2000 Fiscal Year Annual Research Report
凝集系エネルギー移動のにおける過渡的状態の非定常・非平衡ダイナミクスの理論
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12042236
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| Research Institution | Nagoya University |
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Principal Investigator |
長岡 正隆 名古屋大学, 大学院・人間情報学研究科, 助教授 (50201679)
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| Keywords | 化学反応分子動力学法 / 分子軌道法 / エネルギー移動 / 非平衡統計力学 / 分子温度 / 散逸過程 / 非平衡非定常状態 / 緩和過程 |
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| Research Abstract |
平成12年度は、平成11年度に展開した理論をさらに発展させると共に、開発したプログラムをより現実的なモデル溶液内化学反応系やタンパク質内反応系などを対象に適用した。
(1)化学反応分子動力学法による反応エネルギー移動解析:実験との比較検討が可能であるモデル凝集系化学反応系に対して、環境分子群の密度分布に平衡性を仮定して、化学反応分子動力学法を適用する。並行して本理論を数値的に実証するための汎用コンピュータ・プログラムの開発をUNIXコンピュータの支援の下に実行した。
(2)タンパク質内反応系におけるエネルギー移動の解明:研究目的欄に述べたように本特定領域研究の最終目標は、北川らにより明らかにされた生体分子内反応での非熱平衡分布の成立機構や、その非平衡性の時空構造を理論的にどう理解すべきかを解明することにある。本年度はこれらの現実問題を化学的普遍性を損なうことなく理論家の立場からアプローチした。年度最後には、生体エネルギー移動の過渡的状態における非定常非平衡過程に関して、その構造的側面と機能的側面の二面からまとめて以下の11に記載した学術誌に発表した。また最終的な報告を分子構造総合討論会(平成12年9月)、日本化学会春季年会(平成13年3月)、CSW2001(平成13年3月)において公表した。
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[Publications] Isao Okazaki, et al.: "On Vibrational Cooling upon Photodissociation of Carbonmonoxymyoglobin and its Microscopic Mechanism from the Viewpoint of Vibrational Modes of Heme"Chem.Phys.Lett.. (in press). (2001)
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[Publications] Yoichi Yamaguchi, et al.: "Theoretical Prediction of Proton Chemical Shift in Supercritical Water using Gas-phase Approximation"Chem.Phys.Lett.. (in press). (2001)
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[Publications] Toshiaki Matsubara, et al.: "Ab Initio MO Study of the Structures of N_2, NO and CO Molecules Coordinated to the Pd_n (n=1,2,5,25) Clusters as a Model of Pd(110) Surface"Chem.Phys.Lett.. (in press). (2001)
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[Publications] Naoto Okuyama-Yoshida, et al.: "Structure Optimization via Free Energy Gradient Methods : Application to Glycine Zwitterion in Aqueous Solution"J.Chem.Phys.. 113. 3519-3529 (2000)
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[Publications] Masataka Nagaoka, et al.: "Internal Temperature Concept for Fast Transient Dynamics of Chemical Species in Solution"Int.J.Quantum.Chem.. 80. 117-124 (2000)
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[Publications] Masataka Nagaoka: "Internal Heat Flux and Entropy Production Rate for Chemically Reacting System in Solution"Prog.Theor.Phys.Supplement. 138. 588-589 (2000)
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[Publications] Masataka Nagaoka, et al.: "Advances in Quantum Monte Carlo Method"World Scientific. (2001)
