1997 Fiscal Year Annual Research Report

蛍光新技術を用いた蛋白-蛋白および蛋白-DNA相互作用の動的解析

Research Project

Project/Area Number	09044238
Research Category	Grant-in-Aid for international Scientific Research
Section	Joint Research .
Research Institution	National Institute of Genetics
Principal Investigator	嶋本信雄国立遺伝学研究所, 構造遺伝学研究センター, 教授 (20127658)
Co-Investigator(Kenkyū-buntansha)	HAYWARD Rich 英国エジンバラ大学, 細胞分子生物学研究所, 教授 CHATTERJI Di インド細胞分子生物学研究センター, 教授永井宏樹国立遺伝学研究所, 構造遺伝学研究センター, 助手 (80222173)
Keywords	RNA polymerase / sigma subyunit / protein footprinting / omega subyunit / GroE / Esherichia coli / trascription initiation
Research Abstract	蛍光を含む生物物理的手法で、大腸菌RNAポリメラーゼの転写開始を司るσ^<70>サブユニットの転写における機能を研究した。 1.他サブュニツトとの接触には、他細菌類と類似するσ^<70>の4つの領域が役割を持ち、相互作用部位の広い特異なタンパク質-タンパク質相互作用を持つことを、ヒドロキシルラジカルフットプリント法で明らかにした。 2.他細菌類には無いσ^<70>のNC領域にクラゲ蛍光タンパク質であるGFPを導入した活性のあるσ^<70>を作製した。 3.NC領域の機能を確認するために、これを欠失したσ^<70>(delNC)を作製し、その機能が、σ^<70>の溶解度を向上させ、オリゴマー形成を阻止することが明らかになつた。領域2と3にCys残基を一つ導入した変異体delNCを、4種作製し、細胞内での活性測定を行い、3種は完全にな活性、一種は50%程度を示した。この5種のdelNCを、in vitroで活性を測定すると、プロモーターに依存して活性が変化し、NC領域は、反応にも寄与していることが明らかになった。 4.レーザーフォトリシスに適したラジカル生成試薬を合成し、変異体delNCのCys残基を修飾し他サブユニツトやDNAとの相互作用を研究する準備を行った。 5.ωを欠くコア酵素は、σが結合せず活性はなく、GroELが強固に結合していることを発見した。今まで未知であったωの機能が、ポリメラーゼを活性型のコンフォーメーションに変換する機能を持つことを明らかにした。GroESとの相同性のある領域を発見、ωがGroELのATPase活性をGroESと同様に阻害することが判明、GroESの役割、GroELの放出、を担うことが示唆され、built-in shaperon analogueという新規のタンパク質であることが示唆された。

Research Products

(7 results)

All Other

All Publications (7 results)

[Publications] R.Sen, H.Nagai, V.J.Hernandez, N.Shimamoto: "Reduction in abortive transcription from the λPR promoter by mutations in region 3 of the σ70 subunit of E.coli RNA polymerase." J.Biol.Chem.273(in press). (1998)
[Publications] H.Nagai, N.Shimamoto: "Most conserved regions of the E. coli primary sigma factor are involved in interaction with RNA polymerase core enzyme." Gene.Cells.1998 (2(in press))
[Publications] T.Kubori, N.Shimamoto: "Physical interference between Esherichia coli RNA polymerase molecules transcribing in tandem enhances abortive synthesis and misincorporation." Nuc.Acids Res.25. 2640-2647 (1997)
[Publications] V.Gopa1, D.Chatterji.: "Mutations in the 1.1 sub‐domain of E.coli σ70 and disruption of its overa11 structure." Eur.J.Biochem.244. 613-618 (1997)
[Publications] K.Mukherjee, D.Chatteji.: "Studies on the 'ω '-subunit of E.coli RNA polymerase : Its role in recovery of denatured enzyme activity." Eur.J.Biochem.247. 884-889 (1997)
[Publications] S.Pahari, D.Chatterji.: "Interaction of bacteriophage T4 AsiA protein with E.coli σ70 and its variant." FEBS Letts. 411. 60-62 (1997)
[Publications] 嶋本伸雄、郷通子: "遺伝学の構造生物学" 共立出版, 196 (1998)

1997 Fiscal Year Annual Research Report

蛍光新技術を用いた蛋白-蛋白および蛋白-DNA相互作用の動的解析

Principal Investigator

嶋本 信雄 国立遺伝学研究所, 構造遺伝学研究センター, 教授 (20127658)

Research Products

[Publications] R.Sen, H.Nagai, V.J.Hernandez, N.Shimamoto: "Reduction in abortive transcription from the λPR promoter by mutations in region 3 of the σ70 subunit of E.coli RNA polymerase." J.Biol.Chem.273(in press). (1998)

[Publications] H.Nagai, N.Shimamoto: "Most conserved regions of the E. coli primary sigma factor are involved in interaction with RNA polymerase core enzyme." Gene.Cells.1998 (2(in press))

[Publications] T.Kubori, N.Shimamoto: "Physical interference between Esherichia coli RNA polymerase molecules transcribing in tandem enhances abortive synthesis and misincorporation." Nuc.Acids Res.25. 2640-2647 (1997)

[Publications] V.Gopa1, D.Chatterji.: "Mutations in the 1.1 sub‐domain of E.coli σ70 and disruption of its overa11 structure." Eur.J.Biochem.244. 613-618 (1997)

[Publications] K.Mukherjee, D.Chatteji.: "Studies on the 'ω '-subunit of E.coli RNA polymerase : Its role in recovery of denatured enzyme activity." Eur.J.Biochem.247. 884-889 (1997)

[Publications] S.Pahari, D.Chatterji.: "Interaction of bacteriophage T4 AsiA protein with E.coli σ70 and its variant." FEBS Letts. 411. 60-62 (1997)

[Publications] 嶋本 伸雄、郷 通子: "遺伝学の構造生物学" 共立出版, 196 (1998)

嶋本信雄国立遺伝学研究所, 構造遺伝学研究センター, 教授 (20127658)

[Publications] 嶋本伸雄、郷通子: "遺伝学の構造生物学" 共立出版, 196 (1998)