2001 Fiscal Year Annual Research Report
新奇な転写活性化機構を構成するプロモーター上のステム・ループ構造
Project/Area Number |
12670148
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Research Institution | University of Occupational and Environmental Health |
Principal Investigator |
野本 実 産業医科大学, 医学部, 講師 (00164749)
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Keywords | ステム・ループ構造 / クロマチン構造 / マイクロコッカル・ヌクレアーゼ / Gal NAc T3遺伝子 / IL13受容体遺伝子 / 転写活性化 / 肝型ピルビン酸キナーゼ遺伝子 / 赤血球型ピルビン酸キナーゼ遺伝子 |
Research Abstract |
腺組織に特異的に発現する糖転移酵素Gal NAc T3の遺伝子プロモーター領域や抗癌剤(シスプラチン)耐性細胞で発現亢進するインターロイキン13受容体の遺伝子プロモーター領域は、ともにG・C richな配列であり、約60塩基からなるステム・ループ構造をin vivoで形成し、転写制御に重要な役割を果たしていることが示唆されている。 また、0.5Kbという極めて近接して配置されている赤血球型ピルビン酸キナーゼ遺伝子プロモーター領域と肝型ピルピン酸キナーゼ遺伝子プロモーター領域においても、両プロモーターの中間部にはin vivoでステム・ループ構造が形成されていることが、一本鎖状態にあるチミン塩基に対して反応性をもつ過マンガン酸カリウムを用いた解析から明らかになった。 ヌクレオソーム構造のリンカー部位を優先的に切断するマイクロコッカル・ヌクレアーゼを用いて、ステム・ループ構造領域の周辺のクロマチン構造をゲノム塩基配列レベルで解析した結果、上記のステム・ループ構造はクロマチン構造遮蔽素子として機能している可能性が浮上してきた。 これらのステム・ループ構造領域は、当初想定していた約60塩基の範囲にとどまらず、同様なステム・ループが林立している模様であり、ステム・ループ構造をとっている領域の厳密な絞り込みが急務である。さらに、そうした領域的な絞り込み作業に続き、クロマチン構造遮蔽素子としての機能検証を早急に進める必要があると考えている。
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Research Products
(6 results)
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[Publications] Minoru Nomoto et al.: "relations between clusters of oxidatively damaged nucleotides and active or open nucleosomes in the rat Nth 1 gene"Oncogene. 21(不明)(in press). (2002)
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[Publications] Gunnji Nagatani et al.: "Transcriptional activation of the human HMG1 gene in cisplatin-resistant human cancer cells"Cancer Research. 61(3). 1592-1597 (2001)
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[Publications] Ken Kato et al.: "Structure and functional analysis of the human STAT3 gene promoter : alteration of chromatin structure as a possible mechanism for the upregulation in cisplatin-resistant cells"Biochim. Biophys. Acta. 1493(1-2). 91-100 (2000)
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[Publications] Shinwa Yamada et al.: "Alcohlic Fatty Liver differentially induces a Neutrophil-chemokine and Hepatic Necrosis after Ischemia-reperfusion in rat"Hepatology. 32(2). 278-288 (2000)
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[Publications] Suni Lee et al.: "Expression and regulation of a gene encoding neutral recognition molecule NB-3 of the contactin/F3 subgroup in mouse brain"Gene. 245(2). 253-266 (2000)
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[Publications] Noritaka Adachi et al.: "Cell-cycle regulation of the DNA topoisomerase II α promoter is mediated by proximal CCAAT boxes : possible involvement of acetylation"Gene. 245(1). 49-57 (2000)