ヒト・ゲノムの機能的ドメイン構成の解析ならびにFISHの技術開発

1998 Fiscal Year Annual Research Report

• Project/Area Number: 10168211
• Research Institution: Mie University
• Principal Investigator: 奥村 克純 三重大学, 生物資源学部, 助教授 (30177183)
• Keywords: FISH / Chromatin structure / SNRPN / Genomic imprinting / Gene mapping

Research Abstract

ヒト・ゲノム上に存在する何万もの遺伝子は、ゲノム上で均一に配置されているのではなく、それぞれの機能に応じてクラスターを形成するなど、機能的ドメインを形成し制御を受けていることは明らかである。本研究では、ゲノム全体をDNA複製やダイナミックなゲノムの伸縮構造に基づく機能的、構造的ドメインによる構成体として捉え、これらのドメイン構成を明らかにするとともに、細胞核内のゲノムの配置や挙動を解析することにより、ゲノムの構成を総合的に理解し、ゲノムの機能研究として、生命現象の基盤である遺伝子の精妙な機能発現の理解に資することを目標とした。まず、DNA複製前の核内のゲノムのパッケージング状態を、halo核標本に対してFISHを行うことにより解析し、インプリント遺伝子SNRPNでは発現している父親由来アレルがコンパクトにパッケージングされていることを示した。また、イントロンプローブやゲノムクローンをプローブとして核内RNAの検出を試み、インプリント遺伝子の単一アレルでの発現を確認した。この方法により、非同調的複製パターンを示すDiGeorge領域のクローンを検討したところ、biallelicに発現していることを確認した。さらに、複製鎖の蛍光検出と特定ゲノムに対するファイバーFISH法を組み合わせることで、複製部位を個々の細胞で確認する方法を開発した。本年度は特に、複製鎖やFISHが安定なシグナルを与える方法の改良を行い、両者の同時検出にも成功した。また、セントロメアへテロクロマチン領域の低アセチル化状態の維持機構として、別の場所で脱アセチル化されたヒストンが、セントロメア領域に輸送されるという機構が存在する可能性を提示した。さらに、各種遺伝子、トランスジーンのマッピング、ゲノムの整列化を行った。

Research Products

• [Publications] Chee-Gun Lee: "Molecular Analysis of the cDNA and Genomic DNA Encoding Mouse RNA Helicase A" Genomics. 47巻. 365-371 (1998)
• [Publications] Sachiko Kitanaka: "Inactivating Mutations in the 25-Hydroxyvitamin D3 1α-Hydroxylase gene in Patients with Pseudovitamin D-Deficiency Rickets" New England Journal of Medicine. 338巻. 653-661 (1998)
• [Publications] Katsuzumi Okumura: "Temporal Order of DNA Replication of Imprinted IGF2 Gene and Non-imprinted TNF and RFC5 Genes in Human Lymphocytes" Bulletin of the Faculty of Bioresources Mie University. 20号. 47-54 (1998)
• [Publications] Yasushi Taniguchi: "Nucleotide Sequence of the Ring3 Gene in the Class II Region of the Mouse MHC and Its Aundant Expression in Testicular Germ Cells" Genomics. 51巻. 114-123 (1998)
• [Publications] Toshihiko Eki: "Assignment of the Human Homologue of the Yeast Origin Recognition Complex Subunit ORC4 to Human Chromosome Band 2q22-q23 by in situ Hybridization and Somatic Cell Hybrid Analysis" Cytogenetics and Cell Genetics. 81巻. 89-90 (1998)
• [Publications] Noriyuki Yanaka: "Expression,Structure and Chromosomal Localization of the Human cGMP-binding cGMP-specific Phosphodiesterase Gene(PDE5A)" European Journal of Biochemistry. 25巻. 391-399 (1998)
• [Publications] Takashi Shiina: "Physical Mapping between the S and HLA-E Genes in the Human MHC Class I Region: Construction of a BAC,PAC and Cosmid Contig" Immunogenetics. 48巻. 402-407 (1998)
• [Publications] Katsuzumi Okumura: "Chromosomal Localization of Human DNA-binding Nuclear Protein(NP220)to 2p13.1-p13.2 by Fluorescence in situ Hybridization" Bioscience,Biotechnology and Biochemistry. 62巻. 1640-1642 (1998)
• [Publications] Shin Ogata: "Apoptosis Induced by Niacin-related Compounds in HL-60 Cells" Bioscience,Biotechnology and Biochemistry. 62巻. 2351-2356 (1998)
• [Publications] Takeshi Uchiumi: "Isolation of a Novel Human Canalicular Multispecific Organic Anion Transporter,cMOAT2/MRP3 and Its Expression in Cisplatin Resistant Cancer Cells with Decreased ATP-dependent Drug Transport" Biochemical Biophysical Research Communications. 252巻. 103-110 (1998)
• [Publications] Shin Ogata: "Effects of Poly(ADP-ribose)polymerase Inhibitors and NAD on the Apoptosis Induced by Actinomycin D in Human Leukemia Cells HL-60" Bulletin of the Faculty of Bioresources Mie University. (印刷中).
• [Publications] Masato Tsurudome: "Primary Structure of the Light Chain of FRP-1/CD98/4F2 Predicts a Protein with 11 Transmembrane Domains" Journal of Immunology. (印刷中).