食道癌におけるresponderとnon-responderのDNAchipによる解析

2003 Fiscal Year Annual Research Report

• Project/Area Number: 12671242
• Research Institution: Yokohama City University
• Principal Investigator: 國崎 主税 横浜市立大学, 医学部附属病院, 講師 (70264611)
• Co-Investigator(Kenkyū-buntansha): 岡崎 康司 埼玉医科大学, ゲノム医学研究センター・ゲノム科学部門, 教授 (80280733) ; 林崎 良英 横浜市立大学, 理化学研究所・ゲノム科学総合研究センター, プロジェクト・ディレクター (70192705)
• Keywords: 担癌剤耐性 / cDNA microarray

Research Abstract

進行食道癌に対する放射線化学療法の有用性は広く認識されているが、その感受性規定遺伝子はまだ確定されていない。本研究では、放射線化学療法開始前に研究参加の同意を得た進行食道癌症例23例より上部消化管内視鏡下に食道癌部より生検標本を採取した。
OCT compoundに包埋保存後、新鮮凍結切片を作成し、Arcturus社製PixCell II LCM systemを使用し、Laser Capture Microdissectionの技術を用いて食道癌細胞のみを選択的に採取し、RNA抽出を行った。得られる癌細胞Total RNA量は非常に微量であるが、共同研究を行っている理化学研究所においてLinear amplificationを2回施行することで、現在ではmRNA量を解析に十分な量まで増幅させることができた。これら食道癌細胞から得られたmRNAを正常食道癌組織のmRNAを対照とし、ハイブリダイゼーションを行い、cDNA microarray(理化学研究所作成、ヒト20K chip)を用いて遺伝子発現を解析し、現在まで20例の解析を終了した。あと3例の解析も近々終了する予定である。
また放射線化学療法施行後の臨床的効果判定(画像診断、組織学的診断)と予後調査を合わせて行っている。今後cDNA microarrayによる遺伝子発現データと実際の放射線化学療法の臨床的効果判定結果との関連を解析ソフトを用いて統計学的解析を行い、放射線化学療法のresponder, non-responderに関与する遺伝子検索を進めていく予定である。