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2011 Fiscal Year Annual Research Report

デング由来エンベロープ糖タンパク質におけるエピトープ領域の新規解析法の開発

Research Project

Project/Area Number 09F09096
Research InstitutionTokyo University of Agriculture and Technology

Principal Investigator

黒田 裕  東京農工大学, 大学院・工学研究院, 准教授

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) ISLAM MonirulMohammad  東京農工大学, 大学院・工学研究院, 外国人特別研究員
Keywords分子構造 / 分子認識 / 変異体解析 / 生物物理
Research Abstract

現在のところワクチンもないデング熱は、東南アジアの広い地域で公衆衛生上の問題となっている。デングウイルスは、DEN1~4の4種類の型に大別され、それらのエピトープ領域とウイルス型に対する抗体の特異性を解明する事は重要な研究課題である。本計画では、抗体認識の特異性に直接関わる可能性が高いデングウイルスのエンベロープ糖タンパク質(以下、Eタンパク質)の第3ドメイン(以下、E3D;96残基)に注目し、その変異体解析を行い、抗体認識機構(及び部位)を分子レベルで解明する。
平成23年度では、デングウイルス3型及び4型由来のE3Dを、pET発現系を用いて大腸菌で発現し、通常の精製法(ニッケルレジン、HPLC)で、高純度に精製した(培地1L当たり30mgの収量)。高純度に精製した3型E3D及び4型E3DのX線結晶構造をそれぞれ、1.8Åと2.2Åの分解能で決定し、座標をPDBに仮登録した。さらに、3型E3D、4型E3Dに対するポリクロナル抗体を作製した。また、3型E3D及び4型E3Dの抗体認識部位の数残基を互いに入れ替えた変異体(Epitope Grafted Mutant; EGM)を8種類構築し、大量発現し、精製した。現在、EGM変異体とE3Dを型特異的に識別する抗体の相互作用をElisa法で解析中である。これらの相互作用解析の結果を上記の高分解能X線結晶構造と比較することで、抗体のウイルス型特異性の物理化学的な解明が期待される。

  • Research Products

    (7 results)

All 2012 2011

All Presentation (7 results)

  • [Presentation] Effects of short solubility controlling peptide tags on protein's solubility, thermodynamics, structure and function2012

    • Author(s)
      Mohammad M Islam, Yutaka Kuroda
    • Organizer
      Conference of the Bangladesh Society for Biochemistry and Molecular Biology
    • Place of Presentation
      University of Rajshahi (Rajshahi, Bangladesh)
    • Year and Date
      20120225-20120226
  • [Presentation] High resolution Crystal structure of Dengue 3 envelope protein domain III (ED3)2012

    • Author(s)
      Montasir Elahi, Mohammad M Islam, Keiichi Noguchi, Masafumi Yohda, Yutaka Kuroda
    • Organizer
      生物物理関東地区研究会
    • Place of Presentation
      東京農工大学(東京都)
    • Year and Date
      2012-03-05
  • [Presentation] Host Guest Analysis of Amino Acids contribution to Protein Solubility Using Short SET-Tags Fused to a Simplified BPTI2012

    • Author(s)
      Mohammad M.Islam, Yutaka Kuroda
    • Organizer
      揺らぎが機能を決める生命分子の科学第5回公開シンポジウム
    • Place of Presentation
      東大寺文化センター(奈良県)(招待講演)
    • Year and Date
      2012-01-07
  • [Presentation] Crystal structure of Dengue 3 envelope protein domain III2011

    • Author(s)
      Montasir Elahi, Mohammad Monirul Islam, Keiichi Noguchi, Masafumi Yohda, Yutaka Kuroda
    • Organizer
      第34回日本分子生物学会年会
    • Place of Presentation
      パシフィコ横浜(神奈川県)
    • Year and Date
      2011-12-14
  • [Presentation] 難結晶化タンパク質変異体に対するヘテロシーディング法2011

    • Author(s)
      小林慶、Mohammad Islam、野口恵一、養王田正文、黒田裕
    • Organizer
      第11回日本蛋白質科学会年会
    • Place of Presentation
      阪急エキスポパーク(大阪府)
    • Year and Date
      2011-06-07
  • [Presentation] Amino Acids Contribution to Polypeptides Solubility Analyzed Using Short Poly-Amino Acid Tags2011

    • Author(s)
      黒田裕、加藤淳、Mohammad Islam
    • Organizer
      第11回日本蛋白質科学会年会
    • Place of Presentation
      阪急エキスポパーク(大阪府)
    • Year and Date
      2011-06-07
  • [Presentation] Effects of short solubility controlling peptide tags on protein solubility, thermodynamics, structure and function2011

    • Author(s)
      Mohammad M Islam, Atsushi Kato, Shihori Sohya, Mohammed Khan, Keiichi Noguchi, Masafumi Yohda, Shun-ichi Kidokoro, Yutaka Kuroda
    • Organizer
      第11回日本蛋白質科学会年会
    • Place of Presentation
      阪急エキスポパーク(大阪府)
    • Year and Date
      2011-06-07

URL: 

Published: 2013-06-26  

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