2015 Fiscal Year Annual Research Report
| Project Area | Correlative gene system: establishing next-generation genetics |
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23113009
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| Research Institution | Iwate Biotechnology Research Center |
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Principal Investigator |
寺内 良平 公益財団法人岩手生物工学研究センター, ゲノム育種研究部, 部長 (50236981)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
齋藤 宏昌 公益財団法人岩手生物工学研究センター, ゲノム育種研究部, 主任研究員 (20414336)
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| Project Period (FY) |
2011-04-01 – 2016-03-31
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| Keywords | 集団遺伝学 / 全ゲノム解析 / イネ / いもち病菌 / シーケンス / 耐病性 / 共進化 / 病原菌 |
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| Outline of Annual Research Achievements |
本宿主－病原菌間の相互作用は、強力であり(Haldane 1949)、生物進化の原動力の一つと言われている。相互作用からの自然選択は、双方の生物の相互作用に関わる遺伝子およびその周辺のゲノムのDNA配列上に特徴的な痕跡を残す。生物種の多数の個体を対象に全ゲノム解析を実施し、近縁種のゲノム配列と比較することにより、ゲノムDNAの種内変異と近縁種間の変異の検出・解析(集団ゲノム学：Population genomics)が可能になった。本課題では、全ゲノム解析による植物とその病原菌・寄生者の共進化で生じる強い自然選択がゲノムに残した痕跡を同定して、選択の働いた遺伝子を見いだし、その機能を解明することに焦点を当てる。そのために、(1)植物-病原菌・寄生者相互作用のゲノム解析およびエフェクターの同定、(2)全ゲノム解析によるselective sweep検出技術の開発と利用、の2つの研究を実施する。本年度は、いもち病菌エフェクターAVR-Pikとイネ抵抗性タンパク質Pikの相互作用の結晶構造解析に成功した。さらに、いもち病菌エフェクターAVR-Piiとイネ抵抗性タンパク質Piiの相互作用の分子機構解明も進展した。野生生物オニドコロのゲノム解析にも着手した。
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| Research Progress Status |
27年度が最終年度であるため、記入しない。
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| Strategy for Future Research Activity |
27年度が最終年度であるため、記入しない。
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[Journal Article] A chloroplast-localized protein LESION AND LAMINA BENDING affects defense and growth responses in rice.2016
Author(s)
Tamiru, M., Takagi, H., Abe, A., Yokota, T., Kanzaki, H., Okamoto, H., Saitoh, H., Takahashi, H., Fujisaki, K., Oikawa, K., Uemura, A., Natsume, S., Jikumaru, Y., Matsuura, H., Umemura, K., Terry, M. J., Terauchi, R.
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Journal Title
New Phytologist
Volume: 210
Pages: 1282-1297
DOI
Peer Reviewed / Int'l Joint Research / Acknowledgement Compliant
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[Journal Article] Whole genome sequencing approaches to understand Magnaporthe-rice interactions.2016
Author(s)
Terauchi, R., Kanzaki, H., Fuijsaki, K., Takagi, H., Abe, A., Yoshida, K., Okuyama, Y., Tamiru, M., Saitoh, H.
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Journal Title
Physiological and Molecular Plant Pathology
Volume: 94
Pages: 1-5
DOI
Peer Reviewed / Int'l Joint Research / Acknowledgement Compliant
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[Journal Article] WIPPER: an accurate and efficient field phenotyping platform for large-scale applications.2015
Author(s)
Utsushi, H., Abe, A., Tamiru, M., Ogasawara, Y., Obara, T., Sato, E., Ochiai, Y., Terauchi, R., Takagi, H.
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Journal Title
Breeding Science
Volume: 65
Pages: 285-289
DOI
Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research / Acknowledgement Compliant
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[Journal Article] Rice Exo70 interacts with a fungal effector, AVR-Pii and is required for AVR-Pii-triggered immunity.2015
Author(s)
Fujisaki, K., Abe, Y., Ito, A., Saitoh, H., Yoshida, K., Kanzaki, H., Kanzaki, E., Utsushi, H., Yamashita, T., Kamoun, S., Terauchi, R.
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Journal Title
The Plant Journal
Volume: 83
Pages: 875-887
DOI
Peer Reviewed / Int'l Joint Research / Acknowledgement Compliant
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[Journal Article] Structural basis of pathogen recognition by an integrated HMA domain in a plant NLR immune receptor.2015
Author(s)
Maqbool, A., Saitoh, H., Franceschetti, M., Stevenson, C.E.M., Uemura, A., Kanzakii, H., Kamoun, S., Terauchi, R., Banfield, M. J.
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Journal Title
eLife
Volume: 4
Pages: 1-24
DOI
Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research / Acknowledgement Compliant
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[Presentation] Genome sequencing and modern breeding2015
Author(s)
Terauchi R.
Organizer
20th Japanese-German Symposium Agriculture and Food Supply Challenges and Perspectives
Place of Presentation
Potsdam University, Germany
Year and Date
2015-05-08 – 2015-05-09
Int'l Joint Research / Invited
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