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2014 Fiscal Year Annual Research Report

動的秩序・崩壊のダイナミクスから観る高次機能発現の分子機構解明

Planned Research

Project AreaDynamical ordering of biomolecular systems for creation of integrated functions
Project/Area Number 25102004
Research InstitutionKyoto University

Principal Investigator

寺嶋 正秀  京都大学, 理学(系)研究科(研究院), 教授 (00188674)

Project Period (FY) 2013-06-28 – 2018-03-31
Keywords分子間相互作用 / 情報伝達 / 時間分解 / 拡散 / 熱力学
Outline of Annual Research Achievements

タンパク質の分間相互作用は、生体分子が生命活動を行う上で欠かせないものであり、信号伝達や酵素反応などで大きな役割を果たす。例えば、他の分子との分子間相互作用を変化させることで、ネットワークが形成され、それが信号伝達となって下流分子に情報が受け渡され、生理活性を生むように、作られては解離し、解離しては会合するような動的な秩序が本質的に重要である。こうしたシステムを解明するため、分子間相互作用を時間分解で検出する試みを行う。特に、過渡回折格子法をベースにして、新しい信号解析法の開発と、高感度化などを組み合わせて、タンパク質会合・解離過程を高時間分解能で検出する手法の開発を行う。本年度は、光センサータンパク質をモデルにして会合・解離反応の時間変化を分子レベルで明らかとした。具体的には、PixDと呼ばれる光センサータンパク質を用いて、その機能に関係する反応機構を分子間相互作用変化と関連付けて時間分解で検出することに成功した。特に、その10 量体と5 量体の動的平衡と光照射による会合変化の分子論的原因を時間分解熱力学法で調べ、揺らぎと会合状態変化との関連を明らかにした。またその他にも、YtvA と呼ばれる、光や温度・塩などの生体ストレスを感知し、転写因子σB の活性を制御するタンパク質の制御機構ネットワークを時間分解で調べ、光励起によって特徴的に分子間相互作用が変化することがわかった。これは後続反応解明への第一歩となる。また、オーレオクロムと呼ばれるタンパク質とDNAとの相互作用を時間分解で検出するための試みを行った。更に、ストップドフローシステムでフローする流量が少なくて済むセルを開発して、我々が開発してきた過渡回折格子測定装置の中に組み込む試みをした。このシステムの時間分解能を探り、大体1ミリ秒で拡散過程が検出できることがわかった。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

ストップドフローシステムの改良を行った。また、幾つかの光センサータンパク質において、タンパク質間相互作用を時間分解で観測することに成功し、揺らぎとの関係を明らかにした。特にフォトトロピンにおいてドメイン間相互作用とどのように関係しているか、その変化が如何にして次のネットワークに組み込まれていくかの詳細を明らかにすることに成功している。

Strategy for Future Research Activity

本年度に引き続いて、分子間相互作用の時間分解検出を行うシステム構築とタンパク質反応への適用を行う。特に計画の変更などはない。

  • Research Products

    (13 results)

All 2015 2014 Other

All Journal Article (3 results) (of which Peer Reviewed: 3 results,  Open Access: 1 results,  Acknowledgement Compliant: 2 results) Presentation (6 results) (of which Invited: 4 results) Book (2 results) Remarks (2 results)

  • [Journal Article] Pressure-sensitive reaction yield of the TePixD blue-light sensor protein2015

    • Author(s)
      K. Kuroi, K. Okajima, M. Ikeuchi, S. Tokutomi, T. Kamiyama, M. Terazima
    • Journal Title

      J. Phys. Chem. B

      Volume: 119 Pages: 2897-2907

    • DOI

      10.1021/jp511946u

    • Peer Reviewed / Open Access / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Transient conformational fluctuation of TePixD during a reaction2014

    • Author(s)
      K. Kuroi, K. Okajima, M. Ikeuchi, S. Tokutomi, M. Terazima
    • Journal Title

      Proc. Natl. Acad. Sci. USA

      Volume: 111 Pages: 14764-14769

    • DOI

      10.1073/pnas.1413222111

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Photo-Induced Oligomerization of Arabidopsis thaliana Phototropin 2 LOV12014

    • Author(s)
      Y. Nakasone, Y. Kawaguchi, S.G. Kong, M. Wada, M.Terazima
    • Journal Title

      J. Phys. Chem. B

      Volume: 118 Pages: 14314-14325

    • DOI

      10.1021/jp509448b

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
  • [Presentation] Sensing of Protein Reactions using pulsed laser based transient grating2014

    • Author(s)
      M. Terazima
    • Organizer
      Frontiers in Optics 2014 / Laser Science XXX (FiO/LS) meeting
    • Place of Presentation
      JW Marriott Tucson Star Pass, Tucson, USA
    • Year and Date
      2014-10-19 – 2014-10-23
    • Invited
  • [Presentation] Photosensing reaction dynamics of flavin proteins: Phototropin2014

    • Author(s)
      M. Terazima
    • Organizer
      16th International Conference on Retinal protein
    • Place of Presentation
      Nagahama Royal Hotel, Nagahama, Japan
    • Year and Date
      2014-10-05 – 2014-10-10
    • Invited
  • [Presentation] 青色光センサータンパク質PapBのシグナル伝達反応機構2014

    • Author(s)
      菊川 耕太郎、中曽根 祐介、増田 真二、寺嶋 正秀
    • Organizer
      分子科学討論会
    • Place of Presentation
      広島大学
    • Year and Date
      2014-09-21 – 2014-09-24
  • [Presentation] Conformation change of a flavoprotein for signal transfer: phototropins2014

    • Author(s)
      M. Terazima
    • Organizer
      18th International Flavin Symposium
    • Place of Presentation
      Regent Cha-Am Beach Resort, Hua Hin - Cha Am, Thailand
    • Year and Date
      2014-07-27 – 2014-08-01
    • Invited
  • [Presentation] Time resolved measurements of thermodynamic properties during chemical reactions of bio-molecules2014

    • Author(s)
      M. Terazima
    • Organizer
      THERMAM 2014
    • Place of Presentation
      Boyalik Beach Hotel, Cesme-Izmir, Turkey
    • Year and Date
      2014-06-12 – 2014-06-15
    • Invited
  • [Presentation] Importance of fluctuation for reactions of light sensors2014

    • Author(s)
      M. Terazima
    • Organizer
      Gordon Research Conference on: Photosensory Receptors & Signal Transduction
    • Place of Presentation
      Renaissance Tuscany Il Ciocco Resort, Lucca, Italy
    • Year and Date
      2014-04-06 – 2014-04-11
  • [Book] 「光と生命の事典」2015

    • Author(s)
      寺嶋 正秀 (分担執筆)
    • Total Pages
      印刷中
    • Publisher
      朝倉書店
  • [Book] 「光化学の事典」 光化学協会光化学の事典編集委員会 編2014

    • Author(s)
      寺嶋 正秀 (分担執筆)
    • Total Pages
      436
    • Publisher
      朝倉書店
  • [Remarks] 生体タンパク質反応の鍵となる「揺らぎ」検出に成功 -新規薬剤探索の新指針に期待-

    • URL

      http://www.kyoto-u.ac.jp/ja/research/research_results/2014/140930_1.html

  • [Remarks] 京都大学大学院理学研究科 光物理化学研究室 研究紹介

    • URL

      http://kuchem.kyoto-u.ac.jp/hikari/research.html

URL: 

Published: 2016-06-01  

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