2007 Fiscal Year Annual Research Report
Project/Area Number |
05F05690
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Research Institution | National Institute for Agro-Environmental Sciences |
Principal Investigator |
吉田 隆延 National Institute for Agro-Environmental Sciences, 生物生態機能研究領域, 主任研究員
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Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
ADANDONON A. 独立行政法人農業環境技術研究所, 生物生態機能研究領域, 外国人特別研究員
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Keywords | 白絹病菌 / 土壌伝染性病原菌 / 湛水処理 / Pantoea agglomerans / DGGE / オリゴヌクレオチドプローブ |
Research Abstract |
白絹病菌Sclerotium rolfsiiは、土壌伝染性病原菌であり、防除には湛水処理が有効とされているがメカニズムは不明である。本研究では1.湛水処理の際に与える有機物が発病や菌核に付着する細菌相に与える影響、2.菌核に付着する細菌を特異的に検出するオリゴヌクレオチドプローブの作成、3.菌核に静菌的に作用する細菌の分類、4.細菌数の経時的変化を調べた。 1.有機物処理し30日間湛水した区でダイズ発病率と菌核の発芽率が最も低かったが、細菌数は最も多かった。湛水処理した菌核から分離培養した細菌の多くはErwinia herbicola(Pantoea agglomerans)であった。菌核からDNAを抽出し、細菌16SrDNA遺伝子のDGGE(denaturing gradient gel electrophoresis)解析を行った結果、有機物処理し30日間湛水処理した区の細菌数が多かった。また、DGGEバンドのシークエンス解析の結果、嫌気性細菌Clostoridiaceaeが主要なグループであった。湛水処理した菌核からClostoridiaceaeが検出されたのは初めての知見である。 2.土壌懸濁液中で菌核表面に増殖するP.agglomeransのオリゴヌクレオチドプローブを作成した(Nakanishi et al.2006)。本プローブはFISH(fluorescence in situ hybridization)による菌核表面からの本菌の検出に有効である。 3.白絹病菌菌核由来の培養細菌には、白絹病菌の生育を阻害する細菌はなかった。 4.湛水処理した圃場に菌核を埋設し菌核表面の微生物相をPCR-DGGE法により解析した。前年イナワラ処理した区の多様性は前年フスマ処理区、無処理区に比較して高かった。またバンドのシークエンス解析から、これらの細菌はClostoridiaceaeに属した。
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Research Products
(1 results)