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2011 Fiscal Year Annual Research Report

がんの統合的ゲノム・エピゲノム解析と治療標的分子シーズの探索

Planned Research

Project AreaIntegrative Systems Understanding of Cancer for Advanced Diagnosis, Therapy and Prevention
Project/Area Number 22134002
Research InstitutionTokyo Medical and Dental University

Principal Investigator

稲澤 譲治  東京医科歯科大学, 難治疾患研究所, 教授 (30193551)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 小崎 健一  東京医科歯科大学, 難治疾患研究所, 准教授 (50270715)
Keywordsがん / 分子標的 / がん遺伝子 / がん抑制遺伝子 / システム生物学 / 遺伝子ネットワーク / ゲノム / エピゲノム
Research Abstract

がんの統合的ゲノム・エピゲノム解析と治療標的分子シーズの探索を推進するために、がん幹細胞、EMT制御異常、ならびに浸潤・転移に関する新規in vitro/in vivo実験モデル系を開発した。さらに、食道扁平上皮癌、大腸癌、子宮体癌、神経芽腫などの種々のがん腫を対象にゲノム・エピゲノム解析を実施して各種がんのゲノム・エピゲノム解析データ、腫瘍バンク、組織アレイ等の技術とリソースを整備し、これらを基盤に次世代型シーケンサーとその応用技術(ChIPシーケンス他)、BAMCA法やMeDIP法などメチル化DNAハイスループット解析を実施した。取得したがんオミクス情報に基づきシステム生物学的アプローチで、がん特性の分子機序を解明し、がん個性診断バイオマーカーや分子標的治療のシーズを探索した。その結果、子宮体癌において、327種類のmiRNAライブラリーを用いた機能的スクリーニングを基に、新規の癌抑制性マイクロRNA(TS-miRNA)としてCOPZ2遺伝子(17q21.32)の遺伝子内に座位するmiR-152とその標的分子のE2F3、MET,Rictorを同定した。これにより、合成二本鎖TS-miRNAを用いたmiRNA replacement therapyの新規がん治療法としての有効性に期待がかかる。また、私たちは神経芽腫(NB)の自然退縮にLAPTM5の細胞内蓄積により惹起される細胞死が関与する可能性を報告したが、今回、LAPTM5蛋白を基質とするE3ユビキチンリガーゼのITCHを同定した。驚くべきは、ITCH遺伝子は、甲状腺未分化癌の遺伝子増幅の8p12増幅の標的遺伝子として我々が同定した分子である。ITCHは、LAPTM5の発現量を負に制御することにより、NBの自然退縮を抑制している可能性が示唆された。

  • Research Products

    (47 results)

All 2012 2011 Other

All Journal Article (14 results) (of which Peer Reviewed: 14 results) Presentation (28 results) Book (4 results) Remarks (1 results)

  • [Journal Article] Common variants at 11q12, 10q26 and 3p11.2 are associated with prostate cancer susceptibility in Japanese2012

    • Author(s)
      Akamatsu S, Inazawa J, et al
    • Journal Title

      Nat Genet

      Volume: 44 Pages: 426-429

    • DOI

      DOI:10.1038/ng.1104

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] ACTN4 gene amplification and actinin-4 protein overexpression drive tumour development and histological progression in a high-grade subset of ovarian clear-cell adenocarcinomas2012

    • Author(s)
      Yamamoto S, Inazawa J, et al
    • Journal Title

      Histopathology

      Volume: (Epub ahead of print)

    • DOI

      DOI:10.1111/j.1365-2559.2011.04163.x

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Tumor-suppressive microRNAs silenced by tumor-specific DNA hypermethylation in cancer cells2012

    • Author(s)
      Kozaki K, Inazawa J, et al
    • Journal Title

      Cancer Sci

      Volume: (Epub ahead of print)

    • DOI

      DOI:10.1111/j.1365-2559.2011.04163.x

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] SIX1 promotes epithelial-mesenchymal transition in colorectal cancer through ZEB1 activation2012

    • Author(s)
      Ono H, Inazawa J, et al
    • Journal Title

      Cancer Sci.Oncogene.

      Volume: (Epub ahead of print)

    • DOI

      DOI:10.1038/onc.2011.646

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] A transcriptional variant of the LC3A gene is involved in autophagy and frequently inactivated in human cancers2012

    • Author(s)
      Bai H, Inazawa J, et al
    • Journal Title

      Oncogene

      Volume: (Epub ahead of print)

    • DOI

      DOI:10.1038/onc.2011.613

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Gene amplification of ESR1 in breast cancers-Fact or fiction? A fluorescence in situ hybridization and multiplex ligation-dep endent probe amplification study2011

    • Author(s)
      Ooi A, Inazawa J, et al
    • Journal Title

      J Pathol

      Volume: 227 Pages: 8-16

    • DOI

      DOI:10.1002/path.3974

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Stabilization of phenotypic plasticity through mesenchymal-specific DNA hypermethylation in cancer cells2011

    • Author(s)
      Kurasawa Y, Inazawa J, et al
    • Journal Title

      Oncogene

      Volume: (Epub ahead of print)

    • DOI

      DOI:10.1038/onc.2011.373

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] The HECT-type ubiquitin ligase ITCH targets lysosomal-associated prote in multispanning transmembrane 5 (LAPTM5)and prevents LAPTM5-mediated cell death2011

    • Author(s)
      Ishihara T, Inazawa J, et al
    • Journal Title

      J Biol Chem

      Volume: 286 Pages: 44086-4494

    • DOI

      DOI:10.1074/jbc.M11.251694

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] miR-152 is a tumor suppressor microRNA that is silenced by DNA hypermethylation in endometrial cancer2011

    • Author(s)
      Tsuruta T, Inazawa J, et al
    • Journal Title

      Cancer Res

      Volume: 71 Pages: 6450-6462

    • DOI

      DOI:10.1158/0008-5472.CAN-11-0364

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] The tumor suppressive microRNA miE-218 targets the mTOR component Rictor and inhibits AKT phosphorylation in oral cancer2011

    • Author(s)
      Uesugi A, Inazawa J, et al
    • Journal Title

      Cancer Res

      Volume: 71 Pages: 5765-5778

    • DOI

      DOI:10.1158/0008-5472.CAN-11-0368

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Genome-wide DNA methylation profiles in renal tumors of various histological subtypes and non-tumorous renal tissues2011

    • Author(s)
      Arai E, Inazawa J, et al
    • Journal Title

      Pathobiology

      Volume: 78 Pages: 1-9

    • DOI

      DOI:10.1159/000322072

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Diagnosis and prognostication of ductal adenocarcinomas of the pancreas based on genome-wide DNA methylation profiling by bacterial artificial chromosome array-based methylated CpG island amplification2011

    • Author(s)
      Gotoh M, Inazawa J, et al
    • Journal Title

      J Biomed Biotechnol

      Volume: 2011 Pages: 780836

    • DOI

      DOI:10.1155/2011/780836

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Copy number alterations in urothelial carcinomas : Their clinicopathological significance and correlation with DNA methylation alterations2011

    • Author(s)
      Nishiyama N, Inazawa J, et al
    • Journal Title

      Carcinogenesis

      Volume: 32 Pages: 462-469

    • DOI

      DOI:10.1093/carcin/bgq274

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] YAP is a candidate oncogene for esophageal squamous-cell carcinoma2011

    • Author(s)
      Muramatsu T, Inazawa J, et al
    • Journal Title

      Carcinogenesis

      Volume: 32 Pages: 389-398

    • DOI

      DOI:10.1093/carcin/bgq254

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] Pathogenic CNVs and causative genes detected by two-stage screening in 647 patients with mental retardation and multiple congenital anomalies of unknown etiology2011

    • Author(s)
      林深、稲澤譲治, 他
    • Organizer
      The 12^<th> International Congress of Human Genetics/The American Society of Human Genetics 61th annual meeting
    • Place of Presentation
      Montreal, Canada
    • Year and Date
      20111011-20111015
  • [Presentation] HRAS mutants identified in Costello syndrome patients have the ability to induce cellular senescence : Possible association with the pathogenesis of Costello syndrome2011

    • Author(s)
      新堀哲也、稲澤譲治, 他
    • Organizer
      The 12^<th> International Congress of Human Genetics/The American Society of Human Genetics 61th annual meeting
    • Place of Presentation
      Montreal, Canada
    • Year and Date
      20111011-20111015
  • [Presentation] Functionalスクリーニングを用いた肝細胞癌抑制性microRNAの同定2011

    • Author(s)
      古田繭子、稲澤譲治, 他
    • Organizer
      第34回日本分子生物学会年会
    • Place of Presentation
      パシフィコ横浜(神奈川)
    • Year and Date
      2011-12-14
  • [Presentation] がんの統合的ゲノム・エピゲノム解析2011

    • Author(s)
      稲澤譲治
    • Organizer
      日本人類遺伝学会第56回大会/第11回東アジア人類遺伝学会
    • Place of Presentation
      幕張メッセ(千葉)
    • Year and Date
      2011-11-11
  • [Presentation] Genome-wide association study of lung cancer : Association of variation in TP63 with lung adenocarcinoma susceptibility2011

    • Author(s)
      醍醐弥太郎、稲澤譲治, 他
    • Organizer
      日本人類遺伝学会第56回大会/第11回東アジア人類遺伝学会
    • Place of Presentation
      幕張メッセ(千葉)
    • Year and Date
      2011-11-11
  • [Presentation] Pitt-Hopkins症候群を考える4例2011

    • Author(s)
      岡本伸彦、稲澤譲治, 他
    • Organizer
      日本人類遺伝学会第56回大会/第11回東アジア人類遺伝学会
    • Place of Presentation
      幕張メッセ(千葉)
    • Year and Date
      2011-11-11
  • [Presentation] SNPアレイを用いた先天異常疾患症例におけるゲノム異常評価とアレイポテンシャルの比較2011

    • Author(s)
      林深、稲澤譲治, 他
    • Organizer
      日本人類遺伝学会第56回大会/第11回東アジア人類遺伝学会
    • Place of Presentation
      幕張メッセ(千葉)
    • Year and Date
      2011-11-10
  • [Presentation] DNA過剰メチル化により発現抑制される癌抑制遺伝子型microRNAの機能的スクリーニング2011

    • Author(s)
      小崎健一、稲澤譲治
    • Organizer
      日本人類遺伝学会第56回大会/第11回東アジア人類遺伝学会
    • Place of Presentation
      幕張メッセ(千葉)
    • Year and Date
      2011-11-10
  • [Presentation] BACアレイ・SNPアレイを用いた日系ブラジル人100家系のトリオ解析による日本人健常者CNVデータベースの構築2011

    • Author(s)
      林深、稲澤譲治, 他
    • Organizer
      日本人類遺伝学会第56回大会/第11回東アジア人類遺伝学会
    • Place of Presentation
      幕張メッセ(千葉)
    • Year and Date
      2011-11-10
  • [Presentation] 遺伝子解析研究とバイオリソースバンクに関する医療者の意識調査2011

    • Author(s)
      藍真澄、稲澤譲治, 他
    • Organizer
      日本人類遺伝学会第56回大会/第11回東アジア人類遺伝学会
    • Place of Presentation
      幕張メッセ(千葉)
    • Year and Date
      2011-11-10
  • [Presentation] Function-based screening of tumor-suppressor microRNAs silenced by DNA hypermethylation in cancer2011

    • Author(s)
      稲澤譲治
    • Organizer
      The 8th Nikko International Symposium 2011
    • Place of Presentation
      Jichi Medical University, Tochigi, Japan
    • Year and Date
      2011-10-21
  • [Presentation] Functionalスクリーニングを用いた肝細胞癌抑制性microRNAの同定2011

    • Author(s)
      古田繭子、稲澤譲治, 他
    • Organizer
      第70回日本癌学会学術総会
    • Place of Presentation
      名古屋国際会議場(愛知)
    • Year and Date
      2011-10-05
  • [Presentation] 日本人と韓国人の肺腺癌発症に関連するTP63の一塩基多型の同定2011

    • Author(s)
      三木大樹、稲澤譲治, 他
    • Organizer
      第70回日本癌学会学術総会
    • Place of Presentation
      名古屋国際会議場(愛知)
    • Year and Date
      2011-10-05
  • [Presentation] 肝癌再発を予測するオミックス解析と分子標的治療への応用2011

    • Author(s)
      田中真二、稲澤譲治, 他
    • Organizer
      第70回日本癌学会学術総会
    • Place of Presentation
      名古屋国際会議場(愛知)
    • Year and Date
      2011-10-05
  • [Presentation] 統合的アレイ解析による肝細胞癌の新規がん抑制遺伝子候補PACAPの同定2011

    • Author(s)
      松村聡、稲澤譲治, 他
    • Organizer
      第70回日本癌学会学術総会
    • Place of Presentation
      名古屋国際会議場(愛知)
    • Year and Date
      2011-10-05
  • [Presentation] がんの統合的ゲノム・エピゲノム解析の最近の進歩2011

    • Author(s)
      稲澤譲治
    • Organizer
      第70回日本癌学会学術総会
    • Place of Presentation
      名古屋国際会議場(愛知)
    • Year and Date
      2011-10-05
  • [Presentation] がんの統合的ゲノム・エピゲノム解析の最近の進歩日本人と韓国人の肺腺癌発症に関連するTP63の一塩基多型の同定2011

    • Author(s)
      三木大樹、稲澤譲治, 他
    • Organizer
      第70回日本癌学会学術総会
    • Place of Presentation
      名古屋国際会議場(愛知)
    • Year and Date
      2011-10-05
  • [Presentation] がん細胞においてDNA過剰メチル化により発現抑制される癌抑制遺伝子型microRNAの機能的スクリーニング2011

    • Author(s)
      小崎健一、稲澤譲治
    • Organizer
      第70回日本癌学会学術総会
    • Place of Presentation
      名古屋国際会議場(愛知)
    • Year and Date
      2011-10-04
  • [Presentation] 胃がんにおける新規がん遺伝子グリオキサラーゼIの機能解析2011

    • Author(s)
      細田文恵、稲澤譲治, 他
    • Organizer
      第70回日本癌学会学術総会
    • Place of Presentation
      名古屋国際会議場(愛知)
    • Year and Date
      2011-10-04
  • [Presentation] 食道癌におけるオートファジーATG7の不活性化2011

    • Author(s)
      小西博貴、稲澤譲治, 他
    • Organizer
      第70回日本癌学会学術総会
    • Place of Presentation
      名古屋国際会議場(愛知)
    • Year and Date
      2011-10-04
  • [Presentation] 癌におけるオートファジー関連遺伝子LC3Avariant-1の不活性化2011

    • Author(s)
      井上純、稲澤譲治, 他
    • Organizer
      第70回日本癌学会学術総会
    • Place of Presentation
      名古屋国際会議場(愛知)
    • Year and Date
      2011-10-04
  • [Presentation] 食道扁平上皮癌において高頻度に発現抑制される新規癌関連プロトカドヘリン遺伝子の同定2011

    • Author(s)
      宮脇豊、稲澤譲治, 他
    • Organizer
      第70回日本癌学会学術総会
    • Place of Presentation
      名古屋国際会議場(愛知)
    • Year and Date
      2011-10-04
  • [Presentation] 機能的スクリーニングとDNAメチル化解析による口腔癌関連新規癌抑制遺伝子型microRNAの探索2011

    • Author(s)
      上杉篤史、稲澤譲治, 他
    • Organizer
      第70回日本癌学会学術総会
    • Place of Presentation
      名古屋国際会議場(愛知)
    • Year and Date
      2011-10-04
  • [Presentation] 腫瘍特異的DNA過剰メチル化によって発現抑制される口腔扁平上皮癌抑制遺伝子型microRNAの探索2011

    • Author(s)
      遠藤寛則、稲澤譲治, 他
    • Organizer
      第70回日本癌学会学術総会
    • Place of Presentation
      名古屋国際会議場(愛知)
    • Year and Date
      2011-10-04
  • [Presentation] 大腸癌においてSIX1はZEB1を介し上皮間葉転換を誘導する2011

    • Author(s)
      小野宏晃、稲澤譲治, 他
    • Organizer
      第70回日本癌学会学術総会
    • Place of Presentation
      名古屋国際会議場(愛知)
    • Year and Date
      2011-10-03
  • [Presentation] 卵巣癌細胞における恒常的NF-κB活性化と足場非依存性増殖能に対するNIKの寄与2011

    • Author(s)
      宇野雅哉、稲澤譲治, 他
    • Organizer
      第70回日本癌学会学術総会
    • Place of Presentation
      名古屋国際会議場(愛知)
    • Year and Date
      2011-10-03
  • [Presentation] 膵癌細胞株におけるE-cadherinの発現変化を指標とした機能的スクリーニングによるEMT関連microRNAの探索2011

    • Author(s)
      原園陽介、稲澤譲治, 他
    • Organizer
      第70回日本癌学会学術総会
    • Place of Presentation
      名古屋国際会議場(愛知)
    • Year and Date
      2011-10-03
  • [Presentation] 膵臓がん細胞株Panc1を用いた自発的転移モデルの構築と検証2011

    • Author(s)
      村松智輝、稲澤譲治, 他
    • Organizer
      日本人類遺伝学会第56回大会/第11回東アジア人類遺伝学会第70回日本癌学会学術総会
    • Place of Presentation
      名古屋国際会議場(愛知)
    • Year and Date
      2011-10-03
  • [Book] がん生物学イラストレイテッド2011

    • Author(s)
      渋谷正史、稲澤譲治, 他
    • Total Pages
      140-150(411)
    • Publisher
      株式会社羊土社
  • [Book] 肝細胞癌の早期診断:画像と分子マーカー2011

    • Author(s)
      小崎健一、稲澤譲治, 他
    • Total Pages
      241-249(265)
    • Publisher
      株式会社アークメディア
  • [Book] 日本臨林増刊号.大腸癌2011

    • Author(s)
      小野宏晃、稲澤譲治, 他
    • Total Pages
      77-83
    • Publisher
      株式会社日本臨林社
  • [Book] 最新医学2011

    • Author(s)
      宮脇豊、稲澤譲治, 他
    • Total Pages
      69-75
    • Publisher
      株式会社最新医学社
  • [Remarks]

    • URL

      http://www.tmd.ac.jp/mri/cgen/framepage.htm

URL: 

Published: 2013-06-26  

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