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2017 Fiscal Year Annual Research Report

Logics of pattern formation that supports cell fate determination and functional differentiation

Planned Research

Project AreaMultidimensional Exploration of Logics of Plant Development
Project/Area Number 25113007
Research InstitutionNara Institute of Science and Technology

Principal Investigator

中島 敬二  奈良先端科学技術大学院大学, バイオサイエンス研究科, 教授 (80273853)

Project Period (FY) 2013-06-28 – 2018-03-31
Keywords植物 / パターン形成 / 根冠 / 維管束 / ゼニゴケ / 生殖細胞
Outline of Annual Research Achievements

1.根冠細胞の運命決定と機能発現機構の解析:根冠は根の先端で重力感受や土壌環境との相互作用を担う重要な組織である。根冠を構成する細胞は内側の幹細胞層で作られた後に分化・成熟し、最外層に達すると自律的に剥離する。根冠細胞の動態とその制御をより詳細に解析するため、伸長中の根の先端を数日間にわたって連続的に観察できる水平光軸型顕微鏡システムを確立した。また根冠分化のマスター制御因子であるNAC転写因子について、ゲノムワイドなクロマチン免疫沈降解析と比較トランスクリプトーム解析を行い、標的遺伝子を探索した。候補遺伝子の発現や機能を解析した結果、従来解析していた細胞壁関連遺伝子に加え、感染防御や膜交通に関連する遺伝子群が、根冠の機能発現に機能していることが示唆された。
2.数理生物学と協働した根の放射パターン形成機構の解析:シロイヌナズナの根の維管束においては、維管束始原細胞が並層分裂を繰り返しながら、直線的な木部軸を構築する。我々はGATA転写因子が、直線的な木部軸の構築に機能する事を見出した。また、維管束の細胞増殖パターンの解析とそれを基にした力学シミュレーションにより、並層分裂によって生じる細胞間に働く機械的な力と木部軸の直線性の間に関係性を見出した。
3.ゼニゴケを用いた雌性分化と胞子体発生制御機構の解析:ゼニゴケは比較的大きな卵細胞を体表近くで形成し、かつ無性生殖でも繁殖できるため、卵細胞の形成機構を解明するための理想的なモデル植物である。我々は卵細胞分化の制御因子であるMpRKD遺伝子の変異体や野生型の造卵器のRNA-seqデータをもとに、卵の形成や機能に関与する遺伝子を探索した。遺伝学的な解析の結果、雌株特異的に発現するMYB転写因子やKNOX転写因子が、雌性の分化や受精後の胞子体発生に重要な機能を果たしていることを見出した。

Research Progress Status

29年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

29年度が最終年度であるため、記入しない。

  • Research Products

    (17 results)

All 2018 2017 Other

All Int'l Joint Research (2 results) Journal Article (4 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Peer Reviewed: 4 results,  Open Access: 2 results) Presentation (11 results) (of which Int'l Joint Research: 2 results,  Invited: 2 results)

  • [Int'l Joint Research] University of Cambridge(英国)

    • Country Name
      UNITED KINGDOM
    • Counterpart Institution
      University of Cambridge
  • [Int'l Joint Research] University of Warwick(英国)

    • Country Name
      UNITED KINGDOM
    • Counterpart Institution
      University of Warwick
  • [Journal Article] Be my baby: patterning toward plant germ cells2018

    • Author(s)
      Nakajima Keiji
    • Journal Title

      Curr. Opin. Plant Biol.

      Volume: 41 Pages: 110~115

    • DOI

      10.1016/j.pbi.2017.11.002

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Plant-inspired pipettes2018

    • Author(s)
      Nakamura Keigo、Hisanaga Tetsuya、Fujimoto Koichi、Nakajima Keiji、Wada Hirofumi
    • Journal Title

      J. R. Soc. Interface

      Volume: 15 Pages: 20170868

    • DOI

      10.1098/rsif.2017.0868

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Highly efficient heritable targeted deletions of gene clusters and non-coding regulatory regions in Arabidopsis using CRISPR/Cas92018

    • Author(s)
      Durr Julius、Papareddy Ranjith、Nakajima Keiji、Gutierrez-Marcos Jose
    • Journal Title

      Sci. Rep.

      Volume: 8 Pages: 4443

    • DOI

      10.1038/s41598-018-22667-1

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Functionally Diversified Members of the MIR165/6 Gene Family Regulate Ovule Morphogenesis in Arabidopsis thaliana2018

    • Author(s)
      Hashimoto Kayo、Miyashima Shunsuke、Sato-Nara Kumi、Yamada Toshihiro、Nakajima Keiji
    • Journal Title

      Plant Cell Physiol.

      Volume: 59 Pages: 1017-1026

    • DOI

      10.1093/pcp/pcy042

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] 長時間連続観察によるシロイヌナズナ根冠細胞の周期的な剥離様式の解析2018

    • Author(s)
      郷達明、上野皓輝、宮島俊介、中島敬二
    • Organizer
      第59回日本植物生理学会年会
  • [Presentation] Maternally expressed MpKNOX1 is required for sporophyte development in Marchantia polymorpha2018

    • Author(s)
      久永哲也、藤本翔大、中島敬二
    • Organizer
      第59回日本植物生理学会年会
  • [Presentation] A regulatory mechanism triggering localized cell proliferation in Arabidopsis root vascular tissue2018

    • Author(s)
      Miyashima Shunsuke、Pawel Roszak、Koichi Toyokura、Motohiro Fujiwara、Ttsuo Kakimoto、Koichi Fujimoto、Keiji Nakajima、Yka Helariutta
    • Organizer
      第59回日本植物生理学会年会
  • [Presentation] 根端分裂組織における細胞分裂秩序を解明するための新規アプローチ2018

    • Author(s)
      射水勝利、宮島俊介、郷達明、中島敬二
    • Organizer
      第59回日本植物生理学会年会
  • [Presentation] Interplay between transcriptional and post-transcriptional regulatory modules in the pattern formation of Arabidopsis embryos2017

    • Author(s)
      宮島俊介、内村聡克、本田美波、橋本佳世、中島敬二
    • Organizer
      Annual Meeting of the Japanese Society of Developmental Biologists
    • Invited
  • [Presentation] 長時間連続観察による根冠細胞の剥離様式の解析2017

    • Author(s)
      郷達明、宮島俊介、上野皓輝、中島敬二
    • Organizer
      日本植物学会第81回大会
  • [Presentation] 維管束篩要素の細胞分化におけるオルガネラ・リロケーション機構2017

    • Author(s)
      古田かおり、宮島俊介、Belevich Ilya、Helariutta Yka、Jokitalo Eija、中島敬二
    • Organizer
      日本植物学会第81回大会
  • [Presentation] MpFGMYBはゼニゴケの雌性分化を制御する2017

    • Author(s)
      久永哲也、岡橋啓太郎、山岡尚平、西浜竜一、郷達明、河内孝之、中島敬二
    • Organizer
      日本植物学会第81回大会
  • [Presentation] ノンコーディングRNAを介したゼニゴケの性分化制御2017

    • Author(s)
      久永哲也、山岡尚平、西浜竜一、中島敬二、河内孝之
    • Organizer
      日本植物学会第81回大会
  • [Presentation] Mechanisms of root cap maturation and cell detachment in Arabidopsis2017

    • Author(s)
      Tatsuaki Goh、Koki Ueno、Masako Kamiya、Shunsuke Miyashima、Keiji Nakajima
    • Organizer
      Bilateral Closure Symposium of GDRI Integrative Plant Biology Network Program
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] A MYB Transcription Factor Controls Female Sexual Differentiation in Marchantia polymorpha2017

    • Author(s)
      Tetsuya Hisanaga, Keitaro Okahashi, Shohei Yamaoka, Ryuichi Nishihama, Tatsuaki Goh, Takayuki Kohchi and Keiji Nakajima
    • Organizer
      65th NIBB Conference "Renaissance of Marchantia polymorpha ‐the genome and beyond‐"
    • Int'l Joint Research / Invited

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Published: 2018-12-17   Modified: 2022-03-29  

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