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2014 Fiscal Year Annual Research Report

プラス鎖RNAウイルスの複製におけるウイルスと宿主の攻防

Planned Research

Project AreaMolecular basis of host cell competency in virus infection
Project/Area Number 24115003
Research InstitutionNational Institute of Infectious Diseases

Principal Investigator

脇田 隆字  国立感染症研究所, ウイルス第二部, 部長 (40280789)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 竹安 邦夫  京都大学, 生命科学研究科, 教授 (40135695)
Project Period (FY) 2012-06-28 – 2017-03-31
Keywordsプラス鎖RNAウイルス / HCV / 宿主 / 原子間力顕微鏡
Outline of Annual Research Achievements

プラス鎖RNAウイルスは複製複合体を含む膜小胞を形成しその中で複製することが知られているが、そのメカニズムについては不明である。研究代表者脇田はHCVの複製の場である膜小胞(DMV)形成のメカニズムと、HCVRNA翻訳とHCVRNA合成の調整メカニズムについて検討した。NS4B結合膜タンパクとしてPREBを見出した。PREBはCOPIIを介した小胞体輸送に関与するタンパクである。レプリコン細胞内でPREBはNS4Bと結合し、さらに新規産生HCVRNAと共局在した。また、PREBはNS4Bと結合して界面活性剤不溶性分画(DRM)に移行する。HCV複製複合体はDRMに存在する。PREBはHCV複製複合体を含むDMV形成に重要な役割を果たしていると考えられた。竹安分担者は原子間力顕微鏡AFMの技術により各種感染体のゲノム構造と動態を“まるごと”みて明らかにし、感染体ゲノム構造とその発現場としての真核細胞クロマチン/核内構造との相互作用を明らかにすることを目的としている。C型肝炎ウイルスは1本鎖RNAをゲノムとしており、そのゲノムを可視化するために「1本鎖RNAを如何に基板(通常は劈開した雲母片)上に吸着させ」、さらに「1本鎖RNAの本来の高次構造を如何に保つか」といった技術的な課題を解決し、「9Kbの1本鎖HCV RNAの構造解析」を行った。1本鎖RNA (Poly(A)-RNA、18SrRNA、28SrRNA、9kb-HCV genome RNA)は分子内でワトソン・クリック型塩基対を形成し、多くの複雑なループ構造をとるため、RNAの全長を計測することはできない。一方、AFM解析で求めた体積は塩基長に比例することから、「体積測定がRNAを特定する」また「特定の分子内ループの存在はAFM画像から検出できる」ことが分かった。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

HCVNS4B結合膜タンパクとしてPREBを見出した。HCV感染に伴いin vitroおよびin vivoでPREB発現の増加を認めた。PREBはHCV複製複合体を含む膜小胞の形成・維持に重要な役割を果たしているものと考えられ、HCVの診断や治療の標的として期待できる。また、原子間力顕微鏡を用いた解析ではRNA分子の体積は塩基長に比例することから、「体積測定がRNAを特定する」また「特定の分子内ループの存在はAFM画像から検出できる」ことが分かった。

Strategy for Future Research Activity

HCV複製複合体を含む膜小胞の形成・維持機構について詳細に明らかにしていく。また、今後は感染体ゲノム-タンパク質複合体のナノメートルレベルの構造および感染体ゲノムの細胞内動態について領域内研究者と積極的に共同研究を進めたい。

  • Research Products

    (22 results)

All 2015 2014

All Journal Article (14 results) (of which Peer Reviewed: 13 results,  Open Access: 2 results,  Acknowledgement Compliant: 10 results) Presentation (8 results) (of which Invited: 2 results)

  • [Journal Article] miR-122 Stimulates Hepatitis C Virus RNA Synthesis by Altering the Balance of Viral RNAs Engaged in Replication versus Translation2015

    • Author(s)
      Masaki T, Arend KC, Li Y, Yamane D, McGivern DR, Kato T, Wakita T, Moorman NJ, Lemon SM
    • Journal Title

      Cell Host Microbe

      Volume: 17(2) Pages: 217-228

    • DOI

      10.1016/j.chom.2014.12.014.

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Targeting Cellular Squalene Synthase, an Enzyme Essential for Cholesterol Biosynthesis, Is a Potential Antiviral Strategy against Hepatitis C Virus2015

    • Author(s)
      Saito K, Shirasago Y, Suzuki T, Aizaki H, Hanada K, Wakita T, Nishijima M, Fukasawa M
    • Journal Title

      J Virol

      Volume: 89(4) Pages: 2220-32

    • DOI

      10.1128/JVI.03385-14.

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Transmembrane serine protease TMPRSS2 activates hepatitis C virus infection.2015

    • Author(s)
      Esumi M, Ishibashi M, Yamaguchi H, Nakajima S, Tai Y, Kikuta S, Sugitani M, Takayama T, Tahara M, Takeda M, Wakita T
    • Journal Title

      Hepatology

      Volume: 61(2) Pages: 438-47

    • DOI

      10.1002/hep.27426.

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Probing in vivo dynamics of mitochondria and cortical actin networks using high-speed atomic force/fluorescence microscopy.2015

    • Author(s)
      Yoshida A, Sakai N, Uekusa Y, Deguchi K, Gilmore JL, Kumeta M, Ito S, Takeyasu K
    • Journal Title

      Genes Cells

      Volume: 20(2) Pages: 85-94.

    • DOI

      10.1111/gtc.12204.

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Amphipathic α-Helices in Apolipoproteins Are Crucial to the Formation of Infectious Hepatitis C Virus Particles2014

    • Author(s)
      Fukuhara T, Wada M, Nakamura S, Ono C, Shiokawa M, Yamamoto S, Motomura T, Okamoto T, Okuzaki D, Yamamoto M, Saito I, Wakita T, Koike K, Matsuura Y
    • Journal Title

      PLoS Pathog

      Volume: 10(12) Pages: e1004534.

    • DOI

      10.1371/journal.ppat.1004534.

    • Peer Reviewed / Open Access / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Alternative endocytosis pathway for productive entry of hepatitis C virus.2014

    • Author(s)
      Matsuda M, Suzuki R, Kataoka C, Watashi K, Aizaki H, Kato N, Matsuura Y, Suzuki T, Wakita T
    • Journal Title

      J Gen Virol.

      Volume: 95(Pt 12) Pages: 2658-67

    • DOI

      10.1099/vir.0.068528-0.

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Development of hepatitis C virus genotype 3a cell culture system.2014

    • Author(s)
      Kim S, Date T, Yokokawa H, Kono T, Aizaki H, Maurel P, Gondeau C, Wakita T.
    • Journal Title

      Hepatology

      Volume: 60(6) Pages: 1838-50

    • DOI

      10.1002/hep.27197.

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Cyclophilin Inhibitors Reduce Phosphorylation of RNA-dependent Protein Kinase to Restore Expression of IFN-stimulated Genes in HCV-infected Cells.2014

    • Author(s)
      Daito T, Watashi K, Sluder A, Ohashi H, Nakajima S, Borroto-Esoda K, Fujita T, Wakita T.
    • Journal Title

      Gastroenterology

      Volume: 147(2) Pages: 463-72.

    • DOI

      10.1053/j.gastro.2014.04.035.

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Involvement of Hepatitis C Virus NS5A Hyperphosphorylation Mediated by Casein Kinase I-α in Infectious Virus Production.2014

    • Author(s)
      Masaki T, Matsunaga S, Takahashi H, Nakashima K, Kimura Y, Ito M, Matsuda M, Murayama A, Kato T, Hirano H, Endo Y, Lemon SM, Wakita T, Sawasaki T, Suzuki T
    • Journal Title

      J Virol

      Volume: 88(13) Pages: 7541-55.

    • DOI

      10.1128/JVI.03170-13.

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Novel permissive cell lines for complete propagation of hepatitis C virus.2014

    • Author(s)
      Shiokawa M, Fukuhara T, Ono C, Yamamoto S, Okamoto T, Watanabe N, Wakita T, Matsuura Y.
    • Journal Title

      J Virol.

      Volume: 88(10) Pages: 5578-94.

    • DOI

      10.1128/JVI.03839-13.

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Structural mechanism of nuclear transport mediated by importin β and flexible amphiphilic proteins.2014

    • Author(s)
      Yoshimura SH, Kumeta M, Takeyasu K.
    • Journal Title

      Structure

      Volume: 22(12) Pages: 1699-710

    • DOI

      10.1016/j.str.2014.10.009

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Direct analysis of Holliday junction resolving enzyme in a DNA origami nanostructure.2014

    • Author(s)
      Suzuki Y, Endo M, Canas C, Ayora S, Alonso JC, Sugiyama H, Takeyasu K.
    • Journal Title

      Nucleic Acids Res.

      Volume: 2(11) Pages: 7421-28

    • DOI

      10.1093/nar/gku320.

    • Peer Reviewed / Open Access / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Nanoimaging of ssRNA: Genome architecture of the Hepatitis C virus revealed by atomic force microscopy.2014

    • Author(s)
      Gilmore JL, Aizaki H, Yoshida A, Deguchi K, Kumeta M, Junghof J, Wakita T, Takeyasu K.
    • Journal Title

      J. Nanomed. Nanotechol.

      Volume: S5 Pages: 010.

    • Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Caprice/MISP is a novel F-actin bundling protein critical for actin-based cytoskeletal reorganizations.2014

    • Author(s)
      Kumeta M, Gilmore JL, Umeshima H, Ishikawa M, Kitajiri SI, Horigome T, Kengaku M, Takeyasu K.
    • Journal Title

      Genes Cells.

      Volume: 19(4) Pages: 338-49

    • DOI

      10.1111/gtc.12131.

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
  • [Presentation] Probing in vivo dynfamics of mitochondria and cortical actin networks using high-speed atomic force/fluorescence microscopy2014

    • Author(s)
      Takeyasu K, Yoshida A, Sakai N, Uekusa Y, Deguchi K, Gilmore JL, Kumeta M, Ito S.
    • Organizer
      The 2014 American Society for Cell Biology Annual Meeting
    • Place of Presentation
      Philadelphia, USA
    • Year and Date
      2014-12-07 – 2014-12-10
  • [Presentation] Prolactin regulatory element binding protein is involved in hepatitis C virus replication by interacting with NS4B2014

    • Author(s)
      Lingbao Kong、青柳春代、松田麻未、藤本陽、渡士幸一、鈴木亮介、山越智、堂前直、鈴木健裕、鈴木哲朗、脇田隆字、相崎英樹
    • Organizer
      第62回日本ウイルス学会学術集会
    • Place of Presentation
      横浜
    • Year and Date
      2014-11-10 – 2014-11-12
  • [Presentation] Regulation of viral lifecycle in hepatitis C virus infection.2014

    • Author(s)
      Wakita T, Kong L, Aizaki H
    • Organizer
      Dynamic interplay between viruses and their hosts,
    • Place of Presentation
      Yokohama
    • Year and Date
      2014-11-08 – 2014-11-09
    • Invited
  • [Presentation] Cell culture models of hepatitis C virus.2014

    • Author(s)
      Wakita T
    • Organizer
      21st International Symposium on Hepatitis C Virus and Related Viruses
    • Place of Presentation
      Banff (Canada)
    • Year and Date
      2014-09-07 – 2014-09-11
    • Invited
  • [Presentation] Maintenance of HCV infectivity by down-regulating hepatic lipase expression2014

    • Author(s)
      Fujimoto A, Aizaki H, Matsuda M, Watanabe N, Watashi K, Suzuki R, Suzuki T, Wakita T
    • Organizer
      21st International Symposium on Hepatitis C Virus and Related Viruses
    • Place of Presentation
      Banff (Canada)
    • Year and Date
      2014-09-07 – 2014-09-11
  • [Presentation] NS5A-associated membrane protein, embryonic lethal, abnormal vision, drosophila-like 1, regulates hepatitis C virus RNA synthesis and translation.2014

    • Author(s)
      Goto K, Fujimoto A, Watashi K, Suzuki R, Yamagoe S, Moriya K, Yotsuyanagi H, Koike K, Suzuki T, Wakita T, Aizaki H
    • Organizer
      21st International Symposium on Hepatitis C Virus and Related Viruses
    • Place of Presentation
      Banff (Canada)
    • Year and Date
      2014-09-07 – 2014-09-11
  • [Presentation] Construction of novel infectious genotype 2b culture system.2014

    • Author(s)
      Hmwe SS, Suda G, Sakamoto N, Imamura M, Hiraga N, Chayama K, Aizaki H, Wakita T.
    • Organizer
      Symposium on Hepatitis C Virus and Related Viruses
    • Place of Presentation
      Banff (Canada)
    • Year and Date
      2014-09-07 – 2014-09-11
  • [Presentation] グリチルリチンによる抗C型肝炎ウイルス作用 - phospholipase A2およびAutophagyによるHCV分泌過程の制御2014

    • Author(s)
      青柳東代、相崎英樹、松本喜弘、鈴木亮介、渡士幸一、市野瀬志津子、松浦知和、鈴木哲朗、和氣健二郎、脇田隆字
    • Organizer
      第50回日本肝臓学会総会
    • Place of Presentation
      東京
    • Year and Date
      2014-05-29 – 2014-05-30

URL: 

Published: 2016-06-01  

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