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2014 Fiscal Year Annual Research Report

気相分光による水素結合系の構造多様性と水和ダイナミクスの解明

Planned Research

Project AreaScience on Function of Soft Molecular Systems by Cooperation of Theory and Experiment
Project/Area Number 25104008
Research InstitutionTokyo Institute of Technology

Principal Investigator

藤井 正明  東京工業大学, ソリューション研究機構, 教授 (60181319)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 宮崎 充彦  東京工業大学, 資源化学研究所, 助教 (00378598)
石内 俊一  東京工業大学, 資源化学研究所, 助教 (40338257)
石川 春樹  北里大学, 理学部, 教授 (80261551)
Project Period (FY) 2013-06-28 – 2018-03-31
Keywords分子分光 / レーザー分光 / 原子・分子物理 / 分子クラスター
Outline of Annual Research Achievements

種々のポリペプチドや有機ソフト系分子集合体などに気相分光の手法を適用するためには、それらを安定かつ極低温状態で真空中に取り出す必要がある。これまでレーザー脱離法と超音速ジェットを組み合わせた方法を用いてきたが、これは中性分子に適した方法であり、イオン種にはエレクトロスプレー法が適している。エレクトロスプレー法では室温のイオンが生成するため、イオンを真空中に導入した後、極低温に冷却する必要がある。そこで、昨年度、エレクトロスプレー法と冷却イオントラップを組み合わせた新規質量分析装置を設計した。本年度は、これを元に種々のイオン光学コンポーネントを製作し、既存装置と組み合わせて装置全体を立ち上げた。装置の最適化を行うために、これまでレーザー脱離・超音速ジェット法で中性状態を研究してきたアミノ酸やペプチドのプロトン付加体の紫外光解離スペクトルを測定し、それらの極低温状態の電子スペクトルの観測に成功した。
それと並行して、従来のレーザー脱離・超音速ジェット法を用いて、アドレナリン受容体タンパク質のアドレナリン結合部位の部分ペプチドのコンフォマーを選択した赤外スペクトルを測定し構造研究を行った。この部分ペプチドはもともとタンパク質のα-ヘリックス部に存在するが、気相中ではペプチドの末端を修飾しないとα-ヘリックス構造をとらないが、適切に修飾することで真空中でもα-ヘリックス構造をとることが明らかになった。構造解析には、測定した赤外スペクトルの理論解析が必要であるが、班友の八木らとともに行い、レプリカ交換分子動力学法、クラスター解析法及び非調和振動解析法を組み合わせることで、高精度に真空中のペプチドの構造帰属を行う方法を確立した。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

新規質量分析装置の立ち上げは途中で設計変更があったため、進捗の遅れが心配されたが、何とか年度内に立ち上げることができた。最適化した結果、非常に高い感度を有していることが分かった。今後種々の生体分子や有機ソフト系超分子などへの展開が期待される。なお、設計変更の結果、予定外の購入物品が発生したため、本来予定していた4重極質量分析器用のRF電源は次年度購入することにした。その代わりに、既存のRF電源を用いたが、これは高分子量には対応できないため次年度の新規電源の購入は不可欠であるが、装置の立ち上げには十分な性能を有しており、当初の目標達成には支障がなかった。
ペプチドの構造研究については、その理論解析が実験家の手にあまるところであり、共同研究を通して速やかに進展することができた。また、自前でペプチドを合成することができるため、研究の進捗に合わせて種々の化学修飾を速やかに行うことができ、末端の修飾次第で真空中でもα-ヘリックス構造を実現できることを見出すことができた。

Strategy for Future Research Activity

今年度立ち上げたエレクトロスプレー・冷却イオントラップ質量分析装置を用いて、種々のペプチドや有機ソフト系分子複合体の構造研究を行う。また、水分子を段階的に付加したクラスターを生成し、柔らかい分子の構造に対する水和効果を分子レベルで明らかにする。有機ソフト系分子についてはA03項目から供与を受け、また、理論解析についてはA01項目と共同研究を進める。
また、真空中の柔らかい分子に対して、レーザー光を照射し加熱することで、コンフォメーション変換が起こるかを検討する。これにより、レーザーによるコンフォメーション制御の可能性と、また柔らかさを決定づける遷移状態付近のポテンシャルに関する情報が得られることが期待される。

  • Research Products

    (18 results)

All 2015 2014

All Journal Article (9 results) (of which Peer Reviewed: 9 results,  Acknowledgement Compliant: 8 results,  Open Access: 3 results) Presentation (9 results) (of which Invited: 5 results)

  • [Journal Article] Stepwise Microhydration of Aromatic Amide Cations: Formation of Water Solvation Network Revealed by Infrared Spectra of Formanilide+-(H2O)n Clusters (n <= 5)2015

    • Author(s)
      Johanna Klyne, Matthias Schmies, Masaaki Fujii, Otto Dopfer
    • Journal Title

      J. Phys. Chem. B

      Volume: 119 Pages: 1388-1406

    • DOI

      10.1021/jp511421h

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Infrared Spectroscopy of the Dihydrogen-Bonded Phenol-Triethylsilane Cluster and its Cationic Analogues: Intrinsic Strength of the Si-H···H-O Dihydrogen Bond2015

    • Author(s)
      Haruki Ishikawa, Takayuki Kawasaki, Risa Inomata
    • Journal Title

      J. Phys. Chem. A

      Volume: 119 Pages: 601-609

    • DOI

      10.1021/jp5097508

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Theoretical Study on the Size Dependence of Excited State Proton Transfer in 1-Naphthol–Ammonia Clusters2015

    • Author(s)
      Toshihiko Shimizu, Shunpei Yoshikawa, Kenro Hashimoto, Mitsuhiko Miyazaki, Masaaki Fujii
    • Journal Title

      J. Phys. Chem. B

      Volume: 119 Pages: 2415-2424

    • DOI

      10.1021/jp507222n

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Mass Analyzed Threshold Ionization Detected Infrared Spectroscopy: Isomerization Activity of the Phenol–Ar Cluster near the Ionization Threshold2015

    • Author(s)
      Mitsuhiko Miyazaki, Shunpei Yoshikawa, François Michels, Kentaro Misawa, Shun-ichi Ishiuchi, Makoto Sakai, Otto Dopfer, Klaus Müller-Dethlefs, Masaaki Fujii
    • Journal Title

      Phys. Chem. Chem. Phys.

      Volume: 17 Pages: 2949-2503

    • DOI

      10.1039/C4CP04584J

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Solvation Dynamics of a Single Water Molecule Probed by Infrared Spectra - Theory Meets Experiment2014

    • Author(s)
      Matthias Wohlgemuth, Mitsuhiko Miyazaki, Martin Weiler, Makoto Sakai, Otto Dopfer, Masaaki Fujii, Roland Mitric
    • Journal Title

      Angew. Chem. Int. Ed.

      Volume: 53 Pages: 14601-14604

    • DOI

      10.1002/anie.201409047

    • Peer Reviewed / Open Access / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Microhydrated aromatic cluster cations: Binding motifs of 4-aminobenzonitrile–(H2O)n cluster cations with n ≤ 42014

    • Author(s)
      Matthias Schmies, Mitsuhiko Miyazaki, Masaaki Fujii, Otto Dopfer
    • Journal Title

      J. Chem. Phys.

      Volume: 141 Pages: 214301

    • DOI

      10.1063/1.4901893

    • Peer Reviewed / Open Access / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] UV-UV hole burning and IR dip spectroscopy of homophenylalanine by laser desorption supersonic jet technique2014

    • Author(s)
      Woon Yong Sohn, Shun-ichi Ishiuchi, Pierre Çarçabal, Hikari Oba, Masaaki Fujii
    • Journal Title

      Chem. Phys.

      Volume: 445 Pages: 21-30

    • DOI

      10.1016/j.chemphys.2014.10.012

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Microsolvation of the acetanilide cation (AA+) in a nonpolar solvent: IR spectra of AA+–Ln (L = He, Ar, N2; n ≤ 4)2014

    • Author(s)
      Matthias Schmies, Alexander Patzer, Markus Schütz, Mitsuhiko Miyazaki, Masaaki Fujii, Otto Dopfer
    • Journal Title

      Phys. Chem. Chem. Phys.

      Volume: 16 Pages: 7980-7995

    • DOI

      10.1039/C4CP00401A

    • Peer Reviewed / Open Access / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Fast Nonradiative Decay in o-Aminophenol2014

    • Author(s)
      Marcela C. Capello, Michel Broquier, Shun-Ichi Ishiuchi, Woon Y. Sohn, Masaaki Fujii, Claude Dedonder-Lardeux, Christophe Jouvet, Gustavo A. Pino
    • Journal Title

      J. Phys. Chem. A

      Volume: 118 Pages: 2056-2062

    • DOI

      10.1021/jp411457v

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
  • [Presentation] Laser desorption high-pressure supersonic jet spectroscopy of neurotransmission system2015

    • Author(s)
      Shun-ichi Ishiuchi
    • Organizer
      Korea-Japan Workshop on Spectroscopic Study on Molecular Structure and Dynamics
    • Place of Presentation
      Muju-gun, Jeonbuk, Korea
    • Year and Date
      2015-02-12
    • Invited
  • [Presentation] Infrared Spectroscopy of Si-H...H-O Type Dihydrogen-Bonded Clusters: Intrinsic Strength of the Si-H...H-O Dihydrogen Bond2015

    • Author(s)
      Haruki Ishikawa
    • Organizer
      Korea-Japan Collaboration Workshop on Spectroscopic Study on Molecular Structure and Dynamics
    • Place of Presentation
      Yokohama, Japan
    • Year and Date
      2015-01-29
    • Invited
  • [Presentation] Mid-infrared spectroscopy for ground and excited state proton transfer in phenol/naphthol-ammonia clusters2014

    • Author(s)
      Masaaki Fujii
    • Organizer
      248th ACS National Meeting & Exposition
    • Place of Presentation
      San Francisco, CA, USA
    • Year and Date
      2014-08-10
    • Invited
  • [Presentation] Conformational Reduction of Catecholamines Studied by Laser-Desorption Supersonic Jet Spectroscopy2014

    • Author(s)
      Masaaki Fujii
    • Organizer
      Conference on Isolated Biomolecules and Biomolecular Interactions (IBBI14)
    • Place of Presentation
      Porquerolles Island, France
    • Year and Date
      2014-05-21
    • Invited
  • [Presentation] Gas-phase spectroscopy of small peptides - conformation vs excited state dynamics2014

    • Author(s)
      Shun-ichi Ishiuchi, Sohn Woon Yong, and Masaaki Fujii
    • Organizer
      Conference on Isolated Biomolecules and Biomolecular Interactions (IBBI14)
    • Place of Presentation
      Porquerolles Island, France
    • Year and Date
      2014-05-21
  • [Presentation] Gas phase spectroscopy of adrenaline and its hydrated cluster by laser desorption supersonic jet technique2014

    • Author(s)
      Woon youg Sohn, Shun-ichi Ishiuchi, Masaaki Fujii
    • Organizer
      14th Symposium on Molecular Spectroscopy
    • Place of Presentation
      21KOMCEE Lecture Hall, The University of Tokyo, Tokyo
    • Year and Date
      2014-05-16 – 2014-05-17
    • Invited
  • [Presentation] Molecular flexibility of catecholamine neurotransmitters and relevant molecules studied by laser desorption supersonic jet spectroscopy2014

    • Author(s)
      Shun-ichi Ishiuchi, Taichi Warashina, Woon Yong Sohn, Masaaki Fujii
    • Organizer
      Gordon Research Conferences : Molecular & Ionic Clusters
    • Place of Presentation
      Lucca, Italy
    • Year and Date
      2014-04-27 – 2014-05-02
  • [Presentation] Direct observation of hydration structure relaxation - Ionization induced reorientation around 4-aminobenzonitrile/water by picosecond time resolved IR spectroscopy2014

    • Author(s)
      Mitsuhiko Miyazaki, Takashi Nakamura, Martin Weiler, Masaaki Fujii
    • Organizer
      Gordon Research Conferences : Molecular & Ionic Clusters
    • Place of Presentation
      Lucca, Italy
    • Year and Date
      2014-04-27 – 2014-05-02
  • [Presentation] Gas phase spectroscopic study of adrenaline and its hydrated cluster by laser desorption supersonic jet technic2014

    • Author(s)
      Woon youg Sohn, Shun-ichi Ishiuchi, Masaaki Fujii
    • Organizer
      Gordon Research Conferences : Molecular & Ionic Clusters
    • Place of Presentation
      Lucca, Italy
    • Year and Date
      2014-04-27 – 2014-05-02

URL: 

Published: 2016-06-01  

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