2006 Fiscal Year Annual Research Report
Project/Area Number |
05F05690
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Research Institution | National Institute for Agro-Environmental Sciences |
Principal Investigator |
岡部 郁子 独立行政法人農業環境技術研究所, 生物生態機能研究領域, 主任研究員
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Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
APPOLINAIRE ADANDONON 独立行政法人農業環境技術研究所, 生物生態機能研究領域, 外国人特別研究員
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Keywords | 白絹病菌 / Sclerotium rolfsii / Clostridium属 / DGGE法 |
Research Abstract |
土壌伝染性植物病害の一種である白絹病(病原菌:Sclerotium rolfsii)は発病圃場を湛水することで再発防止が可能であることが知られている。これは湛水条件下で優占的な土壌微生物の作用によってS.rolfsiiの菌核の発芽が抑制されるためであると推測されてきた。この土壌微生物が何であるかを解明することが本研究の目的である。 初年度は、希釈平板法によってS.rolfsii菌核から細菌を分離したところ、その大部分がPantoea属であったため、Pantoea属細菌と特異的に反応するオリゴヌクレオチドプローブを設計した。しかし、このプローブを用いた蛍光in situハイブリダイゼーション法によって菌核の表面の細菌を観察したところ、プローブと反応した細菌はごくわずかであった。 実際にS.rolfsii菌核上で優占的な細菌は、通常の希釈平板法では分離されない種類であると考えられたため、培養によらない方法で菌核上の細菌群集の解析を試みた。すなわち、菌核から抽出したDNAを細菌全般のリボソームDNA用プライマーで増幅し、変性剤濃度勾配ゲル電気泳動法(DGGE法)によって、それぞれの種の細菌の増幅産物を分離した。さらに、分離したリボソームDNA増幅産物の塩基配列を決定し、種を同定した。 その結果、S.rolfsii菌核上で優占的な細菌は主にClostridium属に属することが判明した。Clostridium属細菌は土壌還元消毒法(土壌に有機物を混和して湛水することによって、多くの土壌病原菌を死滅させる技術)において重要な役割を果たしていることが示唆されており、白絹病菌の不活化に関与している可能性が極めて高い。今後はClostridium属細菌のS.rolfsii菌核上での挙動を蛍光in situハイブリダイゼーション法によって追跡する予定である。
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Research Products
(1 results)