2007 Fiscal Year Annual Research Report
Project/Area Number |
06F06436
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Research Institution | The University of Tokyo |
Principal Investigator |
西田 睦 The University of Tokyo, 海洋研究所, 教授
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Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
KHAN Nurul Huda 東京大学, 海洋研究所, 外国人特別研究員
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Keywords | 緑膿菌 / 海洋 / 分離 / 系統解析 / MLST |
Research Abstract |
本研究の目的は、いくつかのハウスキーピング遺伝子解析を通じて洋性の緑膿菌の系統的位置づけを解明するとともに、近縁種を併せた解析により、海洋性のPseudomonasの起源あるいは海洋への侵入プロセスを明らかにすることである。これまで保持していた株の数が十分でなかったため、まず学術研究船、淡青丸に乗船し沿岸海域および外洋域から新たにPseudomonasを分離した。また、比較のために、東京近郊の河川、池などでサンプリングを行い、新たな株を得た。これらについて、生理性情に基づいて簡易同定を行った後、16S rDNAの塩基配列に基づいて同定を行った。緑膿菌に加え、近縁種である、Pseudomonas putida, Pseudomonas fluorescens等が同定された。緑膿菌のみならず、これらの近縁種を含めて、acsA, aroE, guaA, mutL, nuoD, ppsA and trpEなどの遺伝子の塩基配列を求めた。である。海洋および陸あるいは淡水の株を含めて解析することにより、海洋性の緑膿菌および近縁種の起源について考察した。結果は現在解析中であるが、以下のことが分かった。第一に、海洋性の緑膿菌はいくつかのクレードに別れており、異なる群集が順次海に入った可能性がある。一方、Pseudomonas putidaはその海洋株が比較的単系統の傾向を示すことから、海洋への入り方は共通していない。現在、近縁株を統合的に解析するために解析を続けている。
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Research Products
(1 results)