疑似戻し交配法によるニホンナシ連鎖地図の作製とQTL遺伝子座の推定

2000 Fiscal Year Annual Research Report

• Project/Area Number: 12760016
• Research Institution: Ibaraki University
• Principal Investigator: 井上 栄一 茨城大学, 遺伝子実験施設, 助手 (90292482)
• Keywords: ニホンナシ / RAPD / AFLP / 遺伝子マーカー / 果実形質 / 果皮色 / DNAマーカー / 枝変わり

Research Abstract

本年度は,ニホンナシの果皮色を制御する遺伝子と連鎖した遺伝子マーカーを開発するために以下のふたつの実験を行った.
(1)品種間交雑F_1分離集団におけるバルク化法を用いたRAPDマーカーの探索
交配家系内で果皮色について分離を示すニホンナシ′幸水′×′巾着′のF_1集団(系統7),及び′新高′×′筑水′のF_1集団(系統19)を供試した.各個体の幼葉から全DNAを抽出し,果皮色の表現型に基づいてバルク化した.それぞれのバルクDNAを鋳型として180種類の10塩基プライマー(オペロン社)を単独で用いてRAPD解析を行った結果,約818本のPCR断片が現れた.このうち3種類のプライマーが両系統の赤バルクに,5種類のプライマーが両系統の青バルクに共通して現れるRAPDを増幅した.なかでもOPH19で増幅される青色果に特異的な約425bpのRAPDマーカーの家系内での分布を調査したところ,組換え価は約7〜8%だった.このことから本マーカーは青色果個体の選抜用マーカーとして有望であると考えられた.
(2)果皮色形質に関する枝変わり系統と原品種とを識別可能なAFLPマーカーの探索
果皮色に関する突然変異系統である枝変わり品種を用いて,果皮色を制御する遺伝子を直接的に検出できるAFLPマーカーの作出を試みた.ニホンナシ果皮色枝変わり系統(6系統)とその原品種を供試した.合計10種類のプライマーセットについてAFLPパターンの解析を行った結果,合計774本の明瞭なAFLP断片が検出された.このうち枝変わり系統と原品種を識別できる断片が合計22本得られた.これらのうち複数の枝変わり系統を識別できるものが4種類存在した.なかでもACT-CAA プライマーセットで増幅され青系幸水(佐賀系),ゴールド二十世紀および青系新高(園試系)に共通して存在するひとつの断片は,青色果を選抜するためのマーカーとして利用できる可能性が示唆された.

Research Products

• [Publications] Inoue,E. et al.: "Development of DNA marker linked to fruit skin color in Japanese pear (Pyrus pyrifolia Nakai)"Proceedings of MAFF International Workshop on Genetic Resources Series. 8. 143-144 (2000)
• [Publications] 井上栄一 他(共著): "ニホンナシ果皮色形質に関する枝変わり系統を識別するAFLPマーカーの探索"園芸学会雑誌. 69(別2). 301 (2000)
• [Publications] 井上栄一 他(共著): "ニホンナシ果実形質を制御する遺伝子と連鎖した遺伝子マーカーの開発に関する研究"農林交流センターシポジウム要旨集(果樹ゲノム研究-今後の展望を考える). 33-34 (2000)