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2005 Fiscal Year Annual Research Report

細菌べん毛の自己構築とスイッチ機構

Research Project

Project/Area Number 04F04171
Research InstitutionOsaka University

Principal Investigator

難波 啓一  大阪大学, 大学院・生命機能研究科, 教授

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) ROLAND DEGENKOLBE  大阪大学, 大学院・生命機能研究科, 外国人特別研究員
Keywords1分子計測(SMD) / 電子顕微鏡 / ナノバイオ / ナノマシン / 分子モーター
Research Abstract

細菌の運動器官であるべん毛は、20種類の蛋白質から構成される生体超分子で、回転モータである基部体、らせん繊維型プロペラとして働くフィラメント、そしてそれらを連結してユニバーサルジョイントとして働くフックと、おおまかに3つの部分からなる。
べん毛フィラメントはフラジェリンが非共有結合でらせん状に重合したチューブ構造で、極低温電子顕微鏡像の画像解析による構造解析法の長年にわたる工夫によってその原子モデルの構築に成功した(Yonekura et al., Nature 2003)。フックの構造については、その直線型構造の低温電子顕微鏡像解析による低分解能立体像と、サブユニット蛋白質FlgEのX線結晶構造解析法による原子モデルを組み合わせ、機能構造である曲がったフックの擬似原子モデルを構築し、それに基づく分子動力学シミュレーションにより、ドメイン間相互作用表面で一定数の水素結合やファンデアワールス接触点を保ちつつ結合相手を順次替えて相互滑りを起こし、各素繊維が約30%にもおよぶ伸縮をしてユニバーサルジョイント機能を実現することを明らかにした。(Samatey et al.Nature 2004)
Roland DEGENKOLBE研究員は、べん毛基部体の蛋白質であるFliMとFliN、そしてべん毛蛋白質輸送装置の基幹サブユニットFliIとFliHが形成する複合体について、電子顕微鏡とX線回折法を組み合わせた超分子立体構造解析手法によるその全体構造の解析をめざしている。この複合体はべん毛の自己構築過程で、輸送の効率化を計るための非常に大切な役割を果たしており、構造が解けて原子モデルが構築できれば、べん毛蛋白質輸送のしくみについて大きな手がかりが得られると予想され、大変楽しみな研究プロジェクトである。そこで、DEGENKOLBE研究員は、この複合体の構成蛋白質を共発現する大腸菌大量発現系を用いた蛋白質試料の調整法、精製法の工夫を行い、結晶化とX線結晶構造解析、そして電子顕微鏡による立体構造解析をめざした研究作業を着実に進めてきた。いくつかの条件で微小な結晶が結晶化ドロップに現れ、それを拾い上げて実験室のX線回折装置にかけて回折能を確認したが、まだ良好な回折像は得られていない。結晶化条件をさらに工夫することにより結晶をより大きく成長させ、高分解能の回折反射を観測できるよう日夜がんばっている。この種類の仕事はリスクが大きく、本来ならば、2年間のJSPS特別研究員の短い期間中に挑戦するのには多大な困難が予想されるが、DEGENKOLBE研究員はこの難しい問題に果敢に挑戦し、質の高い成果を上げようとしており、その姿勢は高く評価できる。

  • Research Products

    (11 results)

All 2006 2005

All Journal Article (10 results) Book (1 results)

  • [Journal Article] Electron cryomicroscopic visualization of PomA/B stator units of the sodium-driven flagellar motor in liposomes.2006

    • Author(s)
      Yonekura, K.et al.
    • Journal Title

      Journal of Molecular Biology (in press)

  • [Journal Article] FlhB regulates ordered export of flagellar components via autocleavage mechanism.2006

    • Author(s)
      Ferris, H.U.et al.
    • Journal Title

      Journal of Biological Chemistry 280

      Pages: 41236-41242

  • [Journal Article] Interactions between C ring proteins and export apparatus components : a possible promotion mechanism of flagellar type III protein export.2006

    • Author(s)
      Gonzalez-Pedrajo, B.et al.
    • Journal Title

      Molecular Microbiology (in press)

  • [Journal Article] A partial atomic structure for the flagellar hook of Salmonella typhimurium.2005

    • Author(s)
      Shaikh, T.R.et al.
    • Journal Title

      Proceedings of the National Academy of Sciences 102

      Pages: 1023-1028

  • [Journal Article] Position and orientation of phalloidinin F-actin determinedby X-ray fiber diffraction analysis.2005

    • Author(s)
      Oda, T.et al.
    • Journal Title

      Biophysical Journal 88

      Pages: 2727-2736

  • [Journal Article] Building the atomic model for the bacterial flagellar filament by electron cryomicroscopy and image analysis.2005

    • Author(s)
      Yonekura, K.et al.
    • Journal Title

      Structure 13

      Pages: 407-412

  • [Journal Article] Functionally important substructures of circadian clock protein KaiB in unique tetramer complex2005

    • Author(s)
      Iwase, R.et al.
    • Journal Title

      Journal of Biological Chemistry 280

      Pages: 43141-43149

  • [Journal Article] β-Helix is a likely core structure of yeast prion Sup35 amyloid fibers.2005

    • Author(s)
      Kishimoto, A.et al.
    • Journal Title

      SPring-8 Research Frontiers

      Pages: 28-29

  • [Journal Article] べん毛による細菌の泳ぎと方向転換の分子機構2005

    • Author(s)
      今田勝巳 他
    • Journal Title

      蛋白質 核酸 酵素 50

      Pages: 1328-1334

  • [Journal Article] 生体超分子のユニバーサルジョイント.In silicoで探る細菌べん毛フツクのメカニズム.2005

    • Author(s)
      北尾彰朗 他
    • Journal Title

      蛋白質 核酸 酵素 50

      Pages: 1335-1340

  • [Book] タンパク質科学(後藤祐児 他編)2005

    • Author(s)
      今田勝巳 他
    • Total Pages
      579
    • Publisher
      化学同人

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Published: 2007-04-02   Modified: 2016-04-21  

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