2005 Fiscal Year Annual Research Report
レース特異的なハクサイ根こぶ病抵抗性遺伝子の単離とその機能解明
Project/Area Number |
05F05641
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Research Institution | 独立行政法人農業・生物系特定産業技術研究機構 |
Principal Investigator |
松元 哲 独立行政法人農業・生物系特定産業技術研究機構, 野菜茶業研究所・機能解析部, 室長
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Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
TOMITA R.N. 独立行政法人農業・生物系特定産業技術研究機構, 野菜茶業研究所・機能解析部, 外国人特別研究員
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Keywords | アブラナ科 / ハクサイ / 根こぶ病 / 抵抗性遺伝子 / BACライブラリー / 遺伝子単離 |
Research Abstract |
根こぶ病はハクサイ、キャベツなどのアブラナ科植物にとって主要な土壌病害の一つであり、一端、圃場が汚染すると長期間にわたり休眠胞子が生存するため難防除の病害でもある。根こぶ病抵抗性遺伝子は複数の座にあることが知られており、高度な抵抗性をもつ品種の育成には複数の遺伝子を導入することが必要である。選抜に使用可能なDNAマーカーを効率よく開発するためには、抵抗性遺伝子を単離し、その構造と機能を解明することにより、同じ配列や発現の遺伝子が得ることが重要である。本研究では根こぶ病抵抗性遺伝子座乗領域を詳細化し、BACライブラリーからマップベースクローニングにより根こぶ病抵抗性の遺伝子の単離を試みる。本年度は2つの根こぶ病抵抗性遺伝子座Crr1とCrr2の各マーカーからBACクローンを単離し、座乗領域をカバーするようにこれらを整列化した。 1.根こぶ病抵抗性系統G004よりBAC(Bacterial Artificial Chromosome)ライブラリーを作製し、Crr1は連鎖マーカーであるBSA2、AT27、BSA7を、Crr2はBRMSO56、BSA4、BRMSO96を基点にしたスクリーニング・染色体ウォーキングを行い、当該ゲノム領域の物理地図を作製した。BSA2-AT27間0.1cMの領域は、1つのBACクローン(112.4Kb)でカバーされており、B.rapaにおける遺伝距離と物理距離は1cM=約1Mbと推測された。また、AT27-BSA7間0.5cMの領域は、6個のBACクローンでカバーされ、599.9Kbに相当すると推測された。またCrr2では、BRMSO56とBSA4の間、約1000kbの染色体ウォーキングにより、BACクローンを整列化した。構築した詳細連鎖地図を基に、BSA2-BSA7間0.6cMのゲノム領域のBAC contigを作製した。 2.BACクローンの末端塩基配列情報から新たなマーカーを作出し、1920個体からなるF2集団の解析からCrr1、Crr2の座乗位置をさらに詳細することを試みた。Crr1の座乗位置はBSA7と極めて近く、Crr2はBRMSO96を挟んで523A1Rと314B6Rであることが判明した。 3.詳細化をさらに進めるためにF2約3700個体からDNAを抽出し、Crr1とCrr2の連鎖マーカーで遺伝子型を決定し、各マーカー間で組換えが起こっているものを選抜した。Crr1連鎖マーカーBSA2とBZ2-DraI間で組換えが起きた個体数は116、Crr2連鎖マーカー523A1Rと314B6R間で31個体の組換え個体が得られた。
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