RNA機能構造の新視点

1996 Fiscal Year Annual Research Report

• Project/Area Number: 04272103
• Research Institution: University of Tokyo
• Principal Investigator: 横山 茂之 東京大学, 大学院・理学系研究科, 教授 (00159229)
• Co-Investigator(Kenkyū-buntansha): 河合 剛太 東京大学, 大学院・工学系研究科, 講師 (70211860) ; 岡田 典弘 東京工業大学, 生命理工学部, 教授 (60132982) ; 武藤 あきら 弘前大学, 理学部, 教授 (80034635) ; 渡辺 公綱 東京大学, 大学院・工学系研究科, 教授 (00134502) ; 志村 令郎 生物分子工学研究所, 所長 (60025426)
• Keywords: RNA / 機能構造 / スプライシング / リボザイム / リボソーム / tRNA / NMR / X線結晶構造解析

Research Abstract

本年度は,これまで4年間の研究成果をとりまとめ,9月24日の第6回公開シンポジウムにおいて広く公表した.また,4年間の班員の成果をまとめた最終報告書を作成した.また,本重点領域研究と関係の深いシンポジウムが8月27日の日本分子生物学会大会中に行われ,これにおいても研究成果が公表された.
第6回公開シンポジウムでは,第1項目「RNA機能の発現機構」の研究成果として,オルタナティブ・スプライシングの制御に関与するRNA結合タンパク質,精密なtRNA分子識別を行うクラスIアミノアシルtRNA合成酵素,および特異な二次構造を持つ動物ミトコンドリアtRNAについての立体構造解析の結果が示された.また,グループIイントロンRNAの活性化,リボソームRNAの機能あるいはタンパク質によるtRNAの分子擬態についての研究成果も報告された.第2項目「RNA新機能の探索」については,新規に発見された低分子量RNAによるTrans-translationの機構,リボソームRNAにおける2つのドメイン間のcommunication機構,あるいはミトコンドリアtRNAによるショウジョウバエの生殖細胞形成機構についての研究成果が発表された.また,第3項目「RNAの起源と進化」については,アミノアシルtRNA合成酵素の起源と進化のメカニズム,およびウイルス由来のリボザイムやミトコンドリアtRNA遺伝子変異によるミトコンドリア病についての研究成果が発表された.

Research Products

• [Publications] Sekine,S.: "Major Identity Determinants in the“Augmented D Helix"of tRNA Glu from Escherichia coli." J.Mol.Biol.256. 685-700 (1996)
• [Publications] Watanabe,S.: "An RNA Fragment Consisting of the P7 and P9.0 Stems and the 3′-Terminal Guanosine of the Tetrahymena Group I Intron" Nucleic Acids Res.24. 1337-1344 (1996)
• [Publications] Sakamoto,K.: "NMR Studies of the Effects of the 5′-Phosphate Group on Conformational Properties of 5-Methy laminomethyluridine Found in the First Position of the Anticodon of Escherichia coli tRNA4Arg" Biochemistry. 35. 6533-6538 (1996)
• [Publications] Seio,K.: "Chemical Synthesis and Conformational Properties of a New Cyclouridylic Acid Having an Ethylene Bridge between the Uracil 5-Position and 5′-Phosphate Group" J.Org.Chem.61. 1500-1504 (1996)
• [Publications] Suzuki,T.: "A New Method for Identifying the Amino Acid Attached to a Particular RNA in the Cell" FEBS Letters. 381. 195-198 (1996)
• [Publications] Ohtsuki,T.: "Preparation of Biologically Active Ascaris suum Mitochondrial tRNAMet with a TV-Replacement Loop by Ligation of Chemically Synthesized RNA Fragments" Nucleic Acids Res.24. 662-667 (1996)
• [Publications] Ushida,C.: "RNase of Mycoplasma capricolum" Mol.Biol.Report. (in press).
• [Publications] Takasaki,N.: "Characterization of Species-Specifically Amplified SINEs in Three Salmonid Species-Chum Salmon,Pink Salmon,and Kokanee:the Local Environment of the Genome may be Important for the Generation of a Dominant Source Gene at a Newly Retroposed Locus" J.Mol.Evol. (in press).
• [Publications] Murata,S.: "Details of Retropositional Genome Dynamics that Provide a Rationale for a Generic Dividion:the Distinct Branching of all the Pacific Salmon and Trout(Oncorhynchus)from the Atlantic Salmon and Trout(salmo)" Genetics. (in press).