gkv116

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Synergistic enhancement of 5-fluorouracil cytotoxicity by deoxyuridine analogs in cancer cells2015

    • Author(s)
      Matsumoto Y., Rodriguez V., Whitford T.A., Beeharry N., Ide H., and Tomkinson A.E.
    • Journal Title

      Oncoscience

      Volume: 2 Pages: 272-284

    • DOI

      PMID: 25897430

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Depletion of RUVBL2 in human cells confers moderate sensitivity to anticancer agents2014

    • Author(s)
      Miyamoto-Matsubara M., Han Y., Ono K., Xie M., Salem A., Shoulkamy M., Nakano T., and Ide H.
    • Journal Title

      Journal of Cancer Science and Therapy

      Volume: 6 Pages: 440-445

    • DOI

      10.4172/1948-5956.1000306

    • Peer Reviewed / Open Access / Acknowledgement Compliant
  • [Presentation] 低酸素性細胞における放射線誘発DNA損傷の解析2014

    • Author(s)
      井出博,中野敏彰,瀬畑敬文,久保山政弥,杉本龍也,平山亮一,鵜澤玲子,古澤佳也
    • Organizer
      第37回日本分子生物学会
    • Place of Presentation
      横浜市
    • Year and Date
      2014-11-25 – 2014-11-27
  • [Presentation] Detection of DNA-protein cross-link damage by fluorescence labeling2014

    • Author(s)
      Salem A., Nakano T., Hattori S., Hirayama R., Uzawa R., Furusawa Y., and Ide H.
    • Organizer
      日本放射線影響学会第57回大会
    • Place of Presentation
      鹿児島市
    • Year and Date
      2014-10-01 – 2014-10-03
  • [Presentation] Analysis of DNA damage induced by aldehyde compounds2014

    • Author(s)
      Xie M., Shoulkamy M., Ohba S., Nakano T., and Ide H.
    • Organizer
      日本放射線影響学会第57回大会
    • Place of Presentation
      鹿児島市
    • Year and Date
      2014-10-01 – 2014-10-03
  • [Presentation] Formation and repair of DNA-protein cross-link damage2014

    • Author(s)
      Ide H.
    • Organizer
      13th International Workshop on Radiation Damage to DNA
    • Place of Presentation
      Cambridge, MA, USA
    • Year and Date
      2014-06-14 – 2014-06-18
    • Invited
  • [Presentation] DNA-タンパク質クロスリンクとクロマチンリモデリング2014

    • Author(s)
      井出博
    • Organizer
      新学術領域研究 ゲノム普遍的制御 第5回領域会議
    • Place of Presentation
      鳴門市
    • Year and Date
      2014-05-07 – 2014-05-09
  • [Book] DNA Repair2015

    • Author(s)
      Ide H., Nakano T., Shoulkamy M., and Salem A.
    • Total Pages
      38
    • Publisher
      Formation, repair, and biological effects of DNA-protein cross-link damage

URL: 

Published: 2016-06-01  

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