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2013 Fiscal Year Annual Research Report

細胞内情報伝達の少数性生物学

Planned Research

Project AreaSpying minority in biological phenomena -Toward bridging dynamics between individual and ensemble processes-
Project/Area Number 23115004
Research InstitutionTohoku University

Principal Investigator

石島 秋彦  東北大学, 多元物質科学研究所, 教授 (80301216)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 杤尾 豪人  京都大学, 工学(系)研究科(研究院), 准教授 (70336593)
Project Period (FY) 2011-07-25 – 2016-03-31
Keywordsバクテリア / 走化性
Research Abstract

細胞内における生体分子の化学反応は,非常に少数からなる密度の濃い状態での反応である.従って,生体内での生体分子の反応メカニズムを明らかにするためには,少数分子からなる有限時間,空間における反応を直接観察,計測し,その理論的考察まで含めた学問形態を確立する必要がある.本申請においては,高速ビデオカメラによるべん毛回転の観察法、ダイアモンドナノ粒子を用いた磁気共鳴共役蛍光観察法、細胞内ラマン分光など新規な測定方法を開発・適用することにより、細胞内外における少数分子の挙動について可能な限り定量的な情報を取得し、入力と出力との間の関係を定量的に表現し、分子間の協同性等を詳細に解析することを目論む.本研究では,これまでに構築した,ナノ計測システムとイメージングシステムを融合することにより,各モーター間の連携の様子,走化性シグナルからの情報伝達による回転の応答,外部刺激の変化による回転の応答,ケージド化合物を用いた局所的環境変化と細胞の応答との相関,遺伝情報の制御,発現の様子と回転との相関をこのマルチモーターの計測手法を用いて計測を試みる.
ケージド化合物を用いた外部刺激により,細胞の回転方向の割合(CW/(CW+CCW))が変化した.このことは,ケージド化合物による刺激により,受容体からの情報が細胞内部に発せられたことを示すものである(論文投稿中).
また,CheYとGFPの融合タンパク質を発現し,モーターの回転とモーター基部体への結合の様子を同時に計測することを試みた.その結果,CW中に回転中心の蛍光強度が上昇することを見いだした.さらに,結合・解離の時定数,結合したCheYの分子数などを見積もることに成功した(Science Signalingに発表).

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

走化性応答に関しては,まとめたものを投稿した.しかし,3人のレビューアーからいくつかの指摘を受け,現在それらの指摘に対して変更を行っている.

Strategy for Future Research Activity

今までの研究から,細胞内情報伝達に関する知見をほぼ得ることができた.しかし,まだ手つかずのものが走化性レセプターの活性変化である.
現在,FRETを用いたレセプター活性の可視化を試みている.

  • Research Products

    (18 results)

All 2014 2013

All Journal Article (7 results) (of which Peer Reviewed: 7 results) Presentation (11 results) (of which Invited: 4 results)

  • [Journal Article] Direct Imaging of Intracellular Signaling Components That Regulate Bacterial Chemotaxis.2014

    • Author(s)
      1.Hajime Fukuoka, Takashi Sagawa, Yuichi Inoue, Hiroto Takahashi, and Akihiko Ishijima.
    • Journal Title

      Science Signaling

      Volume: 319 Pages: ra32

    • DOI

      10.1126/scisignal.2004963

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Hybrid-fuel bacterial flagellar motors in Escherichia coli2014

    • Author(s)
      2.Yoshiyuki Sowa, Michio Homma, Akihiko Ishijima, and Richard M. Berry
    • Journal Title

      Proc Natl Acad Sci U S A.

      Volume: 111 Pages: 3436-41

    • DOI

      10.1073/pnas.1317741111

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Functional assessment of the mutational effects of human IRAK4 and MyD88 genes.2014

    • Author(s)
      Yamamoto T, Tsutsumi N, Tochio H, Ohnishi H, Kubota K, Kato Z, Shirakawa M, Kondo N.
    • Journal Title

      Mol Immunol

      Volume: 58(1) Pages: 66-76

    • DOI

      10.1016/j.molimm.2013.11.008.

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Temperature Dependences of Torque Generation and Membrane Voltage in the Bacterial Flagellar Motor.2013

    • Author(s)
      Yuichi Inoue, Matthew A.B. Baker, Hajime Fukuoka, Hiroto Takahashi, Richard M. Berry, Akihiko Ishijima.
    • Journal Title

      Biophysical Journal

      Volume: 105 Pages: 2801-2810

    • DOI

      10.1016/j.bpj.2013.09.061

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] High Hydrostatic Pressure Induces Counterclockwise to Clockwise Reversals of the Escherichia coli Flagellar Motor2013

    • Author(s)
      4.Masayoshi Nishiyama, Yoshiyuki Sowa, Yoshifumi Kimura, Michio Homma, Akihiko Ishijima and Masahide Terazima
    • Journal Title

      Journal of Bacteriology

      Volume: 8 Pages: 1809-1814

    • DOI

      10.1128/JB.02139-12

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Pruning the ALS-associated protein SOD1 for in-cell NMR.2013

    • Author(s)
      Danielsson J, Inomata K, Murayama S, Tochio H, Lang L, Shirakawa M, Oliveberg M.
    • Journal Title

      J Am Chem Soc

      Volume: 135(28) Pages: 10266-9

    • DOI

      10.1021/ja404425r.

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Quantitative comparison of protein dynamics in live cells and in vitro by in-cell (19)F-NMR.2013

    • Author(s)
      Takaoka Y, Kioi Y, Morito A, Otani J, Arita K, Ashihara E, Ariyoshi M, Tochio H, Shirakawa M, Hamachi I..
    • Journal Title

      Chem Commun (Camb)

      Volume: 49(27) Pages: 2801-3

    • DOI

      10.1039/c3cc39205h.

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] Temperature changes in norepinephrine-stimulated brown adipocytes detected with a bimaterial microcantilever2013

    • Author(s)
      Masaaki Sato, Masaya Toda, Naoki Inomata, Hisataka Maruyama, Yuko Okamatsu-Ogura, Fumihito Arai, Takahito Ono, Akihiko Ishijima, Yuichi Inoue
    • Organizer
      The 2013 American Society for Cell Biology annual meeting
    • Place of Presentation
      米国,ニューオーリンズ
    • Year and Date
      20131214-20131218
  • [Presentation] 蛍光イメージングによる大腸菌細胞内情報伝達の直接的観察2013

    • Author(s)
      福岡 創, 佐川貴志, 井上裕一, 高橋泰人, 石島秋彦
    • Organizer
      第13回多元物質科学研究所研究発表会
    • Place of Presentation
      日本,仙台
    • Year and Date
      20131206-20131206
  • [Presentation] Analysis of angular steps of bacterial flagellar motors using an elliptic probe2013

    • Author(s)
      井上 裕一, 分部 寛道 , 佐川 貴志, 福岡 創 , 石島 秋彦
    • Organizer
      第51回日本生物物理学会年会
    • Place of Presentation
      日本,京都
    • Year and Date
      20131028-20131030
  • [Presentation] ケージドセリン光分解とべん毛モーター回転計測を用いた大腸菌走化性応答の高時間分解能計測2013

    • Author(s)
      佐川 貴志, 福岡 創, 井上 裕一, 高橋 泰人, 石島 秋彦
    • Organizer
      第51回日本生物物理学会年会
    • Place of Presentation
      日本,京都
    • Year and Date
      20131028-20131030
  • [Presentation] バクテリアべん毛モーターの高時間分解能回転ステップ計測系の開発2013

    • Author(s)
      分部 寛道, 井上 裕一 , 石島 秋彦
    • Organizer
      第51回日本生物物理学会年会
    • Place of Presentation
      日本,京都
    • Year and Date
      20131028-20131030
  • [Presentation] 蛍光イメージング法による機能的べん毛モーターと走化性シグナル伝達分子CheYの結合の直接的観察2013

    • Author(s)
      福岡 創, 佐川 貴志, 井上 裕一, 高橋 泰人, 石島 秋彦
    • Organizer
      第51回日本生物物理学会年会
    • Place of Presentation
      日本,京都
    • Year and Date
      20131028-20131030
  • [Presentation] ケージドセリン光分解とべん毛モーター回転計測を用いた大腸菌走化性応答の高時間分解 能計測 (Response of flagellar motor rotation to photoreleased serine from caged-compound in an E. coli cell)2013

    • Author(s)
      佐川 貴志 1, 福岡 創 1,2, 井上 裕一 1,2, 高橋 泰人 2, 石島 秋彦 1,2 (1 東北大学大学院生命科学研究科, 2 東北大学多元物質科学研究所) (Takashi Sagawa 1, Hajime Fukuoka 1,2, Yuichi Inoue 1,2, Hiroto Takahashi 2, Akihiko Ishijima 1,2 (1 Grad. Sch. Life Sci., Tohoku Univ., 2 IMRAM, Tohoku Univ.))
    • Organizer
      第51回日本生物物理学会年会 (The 51st Annual Meeting of the BSJ)
    • Place of Presentation
      日本,京都府
    • Year and Date
      20130825-20130927
    • Invited
  • [Presentation] 細菌べん毛モーターとシグナル伝達分子CheYの結合を細胞内でイメージングする2013

    • Author(s)
      福岡 創, 佐川貴志, 井上裕一, 高橋泰人, 石島秋彦
    • Organizer
      大腸菌研究会
    • Place of Presentation
      日本,修善寺
    • Year and Date
      20130620-20130621
  • [Presentation] 単一バクテリア上の複数モーター回転の同時計 測による情報伝達機構の解明2013

    • Author(s)
      石島秋彦
    • Organizer
      第65回細胞生物学会大会
    • Place of Presentation
      日本,愛知
    • Year and Date
      20130619-21030621
    • Invited
  • [Presentation] Measurement for cell temperature of norepinephrine-stimulated brown adipocytes using bimetal cantileve2013

    • Author(s)
      Masaaki Sato, Masaya Toda, Naoki Inomata, Yuichi Inoue, Takahito Ono, Akihiko Ishijima
    • Organizer
      第65回 日本細胞生物学会大会
    • Place of Presentation
      日本,愛知
    • Year and Date
      20130619-20130621
    • Invited
  • [Presentation] 単一バクテリア上の複数モーター回転の同時計 測による情報伝達機構の解明2013

    • Author(s)
      石島 秋彦
    • Organizer
      日本顕微鏡学会第69回学術講演会
    • Place of Presentation
      日本,大阪
    • Year and Date
      20130520-20130522
    • Invited

URL: 

Published: 2015-05-28  

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