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2009 Fiscal Year Annual Research Report

デング菌由来エンベロープ糖タンパク質におけるエピトープ領域の新規解析法の開発

Research Project

Project/Area Number 09F09096
Research InstitutionTokyo University of Agriculture and Technology

Principal Investigator

黒田 裕  Tokyo University of Agriculture and Technology, 大学院・共生科学技術研究院, 准教授

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) ISLAM Monirul Mohammad  東京農工大学, 大学院・共生科学技術研究院, 外国人特別研究員
Keywords分子構造 / 分子認識 / 変異体解析 / 生物物理
Research Abstract

デング熱は、現在のところワクチンもないため東南アジアの広い地域で公衆衛生上の問題となっている。デングウイルスは、DEN1~4の4種類に大別され、それらのエピトープ領域とウイルス株に対する抗体の特異性を解明する事は重要な研究課題である。本計画では、抗体認識の特異性に直接関わる可能性が高いデングウイルスのエンベロープ糖タンパク質(以下、Eタンパク質)の第3ドメイン(以下、E3D)の構造解析が最近報告されたことに注目し、その変異体解析を行い、抗体認識機構(及び部位)を分子レベルで解明する。
平成21年度では、E3Dの大量発現系を構築した。そのため、合成DNAを用いてE3Dの塩基配列を作製し、研究室で所有するpET発現系、pAED発現系にその遺伝子を導入した。培地種類、発現温度などの発現条件を最適化し、培地1L当たり30mgの収量で精製できる条件を求めた。組換えE3Dタンパク質は、通常の精製法(ニッケルレジン、HPLC)で、高純度に精製した。高純度に精製したE3Dの熱安定性や二次構造含量を、円二色性分光法で調べた結果、βシートとαヘリックスが含まれることを解明した。

  • Research Products

    (8 results)

All 2010 2009

All Journal Article (2 results) (of which Peer Reviewed: 2 results) Presentation (6 results)

  • [Journal Article] Thermodynamic and structural analysis of highly stabilizing single and double mutations in BPTI variants2009

    • Author(s)
      Mohammad Monirul Islam, Shihori Sohya, Keiichi Noguchi, Shunich i Kidokoro, Masafumi Yohda, Yuta ka Kuroda
    • Journal Title

      PROTEINS 77

      Pages: 962-970

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] 蛋白質の構造形成に必要な最小情報とは-単純化ウシ膵臓トリプシン阻害蛋白質変異体構造と熱力学-2009

    • Author(s)
      加藤淳、イスラム M モハマド、黒田裕
    • Journal Title

      蛋白質 核酸 酵素 54(5)

      Pages: 643-648

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] X-Ray Crystal Structures of Extensively Simplified BPTI Variants Deter mined Using the KEK Photon Factory Facility2010

    • Author(s)
      Mohammad Monirul Islam, Shihori Sohya, Keiichi Noguchi, Masafumi Yohda, Yutaka Kuroda
    • Organizer
      First Asia-Europe Physics Summit
    • Place of Presentation
      エポカルつくば(茨城県)
    • Year and Date
      2010-03-24
  • [Presentation] Further Simplification of the BPTI Sequence : Minimum Information for Specifying a Native Protein Structure2009

    • Author(s)
      Yutaka Kuroda, Mohammad Monirul Islam, Shihori Sohya, Keiichi No guchi, Masafumi Yohda
    • Organizer
      第2回日韓生体分子科学セミナー「実験とシミュレーション」
    • Place of Presentation
      名古屋大学(愛知県)
    • Year and Date
      2009-12-22
  • [Presentation] 超単純化BPTIに於ける揺らぎ~X線結晶構造解析を用いた分子レベルでの解明~(Molecular Fluctuations in Extensively Simplified BPTI Variants Examined by X-ray Crystallography)2009

    • Author(s)
      黒田裕、イスラム M モハマド
    • Organizer
      新学術領域研究「揺らぎと生体機能」第3回公開シンポジウム
    • Place of Presentation
      名古屋大学(愛知県)
    • Year and Date
      2009-12-20
  • [Presentation] 点変異によって13度熱安定化したBPTI変異体の構造及び熱安定性の解析2009

    • Author(s)
      イスラム M モハマド、惣谷志保里、野口恵一、城所俊一、養王田正文、黒田裕
    • Organizer
      第47回日本生物物理学会年会
    • Place of Presentation
      アクティとくしま(徳島県)
    • Year and Date
      2009-11-01
  • [Presentation] BPTI変異体の熱安定性とタンパク質間相互作用の共進化的視点からの解析シンポジウム2009

    • Author(s)
      黒田裕
    • Organizer
      第47回日本生物物理学会年会
    • Place of Presentation
      アクティとくしま(徳島県)
    • Year and Date
      2009-10-30
  • [Presentation] アミノ酸配列単純化法を用いたBPTI蛋白質の構造形成及び熱安定性の解析2009

    • Author(s)
      黒田裕、イスラム M モハマド
    • Organizer
      第82回日本生化学会年会
    • Place of Presentation
      神戸ポートアイランド(兵庫県)
    • Year and Date
      2009-10-24

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Published: 2011-06-16   Modified: 2016-04-21  

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