MLL遺伝子の融合遺伝子のRDA法とマイクロアレイを用いた標的遺伝子の単離と解析

2000 Fiscal Year Annual Research Report

• Project/Area Number: 12877123
• Research Institution: The University of Tokyo
• Principal Investigator: 林 泰秀 東京大学, 医学部・附属病院, 講師 (30238133)
• Co-Investigator(Kenkyū-buntansha): 小林 美由紀 東京大学, 医学部・附属病院, 講師 (60205391) ; 滝 智彦 東京大学, 医学部・附属病院, 助手 (50322053) ; 井田 孔明 東京大学, 医学部・附属病院, 助手 (60313128) ; 川口 裕之 東京大学, 医学部・附属病院, 助手 (00313130)
• Keywords: 急性リンパ性白血病 / 11q23転座 / MLL遺伝子 / gene chip / CBP遺伝子 / p300遺伝子 / 乳児白血病 / AF4遺伝子

Research Abstract

11q23転座型白血病は急性リンパ性白血病(ALL)では予後不良である。11q23領域の遺伝子がクローニングされ(MLL/ALL-1/HRX)、このMLL遺伝子を用いて、これまでにAF-5α遺伝子、CBP,p300,ABI-1,AF17q25,AF5q31遺伝子を単離し、今年度はさらに骨髄異形成症候群のt(10;11)(q22;q23)の10q22領域よりcDNA panhandle polymerare chain reaction法を用いて新規遺伝子がクローニングされた。この遺伝子はこれまでの相手遺伝子とは相同性がみられなかった。これらの遺伝子のfull sequenceを明らかにし、その性状を検討する。また同じ転座を持つ白血病細胞よりRNAを抽出してcDNAライブラリーを作成し、それぞれのキメラcDNAを作成し、ベクターに挿入してマウスの32Dcl3細胞へ強制発現させ、発現の前後の細胞からRNAを抽出してcDNAを作成し、発現する遺伝子の違いをAffymetrix社のGene Chipを用いて発現プロファイルの検討を行い、標的遺伝子を検索している。今年度はさらにこのマイクロアレイを用いて、t(4;11)-とt(11;19)-ALLの細胞株で発現プロファイルを検討した。これらの細胞株各3株よりRNAを抽出し、Gene Chipによる解析を行った。これらの株はほとんどがこれまでにALLに特異的と報告された遺伝子の発現がみられ、t(4;11)の1株のみは急性骨髄性白血病に特異的とされる遺伝子の発現もみられたが、mixed lineageの性状を有することが示唆された。またt(4;11)とt(11;19)で異なった発現プロファイリングを示す遺伝子もみられ、これらの遺伝子につき現在その詳細を検討している。

Research Products

• [Publications] Sugita K. et al.: "MLL-CBP fusion transcript in a therapy-related acute myeloid leukemia with the t(11;16)(q23;p13) which developed in an acute lymphoblastic leukemia patient with Fanconi anemia."Genes Chromosome Cancer. 27. 264-269 (2000)
• [Publications] Hayashi Y. et al.: "SN-1, a novel leukemic cell line with t(11;16)(q23;p13) : myeloid characteristics and resistance to Retinoids and Vitamin D3."Cancer Res. 60. 1139-1145 (2000)
• [Publications] Xu F. et al.: "Tandem duplication of the FLT3 gene is infrequent in infant acute leukemia."Leukemia. 14. 945-947 (2000)
• [Publications] Kojima S. et al.: "An effective chemotherapeutic regimen for acute myeloid leukemia and myelodysplastic syndrome in children Down's syndrome."Leukemia. 14. 786-791 (2000)
• [Publications] Tatsumi K. et al.: "The CDCREL1 gene fused to MLL in de novo acute myeloid leukemia with t(11;22)(q23;q11.2) and its frequent expression in myeloid leukemia cell lines."Genes Chromosomes Cancer. 30. 230-235 (2000)
• [Publications] Shibuya N. et al.: "t(10;11)-Acute Leukemias with MLL-AF10 and MLL-ABI1 Chimeric Trnascripts; Specific Expression Patterns of ABI1 Gene in Leukemia and Solid Tumor Cell Lines."Genes Chromosomes Cancer. (in press). (2000)